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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000004379 (Gene tree)
Gene ID: 102208776
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: RNA-binding protein Musashi homolog 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24006 bases
Position: chrJH419247.1:2128375-2152380
Accession: 102208776
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000005652	RRM_1	PF00076.22	1.8e-33	1	2
ENSPNYP00000005652	RRM_1	PF00076.22	1.8e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000005796	MSI1-201	3630	XM_005731290	ENSPNYP00000005652	351 (aa)	XP_005731347	UPI000329C0FA

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNYG00000004379	MSI1	54	46.561	ENSPNYG00000000303	hnrnpaba	82	38.516
ENSPNYG00000004379	MSI1	50	41.243	ENSPNYG00000017019	hnrnpa1b	72	40.541
ENSPNYG00000004379	MSI1	50	39.205	ENSPNYG00000020763	-	90	40.314
ENSPNYG00000004379	MSI1	54	44.211	ENSPNYG00000013003	-	84	37.455
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	69.231	ENSPNYG00000018393	msi2a	100	69.231
ENSPNYG00000004379	MSI1	57	44.000	ENSPNYG00000004884	hnrnpd	77	39.921
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.593	ENSPNYG00000002529	-	100	92.593
ENSPNYG00000004379	MSI1	52	34.973	ENSPNYG00000020729	-	93	34.973
ENSPNYG00000004379	MSI1	51	40.000	ENSPNYG00000008424	hnrnpa3	82	37.949

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSG00000135097	MSI1	100	83.242	Homo_sapiens
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.877	ENSAPOG00000023458	-	100	92.877	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	98.006	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	63.780	ENSAMEG00000013302	MSI1	83	89.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000004379	MSI1	93	88.073	ENSACIG00000017754	-	72	99.505	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	98.006	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	98.006	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	83.587	ENSAOCG00000009031	-	95	83.587	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	98.006	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	98.006	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.877	ENSAPEG00000006857	-	84	92.877	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	88.515	ENSATEG00000017059	MSI1	100	88.515	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	89.859	ENSATEG00000023779	-	100	89.859	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	84.254	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000004379	MSI1	82	83.333	ENSANAG00000027901	-	88	83.333	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.242	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	100.000	ENSACLG00000011230	MSI1	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.593	ENSACLG00000000117	-	100	93.598	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	89.969	ENSAMXG00000038960	msi1	76	89.969	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	85.337	Bos_taurus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.242	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	82.967	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	82.967	Canis_familiaris
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.209	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.209	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	81.843	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.843	Capra_hircus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.709	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.348	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	85.348	Cavia_aperea
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.380	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.380	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.242	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.380	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.380	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000004379	MSI1	78	81.720	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	86.686	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	86.686	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.756	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.756	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.802	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	83.841	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	83.841	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	90.883	ENSCSEG00000008352	-	100	90.883	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	97.436	ENSCSEG00000005834	-	100	97.436	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.877	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	92.877	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	51	72.388	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	72.388	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	76	79.358	ENSCVAG00000017463	-	89	79.358	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	79	90.741	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	90.741	Danio_rerio
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.397	ENSDARG00000010710	msi1	100	92.991	Danio_rerio
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	81.646	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	81.646	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.132	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	81.402	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.402	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.242	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.242	Equus_caballus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	86.533	ENSELUG00000023219	MSI1	92	86.533	Esox_lucius
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	87.195	ENSELUG00000023280	-	100	86.890	Esox_lucius
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	Felis_catus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	89.000	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.451	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	93.162	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	93.162	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	97.436	ENSFHEG00000003560	-	100	97.436	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	85.393	ENSGMOG00000017838	-	100	85.393	Gadus_morhua
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	90.313	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.028	Gadus_morhua
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	89.695	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.318	Gallus_gallus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	70.621	ENSGAFG00000005860	-	100	70.621	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	96.657	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	96.657	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	87.328	ENSGACG00000008674	-	100	87.328	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	91.168	ENSGACG00000012679	MSI1	100	91.168	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	86.402	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	86.402	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.032	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.032	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.593	ENSHBUG00000011841	-	100	92.593	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	100.000	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	82.967	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	82.967	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.451	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000004379	MSI1	90	94.921	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	94.921	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	87.606	ENSHCOG00000012067	-	100	87.606	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	88.604	ENSIPUG00000001976	msi1	100	88.604	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.209	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.242	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	70.604	ENSJJAG00000010643	-	100	70.442	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	90.854	ENSKMAG00000019877	-	100	90.854	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.308	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	92.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	93.162	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	93.162	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	98.575	ENSLBEG00000001375	-	100	98.575	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.302	ENSLACG00000018287	MSI1	100	84.302	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000004379	MSI1	52	76.786	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	76.786	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	90	75.831	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	75.831	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.380	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.380	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.380	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	84.483	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.242	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.756	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	91.738	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.738	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	97.151	ENSMAMG00000018426	-	100	97.151	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.593	ENSMZEG00005000340	-	100	92.593	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	100.000	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000004379	MSI1	63	93.491	ENSMGAG00000016518	-	100	93.491	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000004379	MSI1	69	88.017	ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	83.242	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.242	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	82.967	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	85.470	ENSMMOG00000012265	-	100	85.470	Mola_mola
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	81.763	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	81.763	Mola_mola
ENSPNYG00000004379	MSI1	90	58.735	ENSMODG00000003189	-	100	58.735	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	96.951	ENSMALG00000001426	-	100	96.951	Monopterus_albus
ENSPNYG00000004379	MSI1	100	92.593	ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.593	Monopterus_albus
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ENSPNYG00000004379	MSI1	100	82.692	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	82.692	Mus_spretus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	85.209	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.209	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	75.893	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	75.893	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000004379	MSI1	94	84.802	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	Nannospalax_galili
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