EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNYG00000022381 (Gene tree)
Gene ID: 102209872
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Pundamilia_nyererei
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53464 bases
Position: chrJH419357.1:1293182-1346645
Accession: 102209872
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNYP00000029704	Wyosine_form	PF08608.12	2e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNYT00000030426	-	4093	XM_005745022	ENSPNYP00000029704	746 (aa)	XP_005745079	UPI0003AF7428

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNYG00000022381	tyw1	86	64.264	ENSG00000277149	TYW1B	93	65.123	Homo_sapiens
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.818	ENSG00000198874	TYW1	98	68.370	Homo_sapiens
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	84.288	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.554	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	86.648	ENSACIG00000007325	tyw1	99	86.648	Amphilophus_citrinellus
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	84.288	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	84.288	Amphiprion_ocellaris
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	84.687	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	84.687	Amphiprion_percula
ENSPNYG00000022381	tyw1	90	83.994	ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.994	Anabas_testudineus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.898	ENSANAG00000037051	-	98	66.898	Aotus_nancymaae
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	99.866	ENSACLG00000018688	tyw1	100	99.866	Astatotilapia_calliptera
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	74.523	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.510	Astyanax_mexicanus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.326	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	68.326	Bos_taurus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.898	ENSCJAG00000004295	-	98	66.898	Callithrix_jacchus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.006	ENSCAFG00000010867	-	98	68.646	Canis_familiaris
ENSPNYG00000022381	tyw1	93	62.931	ENSCAFG00020005367	-	99	63.754	Canis_lupus_dingo
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.516	ENSCHIG00000019510	-	98	68.516	Capra_hircus
ENSPNYG00000022381	tyw1	86	66.616	ENSTSYG00000008236	-	98	66.616	Carlito_syrichta
ENSPNYG00000022381	tyw1	85	65.109	ENSCAPG00000013569	-	100	65.109	Cavia_aperea
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	65.569	ENSCPOG00000011182	-	99	65.489	Cavia_porcellus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.036	ENSCCAG00000026643	-	98	67.313	Cebus_capucinus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.943	ENSCATG00000043677	-	98	67.497	Cercocebus_atys
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	65.937	ENSCLAG00000006321	-	99	66.257	Chinchilla_lanigera
ENSPNYG00000022381	tyw1	87	70.073	ENSCSAG00000018274	-	98	70.803	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	67.017	ENSCPBG00000014896	-	99	67.454	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNYG00000022381	tyw1	79	59.259	ENSCING00000004125	-	97	58.754	Ciona_intestinalis
ENSPNYG00000022381	tyw1	88	54.136	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.251	Ciona_savignyi
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.127	ENSCANG00000033209	-	98	67.680	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	67	76.869	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	74.945	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	80.027	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	80.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNYG00000022381	tyw1	90	80.265	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	80.265	Cyprinodon_variegatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	73.082	ENSDARG00000062987	tyw1	99	74.232	Danio_rerio
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.421	ENSDNOG00000024165	-	98	68.421	Dasypus_novemcinctus
ENSPNYG00000022381	tyw1	83	63.694	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	64.013	Dipodomys_ordii
ENSPNYG00000022381	tyw1	58	73.611	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	Eptatretus_burgeri
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.326	ENSEASG00005008818	-	98	68.880	Equus_asinus_asinus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	62.901	ENSECAG00000023164	-	98	62.968	Equus_caballus
ENSPNYG00000022381	tyw1	58	79.381	ENSEEUG00000005950	-	60	78.571	Erinaceus_europaeus
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	73.628	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.948	Esox_lucius
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.590	ENSFCAG00000014262	-	98	67.590	Felis_catus
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	63.673	ENSFALG00000013810	-	99	64.402	Ficedula_albicollis
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.300	ENSFDAG00000013270	-	98	67.170	Fukomys_damarensis
ENSPNYG00000022381	tyw1	81	80.945	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.945	Fundulus_heteroclitus
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	64.993	ENSGALG00000001110	-	99	66.532	Gallus_gallus
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	78.610	ENSGACG00000012692	tyw1	99	78.610	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	67.790	ENSGAGG00000022393	-	99	68.102	Gopherus_agassizii
ENSPNYG00000022381	tyw1	86	59.091	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.756	Gorilla_gorilla
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	99.464	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	99.464	Haplochromis_burtoni
ENSPNYG00000022381	tyw1	86	67.344	ENSHGLG00000012093	-	100	67.344	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	65.797	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	66.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	68.741	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	68.741	Hippocampus_comes
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	71.372	ENSIPUG00000016330	tyw1	99	72.908	Ictalurus_punctatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	65.199	ENSSTOG00000004067	-	90	65.612	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	65.734	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	66.390	Jaculus_jaculus
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	80.267	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	80.267	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	64.032	ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.212	Latimeria_chalumnae
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	72.059	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.466	Lepisosteus_oculatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.220	ENSMFAG00000035457	-	98	67.773	Macaca_fascicularis
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.220	ENSMMUG00000030374	-	98	67.773	Macaca_mulatta
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.082	ENSMNEG00000041992	-	98	70.985	Macaca_nemestrina
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.082	ENSMLEG00000039741	-	98	67.635	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNYG00000022381	tyw1	98	84.426	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	83.712	Mastacembelus_armatus
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ENSPNYG00000022381	tyw1	98	75.683	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	76.754	Mola_mola
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	65.348	ENSMODG00000025697	-	98	67.260	Monodelphis_domestica
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ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.482	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	67.036	Mus_caroli
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.898	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.358	Mus_musculus
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	65.742	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	66.852	Mus_pahari
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.482	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	66.943	Mus_spretus
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ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.435	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	66.620	Nannospalax_galili
ENSPNYG00000022381	tyw1	92	92.733	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	92.733	Neolamprologus_brichardi
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.437	ENSNLEG00000013210	-	96	67.127	Nomascus_leucogenys
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ENSPNYG00000022381	tyw1	88	63.939	ENSODEG00000014729	-	95	64.091	Octodon_degus
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	96.113	ENSONIG00000005872	tyw1	100	96.113	Oreochromis_niloticus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.897	ENSOCUG00000003173	-	98	66.895	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.491	ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.455	Oryzias_latipes
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.088	ENSORLG00020019361	tyw1	100	80.054	Oryzias_latipes_hni
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.144	ENSORLG00015008095	tyw1	99	80.107	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNYG00000022381	tyw1	89	71.791	ENSOGAG00000016555	-	99	68.071	Otolemur_garnettii
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.182	ENSOARG00000010673	-	98	68.182	Ovis_aries
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	68.201	ENSPPRG00000004945	-	98	68.201	Panthera_pardus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.967	ENSPTIG00000019545	-	98	67.967	Panthera_tigris_altaica
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	62.158	ENSPTRG00000023076	TYW1B	96	62.912	Pan_troglodytes
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.805	ENSPANG00000019053	-	98	67.265	Papio_anubis
ENSPNYG00000022381	tyw1	99	67.204	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.383	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNYG00000022381	tyw1	94	78.612	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.754	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.343	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.989	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	78.619	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.110	Poecilia_formosa
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	78.278	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	78.675	Poecilia_latipinna
ENSPNYG00000022381	tyw1	100	78.486	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	78.884	Poecilia_mexicana
ENSPNYG00000022381	tyw1	98	75.000	ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.408	Poecilia_reticulata
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ENSPNYG00000022381	tyw1	95	52.407	ENSPCOG00000015294	-	97	52.407	Propithecus_coquereli
ENSPNYG00000022381	tyw1	97	74.586	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	76.066	Pygocentrus_nattereri
ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.022	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.205	Rattus_norvegicus
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.989	ENSRBIG00000039619	-	98	67.541	Rhinopithecus_bieti
ENSPNYG00000022381	tyw1	95	66.989	ENSRROG00000039780	-	98	67.541	Rhinopithecus_roxellana
ENSPNYG00000022381	tyw1	92	40.510	YPL207W	-	76	40.510	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSPNYG00000022381	tyw1	98	83.469	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.800	Scophthalmus_maximus
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ENSPNYG00000022381	tyw1	97	65.211	ENSSPUG00000002715	-	99	66.033	Sphenodon_punctatus
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ENSPNYG00000022381	tyw1	96	67.215	ENSUMAG00000015343	-	100	67.960	Ursus_maritimus
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ENSPNYG00000022381	tyw1	100	77.674	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	79.067	Xiphophorus_maculatus