EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000005571 (Gene tree)
Gene ID: 102207045
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8060 bases
Position: chrJH419262.1:2577495-2585554
Accession: 102207045
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000007263	PRP38	PF03371.15	3.1e-62	1	1

Transcripts

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSG00000134748	PRPF38A	71	86.425	Homo_sapiens
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	86.425	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	93.528	ENSACIG00000012292	prpf38a	72	93.665	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	97.087	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	97.087	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	97.087	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	97.087	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000005571	prpf38a	72	93.665	ENSATEG00000004608	prpf38a	72	93.665	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	79	77.016	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.831	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	87.330	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	86.425	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	56.230	ENSANAG00000029204	-	70	55.111	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	100.000	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	84.345	ENSAMXG00000029274	prpf38a	71	93.665	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	86.425	Bos_taurus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	63	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	86.425	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	86.425	Canis_familiaris
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	86.425	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	86.425	Capra_hircus
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSTSYG00000009868	-	71	86.425	Carlito_syrichta
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	93	53.287	ENSCATG00000044190	-	57	55.319	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	86.425	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.511	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	86.878	Chrysemys_picta_bellii
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCGRG00001018502	-	71	86.425	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000005571	prpf38a	84	69.732	ENSCGRG00001002557	-	74	72.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	86.425	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000005571	prpf38a	72	93.694	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	93.694	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000005571	prpf38a	72	94.118	ENSCVAG00000012305	prpf38a	72	94.118	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	83.387	ENSDARG00000039213	prpf38a	71	91.855	Danio_rerio
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	86.425	Dasypus_novemcinctus
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	84	72.624	ENSDORG00000025371	-	75	78.899	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000005571	prpf38a	77	79.498	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	86.425	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	86.425	Equus_caballus
ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	94.822	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	94.822	Esox_lucius
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	81.350	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	86.425	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000005571	prpf38a	90	82.437	ENSFHEG00000014317	prpf38a	75	93.665	Fundulus_heteroclitus
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	81.150	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.783	Gallus_gallus
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.511	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	86.878	Gopherus_agassizii
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	72.669	ENSHGLG00100003928	-	71	74.208	Heterocephalus_glaber_male
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ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	80.192	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	86.425	Ictidomys_tridecemlineatus
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