EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000004291 (Gene tree)
Gene ID: 102197788
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17656 bases
Position: chrJH419207.1:837595-855250
Accession: 102197788
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000005697	ResIII	PF04851.15	2.7e-07	1	1
ENSPNYP00000005673	ResIII	PF04851.15	3.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000005844	-	4089	-	ENSPNYP00000005697	1362 (aa)	-	-
ENSPNYT00000005817	-	7145	XM_005720053	ENSPNYP00000005673	1401 (aa)	XP_005720110	UPI0003AFAB62

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNYG00000004291	sbno1	73	63.532	ENSPNYG00000019926	si:ch73-63e15.2	64	63.532

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.879	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.865	Homo_sapiens
ENSPNYG00000004291	sbno1	84	93.805	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.148	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.753	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.738	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.281	ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.422	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.116	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.767	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.045	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	91.696	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.827	ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.253	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	76.340	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.479	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	74.728	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.341	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.577	ENSANAG00000029958	-	99	75.828	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	96.769	ENSACLG00000024913	sbno1	100	96.769	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	80.199	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	80.837	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	75.840	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.966	Bos_taurus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.843	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.828	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.806	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	78.147	Canis_familiaris
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	81.047	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	81.047	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.154	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.154	Capra_hircus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.581	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.812	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	76.787	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.574	Cavia_aperea
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.574	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.574	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	71.629	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	72.022	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.282	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	83.213	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.574	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.574	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000004291	sbno1	84	81.732	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.724	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000004291	sbno1	96	73.934	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	74.190	Choloepus_hoffmanni
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	75.527	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	74.788	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	72.593	ENSCANG00000042688	-	99	72.355	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	96	82.079	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000004291	sbno1	96	82.079	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.415	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	88.557	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.908	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.552	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	81.166	ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.379	Danio_rerio
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	77.333	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	77.333	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.863	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.957	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000004291	sbno1	93	71.429	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000004291	sbno1	75	61.567	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	61.696	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000004291	sbno1	52	73.140	ENSEASG00005012595	-	92	73.789	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.913	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.509	Equus_caballus
ENSPNYG00000004291	sbno1	83	77.049	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	81.161	ENSELUG00000002886	sbno1	99	81.883	Esox_lucius
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.913	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.899	Felis_catus
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	76.197	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.479	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.797	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.357	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.908	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.552	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000004291	sbno1	94	84.048	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.650	Gadus_morhua
ENSPNYG00000004291	sbno1	88	76.032	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.653	Gallus_gallus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	90.263	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.837	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000004291	sbno1	94	88.872	ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.023	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	74.946	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	74.580	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.394	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.394	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.670	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	89.670	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	84.124	ENSHGLG00000014165	-	99	75.336	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000004291	sbno1	92	91.765	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	90.698	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	80.298	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	80.894	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.574	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.574	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	79.820	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.820	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.400	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	91.589	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.716	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	90.284	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	71.620	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.145	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	80.282	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.141	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.211	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.458	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.357	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.357	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.357	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.357	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.394	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.394	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.400	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	91.116	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	76.344	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.494	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000004291	sbno1	51	73.249	ENSMAUG00000004834	-	99	74.052	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.657	ENSMICG00000006573	-	99	74.560	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	82.437	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.437	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	83.097	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	83.736	Mola_mola
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.281	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.634	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.051	ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.122	Monopterus_albus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.794	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.351	Mus_caroli
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	76.059	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.351	Mus_musculus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.847	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.351	Mus_pahari
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.972	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.351	Mus_spretus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.913	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.899	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.599	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.388	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000004291	sbno1	92	84.180	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.180	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	94.076	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	94.076	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	72.996	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.271	Nomascus_leucogenys
ENSPNYG00000004291	sbno1	63	70.440	ENSMEUG00000008768	-	91	75.540	Notamacropus_eugenii
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	74.947	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.088	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.755	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.755	Octodon_degus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	99.073	ENSONIG00000015348	sbno1	100	99.073	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	73.895	ENSOCUG00000002441	SBNO1	96	73.803	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.281	ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.139	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.344	ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.273	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.486	ENSORLG00015002726	sbno1	100	88.415	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	88.754	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	88.746	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000004291	sbno1	51	72.028	ENSOGAG00000010781	-	99	74.601	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	75.700	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.826	Ovis_aries
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.394	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.394	Pan_paniscus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.913	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.899	Panthera_pardus
ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.862	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.847	Panthera_tigris_altaica
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.394	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.394	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	83.394	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.394	Papio_anubis
ENSPNYG00000004291	sbno1	100	79.096	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.223	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000004291	sbno1	98	75.329	ENSPSIG00000009572	-	99	74.585	Pelodiscus_sinensis
ENSPNYG00000004291	sbno1	92	71.927	ENSPSIG00000009256	-	99	71.908	Pelodiscus_sinensis
ENSPNYG00000004291	sbno1	95	82.616	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.616	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.844	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.773	Poecilia_reticulata
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ENSPNYG00000004291	sbno1	89	69.669	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	69.323	Procavia_capensis
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