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Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000001522 (Gene tree)
Gene ID: 102204532
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22979 bases
Position: chrJH419207.1:3304022-3327000
Accession: 102204532
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000002006	IBN_N	PF03810.19	1.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000002049	-	5677	XM_005720174	ENSPNYP00000002006	891 (aa)	XP_005720231	UPI0003AFEAC4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	85.473	ENSPNYG00000013748	tnpo2	99	85.473
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	80.856	ENSPNYG00000001235	-	99	80.856

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.429	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	91.991	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.102	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000001522	tnpo1	87	98.710	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.710	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.429	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.429	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.429	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.429	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	97.980	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.980	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	89.177	ENSAPLG00000009619	-	97	90.252	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.154	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.154	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	60.244	ENSANAG00000027118	-	99	59.911	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	82.941	ENSANAG00000025351	-	99	82.941	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	ENSANAG00000022453	-	99	92.480	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.204	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.204	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	94.170	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.042	Bos_taurus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.593	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.593	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	92.890	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.890	Canis_familiaris
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	90.572	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.572	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.929	Capra_hircus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	89.052	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.706	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.480	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.929	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.480	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.929	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	94	80.833	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.833	Choloepus_hoffmanni
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	75.224	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.224	Ciona_savignyi
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.929	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.042	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	93.224	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.224	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.072	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.072	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.745	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.745	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.939	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.939	Danio_rerio
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	87.025	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.025	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	93	93.141	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.133	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	58.446	FBgn0035693	CG8219	99	57.995	Drosophila_melanogaster
ENSPNYG00000001522	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000001522	tnpo1	94	85.018	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.899	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.929	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.929	Equus_caballus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	88.017	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	Esox_lucius
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.929	Felis_catus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.490	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.490	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.593	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.593	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	97.082	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.082	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.833	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	Gadus_morhua
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.368	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.705	Gallus_gallus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.300	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.300	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.184	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.184	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.266	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.266	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	78.027	ENSGGOG00000022535	-	98	78.027	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.929	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	99.776	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	99.776	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	ENSHGLG00000000970	-	99	92.480	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000001522	tnpo1	97	72.474	ENSHGLG00100000963	-	99	71.893	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	92.532	ENSHGLG00100017090	-	99	92.532	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.042	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.521	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.521	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	92	93.040	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.205	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	86.760	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.760	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	94.164	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.164	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	97	92.272	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.272	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.929	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.817	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.897	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.929	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.929	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.429	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.429	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	99.551	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	99.551	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	89.338	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.338	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.042	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000001522	tnpo1	87	96.907	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	Mola_mola
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	93.617	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	97.082	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.082	Monopterus_albus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.042	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.154	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.817	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.929	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	92.558	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.558	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.154	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.154	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000001522	tnpo1	87	98.968	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.968	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.929	Nomascus_leucogenys
ENSPNYG00000001522	tnpo1	90	87.935	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.256	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.256	Octodon_degus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.997	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	98.997	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	92	93.666	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.666	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	86.814	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.814	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	87	96.762	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.762	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	96.959	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.959	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	97.297	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.297	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	96.847	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.847	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.929	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.042	Ovis_aries
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.929	Pan_paniscus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.929	Panthera_pardus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.929	Panthera_tigris_altaica
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.929	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000001522	tnpo1	94	82.044	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.929	Papio_anubis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	90.460	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.460	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.378	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.378	Pelodiscus_sinensis
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	94.395	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.834	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	93.224	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.224	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.939	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.939	Phascolarctos_cinereus
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.865	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.865	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.865	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.865	Poecilia_latipinna
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