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Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000016747 (Gene tree)
Gene ID: 106456204
Gene Symbol: apobec2b
Alias: apo2b
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4902 bases
Position: chrJH419252.1:1394031-1398932
Accession: 106456204
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000022147	APOBEC_N	PF08210.11	2.5e-42	1	1
ENSPNYP00000022147	APOBEC_C	PF05240.14	1.5e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000022688	-	3953	XM_013910721	ENSPNYP00000022147	268 (aa)	XP_013766175	UPI0006AB1663

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNYG00000016747	apobec2b	62	32.948	ENSPNYG00000000988	aicda	88	32.948

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSG00000124701	APOBEC2	85	60.733	Homo_sapiens
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	83.582	ENSAPOG00000019390	apobec2b	100	83.582	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	80	48.889	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	89	48.889	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000016747	apobec2b	88	47.934	ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.359	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	90.299	ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	80.224	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	99	52.399	ENSAOCG00000003291	apobec2a	99	51.661	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	84.328	ENSAOCG00000023355	apobec2b	100	84.328	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000016747	apobec2b	99	50.923	ENSAPEG00000003630	apobec2a	99	50.916	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	83.582	ENSAPEG00000004591	apobec2b	100	83.582	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	82.156	ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.156	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	48.519	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.143	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	82	51.101	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	53.052	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000016747	apobec2b	75	49.275	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	53.933	Anolis_carolinensis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.209	ENSANAG00000026993	APOBEC2	85	60.209	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000016747	apobec2b	64	58.140	ENSACLG00000026736	-	97	58.140	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	98.881	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	98.881	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000016747	apobec2b	81	61.161	ENSAMXG00000015966	apobec2b	100	57.651	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	77	55.399	ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.186	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	70	54.587	Bos_taurus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.209	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.505	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	85	59.162	Canis_familiaris
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	85	59.162	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.115	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	97	53.670	Capra_hircus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	97	54.505	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000016747	apobec2b	78	54.419	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	84	58.115	Cavia_aperea
ENSPNYG00000016747	apobec2b	78	54.419	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	84	58.115	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.209	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	97	55.505	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSCATG00000010691	APOBEC2	85	60.733	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000016747	apobec2b	78	54.884	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	84	58.639	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	97	55.963	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	65	58.333	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	58.333	Choloepus_hoffmanni
ENSPNYG00000016747	apobec2b	67	57.297	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	85	57.527	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.209	ENSCANG00000035072	APOBEC2	97	55.505	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSCGRG00001014983	Apobec2	85	59.162	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSCGRG00000007835	Apobec2	85	59.162	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000016747	apobec2b	85	55.411	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	48.529	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	70	74.468	ENSCSEG00000000690	-	100	61.852	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	77.985	ENSCVAG00000012342	apobec2b	100	77.985	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	84	60.965	ENSDARG00000113992	apobec2b	95	58.935	Danio_rerio
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	52.174	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	54.348	Danio_rerio
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	42.786	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	97	40.351	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.639	ENSDORG00000006447	Apobec2	98	53.125	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.639	ENSETEG00000000624	APOBEC2	83	58.639	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000016747	apobec2b	58	59.119	ENSEASG00005002937	APOBEC2	83	59.119	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.686	ENSECAG00000006576	APOBEC2	85	59.686	Equus_caballus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	74	55.556	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	97	54.128	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	70	60.317	ENSELUG00000003736	apobec2a	73	58.654	Esox_lucius
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.115	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	97	53.670	Felis_catus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	68	50.532	ENSFALG00000003910	APOBEC2	94	47.418	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.115	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	98	53.182	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	79	83.962	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	71.642	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	65	60.227	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	60.227	Gadus_morhua
ENSPNYG00000016747	apobec2b	76	73.430	ENSGMOG00000006819	apobec2b	100	62.963	Gadus_morhua
ENSPNYG00000016747	apobec2b	68	56.614	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	52.336	Gallus_gallus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	79.478	ENSGAFG00000007634	apobec2b	87	79.478	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	76.119	ENSGACG00000009663	apobec2b	96	84.722	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.043	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	59.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	67	57.297	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	54.726	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	98	54.825	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	98.507	ENSHBUG00000005993	apobec2b	100	98.507	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000016747	apobec2b	84	56.410	ENSHBUG00000015890	apobec2a	92	57.018	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	57.592	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	97	53.846	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	57.592	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	97	53.846	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000016747	apobec2b	97	48.473	ENSHCOG00000020319	apobec2a	82	56.716	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	78.519	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	100	77.778	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	58.845	ENSIPUG00000013784	Apobec2	100	56.934	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	79	56.422	ENSIPUG00000017355	apobec2a	71	49.270	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	97	55.963	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.115	ENSJJAG00000009733	Apobec2	99	53.571	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	99	74.532	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	74.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	73.214	ENSLBEG00000009422	-	100	73.214	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000016747	apobec2b	87	53.361	ENSLBEG00000025214	apobec2a	91	55.605	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000016747	apobec2b	82	56.502	ENSLACG00000015985	APOBEC2	94	56.818	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000016747	apobec2b	72	62.437	ENSLOCG00000012415	apobec2b	99	53.791	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	99	56.250	Loxodonta_africana
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	97	55.963	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	97	55.963	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	97	55.963	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	97	55.963	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	80	57.798	ENSMAMG00000023685	apobec2a	86	57.798	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	82.353	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	100	81.250	Mastacembelus_armatus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	82	56.522	ENSMZEG00005005240	-	96	56.637	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	99.254	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	100	99.254	Maylandia_zebra
ENSPNYG00000016747	apobec2b	82	50.661	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	54.749	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.686	ENSMAUG00000011016	Apobec2	85	59.686	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSMICG00000043339	APOBEC2	85	59.162	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.209	ENSMOCG00000001904	Apobec2	85	60.209	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	79.478	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	79.478	Mola_mola
ENSPNYG00000016747	apobec2b	68	57.368	ENSMODG00000013090	APOBEC2	86	57.368	Monodelphis_domestica
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	78.148	ENSMALG00000013779	APOBEC2	100	78.148	Monopterus_albus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	87	51.429	ENSMALG00000020523	apobec2a	89	55.046	Monopterus_albus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.686	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	85	59.686	Mus_caroli
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.162	ENSMUSG00000040694	Apobec2	85	59.162	Mus_musculus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	59.686	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	Mus_pahari
ENSPNYG00000016747	apobec2b	74	56.039	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	98	53.947	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.639	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	83	58.639	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.639	ENSNGAG00000013717	Apobec2	85	58.639	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	96.269	ENSNBRG00000018806	apobec2b	89	96.269	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000016747	apobec2b	77	58.173	ENSNBRG00000021776	apobec2a	87	57.209	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.733	Nomascus_leucogenys
ENSPNYG00000016747	apobec2b	68	57.368	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	86	57.368	Notamacropus_eugenii
ENSPNYG00000016747	apobec2b	75	56.190	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	99	54.185	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	58.639	ENSODEG00000016183	APOBEC2	83	58.639	Octodon_degus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	100	97.761	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	97.761	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000016747	apobec2b	79	59.447	ENSONIG00000004644	-	88	59.447	Oreochromis_niloticus
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