EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000004293 (Gene tree)
Gene ID: 102212529
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 795 bases
Position: chrAFNX01065091.1:790-1584
Accession: 102212529
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000005539	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000005682	-	795	XM_005755878	ENSPNYP00000005539	264 (aa)	XP_005755935	-

Gene Model

Click here to download ENSPNYG00000004293's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPNYG00000004293's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.806	ENSG00000152464	RPP38	99	48.256	Homo_sapiens
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.853	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.266	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.000	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.336	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	80.150	ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.397	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	68.881	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	67.254	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	72.388	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.536	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	74.721	ENSATEG00000000731	rpp38	97	71.264	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000004293	rpp38	90	42.023	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	41.634	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	99.242	ENSACLG00000016958	rpp38	100	99.242	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	98.485	ENSACLG00000016962	rpp38	100	98.485	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	45.703	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.922	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.259	ENSBTAG00000007702	RPP38	74	47.945	Bos_taurus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.364	ENSCAFG00000024373	RPP38	74	49.289	Canis_familiaris
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.364	ENSCAFG00020008008	RPP38	74	49.289	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.727	ENSCHIG00000012484	RPP38	74	47.945	Capra_hircus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.406	ENSCPOG00000003981	RPP38	73	49.545	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.245	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.173	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000004293	rpp38	94	41.971	ENSCSAG00000019055	RPP38	94	41.786	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.245	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	42.545	Choloepus_hoffmanni
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.652	ENSCGRG00001001395	Rpp38	72	50.244	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.652	ENSCGRG00000017441	Rpp38	72	50.244	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	67.568	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.795	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	61.765	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.029	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	51.136	ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.382	Danio_rerio
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.116	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	41.241	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.446	ENSDORG00000009783	Rpp38	93	41.636	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.544	ENSETEG00000002839	RPP38	72	47.087	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	43.686	ENSEASG00005019783	RPP38	73	47.706	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	39.510	ENSEEUG00000014677	RPP38	94	39.286	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	55.017	ENSELUG00000010160	rpp38	96	54.325	Esox_lucius
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.500	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	41.241	Felis_catus
ENSPNYG00000004293	rpp38	90	44.788	ENSFALG00000014804	RPP38	88	42.636	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.816	ENSFDAG00000018669	RPP38	73	48.611	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	64.621	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.580	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000004293	rpp38	91	42.912	ENSGALG00000008794	RPP38	86	41.762	Gallus_gallus
ENSPNYG00000004293	rpp38	59	81.132	ENSGACG00000009258	rpp38	99	81.132	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	98.106	ENSHBUG00000010937	rpp38	100	98.106	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.160	ENSHGLG00000012144	RPP38	73	48.341	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	50.198	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.876	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.456	ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.926	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.214	ENSJJAG00000007523	Rpp38	94	42.029	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000004293	rpp38	91	68.093	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.482	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	71.168	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.698	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	44.014	ENSLACG00000006502	RPP38	69	50.481	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	46.643	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	47.601	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.086	ENSLAFG00000000509	RPP38	73	46.190	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000004293	rpp38	94	41.606	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	41.429	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	75.573	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	75.294	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	99.621	ENSMZEG00005003189	rpp38	100	99.621	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	99.242	ENSMZEG00005003200	rpp38	100	99.242	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000004293	rpp38	91	43.678	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	42.146	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.223	ENSMAUG00000003644	Rpp38	72	49.268	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.516	ENSMOCG00000007020	Rpp38	72	47.826	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	67.164	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	66.923	Mola_mola
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	41.111	ENSMODG00000024091	RPP38	94	41.481	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000004293	rpp38	98	73.801	ENSMALG00000002356	rpp38	96	73.208	Monopterus_albus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.525	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.382	Mus_caroli
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.165	ENSMUSG00000049950	Rpp38	94	43.015	Mus_musculus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.043	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.382	Mus_pahari
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.971	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	Mus_spretus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.565	ENSMPUG00000018523	RPP38	74	48.815	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000004293	rpp38	75	49.048	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	42.336	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	46.099	ENSNGAG00000011066	Rpp38	94	44.364	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	98.099	ENSNBRG00000006994	rpp38	100	98.099	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	95.669	ENSONIG00000020467	rpp38	95	95.276	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000004293	rpp38	94	41.852	ENSOCUG00000024367	-	94	42.379	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000004293	rpp38	94	41.481	ENSOCUG00000022768	-	94	42.007	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	70.566	ENSORLG00000009219	rpp38	95	68.561	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.925	ENSORLG00020011503	rpp38	92	69.057	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.173	ENSORLG00015017702	rpp38	92	68.302	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000004293	rpp38	89	68.675	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	67.790	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.319	ENSOGAG00000008059	RPP38	72	48.826	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.034	ENSOARG00000004534	RPP38	94	41.071	Ovis_aries
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.525	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	43.728	Pan_paniscus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.214	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	42.029	Panthera_pardus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.857	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.667	Panthera_tigris_altaica
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.525	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	43.223	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000004293	rpp38	93	47.893	ENSPKIG00000025652	rpp38	91	47.909	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000004293	rpp38	92	39.850	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	39.080	Pelodiscus_sinensis
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	43.116	ENSPEMG00000008375	Rpp38	94	42.804	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.727	ENSPCIG00000009096	RPP38	89	44.649	Phascolarctos_cinereus
ENSPNYG00000004293	rpp38	75	63.725	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	64.433	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	60.638	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	61.397	Poecilia_latipinna
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	55.263	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	55.639	Poecilia_mexicana
ENSPNYG00000004293	rpp38	93	63.774	ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.314	Poecilia_reticulata
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.652	ENSPPYG00000002113	RPP38	94	42.701	Pongo_abelii
ENSPNYG00000004293	rpp38	94	43.066	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	42.349	Pteropus_vampyrus
ENSPNYG00000004293	rpp38	90	46.667	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	46.094	Pygocentrus_nattereri
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	45.865	ENSRNOG00000038025	Rpp38	94	45.802	Rattus_norvegicus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	40.727	ENSSHAG00000015529	RPP38	94	42.593	Sarcophilus_harrisii
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	73.152	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.281	Scophthalmus_maximus
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	76.654	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	75.875	Seriola_dumerili
ENSPNYG00000004293	rpp38	95	76.834	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	75.676	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.132	ENSSARG00000012099	RPP38	69	44.000	Sorex_araneus
ENSPNYG00000004293	rpp38	92	45.318	ENSSPUG00000018363	-	67	50.761	Sphenodon_punctatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	92	41.573	ENSSPUG00000008560	-	66	46.701	Sphenodon_punctatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	92	45.318	ENSSPUG00000005237	-	67	51.269	Sphenodon_punctatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	96	70.270	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	68.093	Stegastes_partitus
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	40.893	ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.907	Sus_scrofa
ENSPNYG00000004293	rpp38	90	43.846	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	42.366	Taeniopygia_guttata
ENSPNYG00000004293	rpp38	100	66.421	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	66.923	Tetraodon_nigroviridis
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.844	ENSTTRG00000004420	RPP38	94	40.357	Tursiops_truncatus
ENSPNYG00000004293	rpp38	99	43.972	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	43.066	Ursus_americanus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.765	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	43.772	Ursus_maritimus
ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.000	ENSVVUG00000005272	RPP38	74	48.815	Vulpes_vulpes
ENSPNYG00000004293	rpp38	89	40.711	ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.711	Xenopus_tropicalis