EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000007879 (Gene tree)
Gene ID: 102205843
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 63834 bases
Position: chrJH419207.1:7821875-7885708
Accession: 102205843
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000010430	MIF4G	PF02854.19	1e-25	1	1
ENSPNYP00000010408	MIF4G	PF02854.19	1.3e-25	1	1
ENSPNYP00000010392	MIF4G	PF02854.19	1.4e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000010647	-	6442	XM_005720376	ENSPNYP00000010392	696 (aa)	XP_005720433	UPI0003BCE0E8
ENSPNYT00000010664	-	6361	XM_013910159	ENSPNYP00000010408	669 (aa)	XP_013765613	UPI0003BD8971
ENSPNYT00000010685	-	1746	-	ENSPNYP00000010430	581 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.984	ENSG00000134030	CTIF	100	64.029	Homo_sapiens
ENSPNYG00000007879	ctif	100	82.222	ENSAPOG00000020192	ctif	100	84.570	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000007879	ctif	87	57.707	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	57.331	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000007879	ctif	100	90.286	ENSACIG00000017099	ctif	100	90.286	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	78.049	ENSAOCG00000014275	ctif	100	78.797	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000007879	ctif	100	87.761	ENSAPEG00000016975	ctif	100	88.525	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000007879	ctif	100	85.633	ENSATEG00000016752	ctif	100	85.355	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.624	ENSACAG00000018006	CTIF	99	59.881	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.163	ENSANAG00000024925	CTIF	99	60.000	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000007879	ctif	100	99.856	ENSACLG00000005956	ctif	100	99.856	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000007879	ctif	94	62.842	ENSAMXG00000015964	ctif	100	63.497	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000007879	ctif	92	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.586	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	59.935	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000007879	ctif	97	58.306	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	59.543	Canis_familiaris
ENSPNYG00000007879	ctif	97	58.472	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	59.706	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.098	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	59.283	Capra_hircus
ENSPNYG00000007879	ctif	89	57.014	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	56.452	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000007879	ctif	99	54.472	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	53.748	Cavia_aperea
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.240	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	58.080	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.806	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	59.643	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.200	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.000	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.061	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	59.355	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000007879	ctif	99	57.878	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	57.410	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000007879	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.852	ENSCANG00000030916	CTIF	99	58.852	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.813	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	60.526	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000007879	ctif	99	56.260	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	55.943	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000007879	ctif	100	78.622	ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.450	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.456	ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.884	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	69.318	ENSDARG00000090617	ctif	100	68.040	Danio_rerio
ENSPNYG00000007879	ctif	71	59.681	ENSDNOG00000037310	CTIF	98	59.453	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.481	ENSDORG00000003221	Ctif	99	58.995	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000007879	ctif	79	87.500	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.033	ENSECAG00000020473	CTIF	99	59.868	Equus_caballus
ENSPNYG00000007879	ctif	89	57.221	ENSEEUG00000012451	CTIF	99	56.307	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	69.231	ENSELUG00000008733	ctif	99	68.233	Esox_lucius
ENSPNYG00000007879	ctif	89	87.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSPNYG00000007879	ctif	96	59.316	ENSFALG00000008943	CTIF	98	59.284	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000007879	ctif	99	57.278	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	57.571	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000007879	ctif	99	81.425	ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000007879	ctif	89	89.583	ENSGALG00000035912	-	98	89.583	Gallus_gallus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.207	ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000007879	ctif	64	60.000	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	60.606	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.948	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	60.294	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000007879	ctif	100	100.000	ENSHBUG00000018092	ctif	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.117	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	58.576	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000007879	ctif	99	57.955	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	58.576	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000007879	ctif	99	72.203	ENSHCOG00000011784	ctif	99	69.565	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000007879	ctif	99	67.251	ENSIPUG00000014050	ctif	99	61.757	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.157	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	58.833	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.508	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	59.180	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	82.265	ENSKMAG00000014651	ctif	100	82.370	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	80.272	ENSLBEG00000018277	ctif	99	81.218	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000007879	ctif	99	67.695	ENSLOCG00000011697	ctif	99	67.452	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	52.248	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	77.273	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.200	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	65.000	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.200	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	65.000	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.200	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	65.000	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.011	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	65.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	86.370	ENSMAMG00000014741	ctif	100	86.370	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000007879	ctif	90	99.519	ENSMZEG00005019767	ctif	90	99.519	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000007879	ctif	88	42.599	ENSMGAG00000001378	CTIF	73	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000007879	ctif	99	61.047	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	60.720	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.804	ENSMICG00000010167	CTIF	99	57.643	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	61.047	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	60.720	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.753	ENSMMOG00000000831	ctif	100	80.256	Mola_mola
ENSPNYG00000007879	ctif	99	56.436	ENSMODG00000003464	CTIF	99	55.941	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000007879	ctif	84	79.633	ENSMALG00000020553	ctif	99	88.462	Monopterus_albus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.934	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	58.934	Mus_caroli
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.498	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	59.184	Mus_musculus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.685	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	60.884	Mus_pahari
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.306	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.704	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	59.539	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.099	ENSMLUG00000003025	CTIF	99	59.442	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.616	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	60.292	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000007879	ctif	100	99.103	ENSNBRG00000008679	ctif	100	99.103	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.586	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	60.423	Nomascus_leucogenys
ENSPNYG00000007879	ctif	99	52.883	ENSMEUG00000000218	CTIF	81	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.574	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	58.824	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.188	ENSODEG00000018390	CTIF	99	58.029	Octodon_degus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	92.154	ENSONIG00000007750	ctif	100	91.152	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000007879	ctif	84	49.823	ENSOANG00000001337	CTIF	99	49.293	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	57.955	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	58.987	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.632	ENSORLG00000005786	ctif	100	78.784	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.801	ENSORLG00020005385	ctif	100	79.030	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.512	ENSORLG00015011872	ctif	100	80.085	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.887	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.745	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.654	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	59.314	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.359	ENSOARG00000003754	CTIF	99	59.543	Ovis_aries
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.784	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.000	Pan_paniscus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.196	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	59.706	Panthera_pardus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.196	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	59.706	Panthera_tigris_altaica
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.784	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.000	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.011	ENSPANG00000017087	CTIF	98	65.000	Papio_anubis
ENSPNYG00000007879	ctif	84	61.224	ENSPKIG00000011234	ctif	99	61.100	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000007879	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSPNYG00000007879	ctif	100	73.229	ENSPMGG00000022958	ctif	100	69.134	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.163	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	59.547	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNYG00000007879	ctif	75	55.699	ENSPCIG00000026247	CTIF	82	70.073	Phascolarctos_cinereus
ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.944	ENSPFOG00000009243	ctif	100	79.520	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.323	ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.029	Poecilia_latipinna
ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.323	ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.883	Poecilia_mexicana
ENSPNYG00000007879	ctif	100	78.723	ENSPREG00000017326	ctif	100	79.291	Poecilia_reticulata
ENSPNYG00000007879	ctif	84	61.079	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	60.886	Pongo_abelii
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.117	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	57.630	Propithecus_coquereli
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.682	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	59.319	Pteropus_vampyrus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	67.614	ENSPNAG00000029174	ctif	100	68.279	Pygocentrus_nattereri
ENSPNYG00000007879	ctif	99	61.003	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	61.003	Rattus_norvegicus
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.852	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	58.852	Rhinopithecus_bieti
ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.373	ENSRROG00000006039	CTIF	99	58.692	Rhinopithecus_roxellana
ENSPNYG00000007879	ctif	89	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	98	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPNYG00000007879	ctif	99	56.137	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	55.537	Sarcophilus_harrisii
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