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Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000009425 (Gene tree)
Gene ID: 102196813
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11416 bases
Position: chrJH419717.1:180083-191498
Accession: 102196813
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000012449	Aconitase	PF00330.20	4.6e-181	1	1
ENSPNYP00000012456	Aconitase	PF00330.20	4.6e-181	1	1
ENSPNYP00000012483	Aconitase	PF00330.20	1.6e-114	1	2
ENSPNYP00000012483	Aconitase	PF00330.20	1.6e-114	2	2
ENSPNYP00000012449	Aconitase_C	PF00694.19	1.8e-44	1	1
ENSPNYP00000012456	Aconitase_C	PF00694.19	1.8e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000012761	-	4847	XM_005754149	ENSPNYP00000012456	894 (aa)	XP_005754206	UPI0003AF68DB
ENSPNYT00000012789	-	1299	-	ENSPNYP00000012483	432 (aa)	-	-
ENSPNYT00000012754	-	4966	-	ENSPNYP00000012449	894 (aa)	-	UPI0003AF68DB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNYG00000009425	aco1	99	58.481	ENSPNYG00000008976	ireb2	95	58.481

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSG00000122729	ACO1	100	81.890	Homo_sapiens
ENSPNYG00000009425	aco1	100	89.374	ENSAPOG00000008670	aco1	100	89.374	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.360	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	82.360	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000009425	aco1	100	92.953	ENSACIG00000014377	aco1	100	92.953	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000009425	aco1	100	90.157	ENSAOCG00000007699	aco1	100	90.157	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000009425	aco1	100	90.045	ENSAPEG00000014370	aco1	100	90.045	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000009425	aco1	99	91.480	ENSATEG00000000560	aco1	99	91.480	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.419	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.419	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000009425	aco1	96	81.047	ENSACAG00000001541	ACO1	99	81.047	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.293	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.293	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000009425	aco1	100	99.776	ENSACLG00000007755	aco1	100	99.776	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000009425	aco1	99	85.843	ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.843	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.002	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	82.002	Bos_taurus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.765	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	80.765	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.124	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	81.124	Canis_familiaris
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.215	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	81.215	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.135	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	82.115	Capra_hircus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.360	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.360	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000009425	aco1	99	66.029	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	65.917	Cavia_aperea
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.552	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	81.552	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.652	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	80.652	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.002	ENSCATG00000045333	ACO1	100	82.002	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.765	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.765	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.502	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	81.502	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000009425	aco1	90	64.275	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	64.114	Choloepus_hoffmanni
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.644	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	81.644	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSCANG00000014847	ACO1	100	81.890	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.127	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	83.127	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.452	ENSCGRG00000004877	-	100	82.452	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000009425	aco1	100	85.347	ENSCSEG00000018262	aco1	100	85.347	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000009425	aco1	100	82.438	ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.438	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	85.843	ENSDARG00000026376	aco1	100	85.843	Danio_rerio
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	81.890	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.790	ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.790	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000009425	aco1	85	61.905	ENSETEG00000012415	-	85	61.905	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000009425	aco1	96	62.295	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.946	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.340	ENSEASG00005004602	ACO1	100	82.340	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.227	ENSECAG00000014846	ACO1	100	82.227	Equus_caballus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	70.866	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	70.866	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	85.955	ENSELUG00000016812	aco1	97	85.955	Esox_lucius
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.665	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	81.665	Felis_catus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.869	ENSFALG00000001167	ACO1	99	81.869	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.665	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	81.665	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000009425	aco1	100	88.255	ENSFHEG00000005619	aco1	100	88.255	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	84.494	ENSGMOG00000005514	aco1	99	84.494	Gadus_morhua
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.869	ENSGALG00000002162	ACO1	99	81.869	Gallus_gallus
ENSPNYG00000009425	aco1	78	75.946	ENSGAFG00000005897	aco1	90	88.705	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000009425	aco1	100	89.485	ENSGACG00000001637	aco1	100	89.485	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.532	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.532	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.777	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	81.777	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000009425	aco1	100	100.000	ENSHBUG00000008952	aco1	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.552	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	81.552	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.552	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.552	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000009425	aco1	100	85.011	ENSHCOG00000015881	aco1	100	85.011	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000009425	aco1	99	85.489	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.489	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.108	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	83.108	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.340	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	82.340	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000009425	aco1	100	88.814	ENSKMAG00000015759	aco1	100	88.814	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000009425	aco1	100	85.475	ENSLBEG00000013866	aco1	100	85.475	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000009425	aco1	75	69.288	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.104	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.240	ENSLOCG00000011082	aco1	99	83.240	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	79.640	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.640	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.777	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	81.777	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	81.890	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.665	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	81.665	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	81.890	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000009425	aco1	100	91.834	ENSMAMG00000002915	aco1	100	91.834	Mastacembelus_armatus
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ENSPNYG00000009425	aco1	97	71.806	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	65.965	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.902	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	82.902	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.002	ENSMICG00000006540	ACO1	100	82.002	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.127	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	83.127	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000009425	aco1	99	89.663	ENSMMOG00000020282	aco1	99	89.663	Mola_mola
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ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.240	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.240	Mus_spretus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.002	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	82.002	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.202	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	80.202	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.790	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	82.790	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000009425	aco1	98	82.791	ENSNBRG00000008973	aco1	100	78.174	Neolamprologus_brichardi
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ENSPNYG00000009425	aco1	99	78.178	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	78.178	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000009425	aco1	99	78.965	ENSODEG00000001240	-	100	78.740	Octodon_degus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	76.153	ENSODEG00000015432	-	100	76.040	Octodon_degus
ENSPNYG00000009425	aco1	100	96.868	ENSONIG00000019869	aco1	100	96.868	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000009425	aco1	81	82.434	ENSOANG00000012132	ACO1	100	82.434	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.646	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	81.424	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	89.189	ENSORLG00000020656	aco1	99	89.189	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000009425	aco1	99	89.077	ENSORLG00020010991	aco1	99	89.077	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000009425	aco1	99	88.901	ENSORLG00015011785	aco1	99	88.901	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000009425	aco1	99	87.767	ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.767	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.452	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	82.452	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.951	ENSOARG00000014707	ACO1	99	81.951	Ovis_aries
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.890	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	81.890	Pan_paniscus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.665	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	81.665	Panthera_pardus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.390	ENSPTIG00000016606	ACO1	99	81.390	Panthera_tigris_altaica
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ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.203	ENSPKIG00000023168	aco1	99	83.203	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSPNYG00000009425	aco1	100	88.702	ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.702	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.352	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	83.352	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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