EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000020790 (Gene tree)
Gene ID: 102216133
Gene Symbol: polrmt
Alias: si:dkey-21e2.1|si:dkeyp-74c5.5|wu:fb73g10
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 49883 bases
Position: chrJH419261.1:1320063-1369945
Accession: 102216133
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000027601	RNA_pol	PF00940.19	2.1e-169	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000028274	-	5516	XM_005734029	ENSPNYP00000027601	1333 (aa)	XP_005734086	UPI0003AF9A79

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.980	ENSG00000099821	POLRMT	65	74.699	Homo_sapiens
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	82.596	ENSAPOG00000003942	polrmt	100	82.596	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000020790	polrmt	78	50.613	ENSAMEG00000002745	POLRMT	84	51.048	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNYG00000020790	polrmt	93	84.032	ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.161	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	82.371	ENSAOCG00000020208	polrmt	100	82.371	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	82.446	ENSAPEG00000007949	polrmt	100	82.446	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	79.179	ENSATEG00000024025	polrmt	97	83.640	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	58.537	ENSAPLG00000003051	POLRMT	99	58.350	Anas_platyrhynchos
ENSPNYG00000020790	polrmt	85	51.711	ENSANAG00000032916	POLRMT	90	51.711	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	99.100	ENSACLG00000003766	polrmt	100	99.100	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	60.429	ENSAMXG00000018258	polrmt	100	60.104	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	52.672	ENSBTAG00000015051	POLRMT	83	52.770	Bos_taurus
ENSPNYG00000020790	polrmt	80	49.580	ENSCJAG00000012913	POLRMT	82	50.882	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	52.250	ENSCAFG00000019711	POLRMT	83	52.293	Canis_familiaris
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	52.250	ENSCAFG00020016843	POLRMT	85	52.293	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000020790	polrmt	85	49.111	ENSCHIG00000013267	POLRMT	83	53.418	Capra_hircus
ENSPNYG00000020790	polrmt	73	56.489	ENSCAPG00000016900	POLRMT	88	56.489	Cavia_aperea
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	48.479	ENSCPOG00000023061	POLRMT	83	48.479	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	51.172	ENSCCAG00000025014	POLRMT	82	51.172	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.781	ENSCATG00000040393	POLRMT	82	50.781	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000020790	polrmt	86	45.833	ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.315	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	49.805	ENSCSAG00000012942	POLRMT	82	49.805	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000020790	polrmt	88	58.895	ENSCPBG00000009869	POLRMT	97	59.962	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000020790	polrmt	60	44.034	ENSCSAVG00000000440	-	99	44.034	Ciona_savignyi
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.392	ENSCANG00000038011	POLRMT	82	50.392	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	56.919	ENSCGRG00001021311	Polrmt	83	56.919	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	51.917	ENSCGRG00000011134	Polrmt	84	51.917	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	62.880	ENSCSEG00000002734	polrmt	100	62.612	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	81.034	ENSCVAG00000005949	polrmt	99	86.377	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	61.078	ENSDARG00000101220	polrmt	94	70.039	Danio_rerio
ENSPNYG00000020790	polrmt	77	62.319	ENSDORG00000014125	Polrmt	82	62.319	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000020790	polrmt	77	43.364	FBgn0261938	mtRNApol	78	43.364	Drosophila_melanogaster
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	66.390	ENSETEG00000003476	POLRMT	80	66.390	Echinops_telfairi
ENSPNYG00000020790	polrmt	69	52.146	ENSEBUG00000013453	-	99	52.146	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	53.229	ENSEASG00005021493	POLRMT	82	53.425	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	53.033	ENSECAG00000032711	POLRMT	82	53.229	Equus_caballus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	66.519	ENSELUG00000019319	polrmt	100	65.929	Esox_lucius
ENSPNYG00000020790	polrmt	78	52.581	ENSFCAG00000018808	POLRMT	84	52.581	Felis_catus
ENSPNYG00000020790	polrmt	65	59.909	ENSFALG00000013910	POLRMT	82	59.909	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000020790	polrmt	95	42.715	ENSFDAG00000020312	POLRMT	81	48.057	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000020790	polrmt	99	79.985	ENSFHEG00000021239	polrmt	99	82.253	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000020790	polrmt	92	70.911	ENSGMOG00000011829	polrmt	100	64.988	Gadus_morhua
ENSPNYG00000020790	polrmt	97	51.229	ENSGALG00000001377	POLRMT	99	51.499	Gallus_gallus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	79.145	ENSGAFG00000003953	polrmt	100	78.845	Gambusia_affinis
ENSPNYG00000020790	polrmt	94	72.561	ENSGACG00000012957	polrmt	98	81.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	78	63.452	ENSGAGG00000005522	POLRMT	90	63.452	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000020790	polrmt	63	70.093	ENSGGOG00000023264	-	79	70.093	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	98.575	ENSHBUG00000010005	polrmt	100	98.575	Haplochromis_burtoni
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ENSPNYG00000020790	polrmt	95	43.136	ENSHGLG00100005762	POLRMT	96	42.779	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000020790	polrmt	97	75.978	ENSHCOG00000001565	polrmt	100	75.978	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	63.800	ENSIPUG00000000789	polrmt	100	64.377	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	70	64.538	ENSSTOG00000003431	POLRMT	81	61.611	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	72	59.683	ENSJJAG00000012916	Polrmt	83	59.683	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	74.063	ENSKMAG00000004426	polrmt	100	74.063	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	80.896	ENSLBEG00000016529	polrmt	100	80.597	Labrus_bergylta
ENSPNYG00000020790	polrmt	96	59.907	ENSLACG00000011518	POLRMT	99	59.363	Latimeria_chalumnae
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ENSPNYG00000020790	polrmt	76	60.000	ENSMGAG00000003243	POLRMT	88	60.098	Meleagris_gallopavo
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	62.798	ENSMAUG00000019392	Polrmt	83	62.957	Mesocricetus_auratus
ENSPNYG00000020790	polrmt	84	51.859	ENSMICG00000016701	POLRMT	89	51.859	Microcebus_murinus
ENSPNYG00000020790	polrmt	80	48.131	ENSMOCG00000008868	Polrmt	86	48.566	Microtus_ochrogaster
ENSPNYG00000020790	polrmt	96	74.333	ENSMMOG00000000705	polrmt	99	73.940	Mola_mola
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ENSPNYG00000020790	polrmt	100	76.831	ENSMALG00000021224	polrmt	100	76.457	Monopterus_albus
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ENSPNYG00000020790	polrmt	74	63.016	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	100	61.894	Mus_pahari
ENSPNYG00000020790	polrmt	74	63.333	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	100	62.587	Mus_spretus
ENSPNYG00000020790	polrmt	79	49.724	ENSMPUG00000009910	POLRMT	87	49.770	Mustela_putorius_furo
ENSPNYG00000020790	polrmt	80	51.914	ENSMLUG00000009223	POLRMT	83	53.119	Myotis_lucifugus
ENSPNYG00000020790	polrmt	73	63.333	ENSNGAG00000005498	Polrmt	82	63.333	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000020790	polrmt	99	98.486	ENSNBRG00000023530	polrmt	100	98.486	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	51.373	ENSNLEG00000000718	POLRMT	82	51.373	Nomascus_leucogenys
ENSPNYG00000020790	polrmt	59	55.930	ENSOPRG00000013579	POLRMT	67	56.658	Ochotona_princeps
ENSPNYG00000020790	polrmt	90	96.929	ENSONIG00000002405	polrmt	100	96.929	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	77.678	ENSORLG00000004329	polrmt	97	77.603	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	76.629	ENSORLG00020003896	polrmt	100	77.154	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	76.957	ENSORLG00015022238	polrmt	97	76.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	73.578	ENSOMEG00000008292	polrmt	100	74.194	Oryzias_melastigma
ENSPNYG00000020790	polrmt	94	46.756	ENSOGAG00000007912	POLRMT	89	52.544	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000020790	polrmt	85	42.350	ENSOARG00000008898	POLRMT	83	45.437	Ovis_aries
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.098	ENSPPAG00000030853	POLRMT	81	50.098	Pan_paniscus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	48.922	ENSPPAG00000043321	-	81	48.922	Pan_paniscus
ENSPNYG00000020790	polrmt	64	61.032	ENSPPRG00000001547	POLRMT	75	60.282	Panthera_pardus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	49.314	ENSPTRG00000039638	-	81	49.314	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.588	ENSPTRG00000010157	POLRMT	78	50.588	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.684	ENSPANG00000006649	POLRMT	82	50.684	Papio_anubis
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	60.209	ENSPKIG00000024580	polrmt	100	60.358	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000020790	polrmt	89	75.730	ENSPMGG00000014627	polrmt	99	75.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000020790	polrmt	76	56.061	ENSPEMG00000011671	Polrmt	83	56.061	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNYG00000020790	polrmt	65	56.963	ENSPMAG00000005070	-	99	56.963	Petromyzon_marinus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	49.590	ENSPCIG00000006103	POLRMT	93	57.591	Phascolarctos_cinereus
ENSPNYG00000020790	polrmt	100	77.869	ENSPFOG00000003911	polrmt	100	77.719	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000020790	polrmt	86	77.459	ENSPLAG00000005743	polrmt	99	77.372	Poecilia_latipinna
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ENSPNYG00000020790	polrmt	78	50.864	ENSRNOG00000024879	Polrmt	86	50.769	Rattus_norvegicus
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ENSPNYG00000020790	polrmt	76	50.488	ENSRROG00000040809	POLRMT	82	50.488	Rhinopithecus_roxellana
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