EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000007473 (Gene tree)
Gene ID: 102201232
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC102201232
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4317 bases
Position: chrJH419251.1:433129-437445
Accession: 102201232
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000009840	Isy1	PF06246.12	3.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000010077	-	1015	XM_005732205	ENSPNYP00000009840	286 (aa)	XP_005732262	UPI0003AF38B4

Gene Model

Click here to download ENSPNYG00000007473's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPNYG00000007473's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	65.287	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	97	65.033	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	71.329	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	71.119	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	60.627	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	96	60.215	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	63.607	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	97	63.300	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	63.636	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	98	63.230	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	98.951	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	98.951	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	50.519	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	97	50.534	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	56.803	ENSCSEG00000007482	-	97	57.292	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	56.090	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	97	56.106	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	51.408	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	97	50.719	Danio_rerio
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	50.158	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	97	49.511	Esox_lucius
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	57.643	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	97	57.516	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	75	67.373	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	67.373	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	98.601	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	98.601	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	49.833	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	97	49.828	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	63.057	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	97	63.072	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	97	54.704	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	96	56.446	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	39.803	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	84	45.299	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	48.973	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	97	48.772	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	64.873	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.495	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	98.951	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	98.951	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.441	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	96	58.845	Mola_mola
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	63.226	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.072	Monopterus_albus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	97	82.310	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	96	82.310	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	97	93.502	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	93.502	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	56.352	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.040	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	57.333	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.045	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	56.352	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.040	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	56.250	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	98	56.376	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	46.127	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	97	45.848	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	51.736	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	96	51.786	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	60.127	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.935	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.810	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.609	Poecilia_latipinna
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.810	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.609	Poecilia_mexicana
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.091	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	96	58.845	Poecilia_reticulata
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	49.826	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	97	49.643	Pygocentrus_nattereri
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	99	45.151	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	97	44.521	Scleropages_formosus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	96	63.000	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	96	63.366	Scophthalmus_maximus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	66.352	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	65.696	Seriola_dumerili
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	65.831	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.161	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	66.879	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	97	66.885	Stegastes_partitus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.524	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	59.790	Takifugu_rubripes
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	57.692	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	96	57.401	Xiphophorus_couchianus
ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	60.635	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	97	60.458	Xiphophorus_maculatus