EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSPPAG00000041577 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
RPP38
Alias
-
Full Name
ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type
protein_coding
Species
Pan_paniscus
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
3020 bases
Position
chr10:15700027-15703046
Accession
30329
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSPPAP00000037648RNase_P_pop3PF08228.113.3e-0511
ENSPPAP00000037648Ribosomal_L7AePF01248.264e-1511
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSPPAT00000060548RPP38-201936-ENSPPAP00000037648311 (aa)-A0A2R9C9M2
ENSPPAT00000060559RPP38-202441-ENSPPAP00000037658146 (aa)-A0A2R9C9N1
Gene Model
Click here to download ENSPPAG00000041577's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPAG00000041577's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSPPAG00000041577RPP389198.940ENSG00000152464RPP3810099.405Homo_sapiens
ENSPPAG00000041577RPP388644.526ENSAPOG00000001240rpp389644.803Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPAG00000041577RPP389179.505ENSAMEG00000018832RPP3810079.505Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPAG00000041577RPP388043.284ENSACIG00000011592rpp389243.446Amphilophus_citrinellus
ENSPPAG00000041577RPP388644.056ENSAOCG00000017293rpp389744.330Amphiprion_ocellaris
ENSPPAG00000041577RPP388646.154ENSAPEG00000002315rpp389646.403Amphiprion_percula
ENSPPAG00000041577RPP388743.525ENSATEG00000000731rpp389843.525Anabas_testudineus
ENSPPAG00000041577RPP388351.698ENSAPLG00000002054RPP389652.708Anas_platyrhynchos
ENSPPAG00000041577RPP388642.857ENSACLG00000016962rpp389943.310Astatotilapia_calliptera
ENSPPAG00000041577RPP388643.728ENSACLG00000016958rpp389943.662Astatotilapia_calliptera
ENSPPAG00000041577RPP388144.841ENSAMXG00000025023rpp389844.765Astyanax_mexicanus
ENSPPAG00000041577RPP389173.498ENSBTAG00000007702RPP3810073.498Bos_taurus
ENSPPAG00000041577RPP389175.265ENSCAFG00000024373RPP3810075.265Canis_familiaris
ENSPPAG00000041577RPP389175.265ENSCAFG00020008008RPP3810075.265Canis_lupus_dingo
ENSPPAG00000041577RPP389174.205ENSCHIG00000012484RPP3810074.205Capra_hircus
ENSPPAG00000041577RPP389076.868ENSCPOG00000003981RPP389976.868Cavia_porcellus
ENSPPAG00000041577RPP389177.465ENSCLAG00000010194RPP3810077.465Chinchilla_lanigera
ENSPPAG00000041577RPP389193.640ENSCSAG00000019055RPP3810093.640Chlorocebus_sabaeus
ENSPPAG00000041577RPP389183.451ENSCHOG00000004335RPP3810083.451Choloepus_hoffmanni
ENSPPAG00000041577RPP389174.386ENSCGRG00001001395Rpp3810076.140Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPAG00000041577RPP389174.386ENSCGRG00000017441Rpp3810076.140Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPAG00000041577RPP388640.502ENSCSEG00000001721rpp389940.767Cynoglossus_semilaevis
ENSPPAG00000041577RPP388642.509ENSCVAG00000001676rpp389742.808Cyprinodon_variegatus
ENSPPAG00000041577RPP388246.484ENSDARG00000040350rpp389645.756Danio_rerio
ENSPPAG00000041577RPP389179.859ENSDNOG00000040314RPP3810079.859Dasypus_novemcinctus
ENSPPAG00000041577RPP389169.014ENSDORG00000009783Rpp3810069.014Dipodomys_ordii
ENSPPAG00000041577RPP389175.000ENSETEG00000002839RPP3810075.000Echinops_telfairi
ENSPPAG00000041577RPP389079.211ENSEASG00005019783RPP389879.211Equus_asinus_asinus
ENSPPAG00000041577RPP389072.760ENSEEUG00000014677RPP389972.760Erinaceus_europaeus
ENSPPAG00000041577RPP388043.478ENSELUG00000010160rpp389444.056Esox_lucius
ENSPPAG00000041577RPP389175.618ENSFCAG00000022449RPP3810075.618Felis_catus
ENSPPAG00000041577RPP388351.852ENSFALG00000014804RPP389452.837Ficedula_albicollis
ENSPPAG00000041577RPP389079.004ENSFDAG00000018669RPP389979.004Fukomys_damarensis
ENSPPAG00000041577RPP388641.489ENSFHEG00000013741rpp3810043.522Fundulus_heteroclitus
ENSPPAG00000041577RPP389447.541ENSGALG00000008794RPP389252.158Gallus_gallus
ENSPPAG00000041577RPP385348.503ENSGACG00000009258rpp389747.561Gasterosteus_aculeatus
ENSPPAG00000041577RPP388643.223ENSHBUG00000010937rpp389743.525Haplochromis_burtoni
ENSPPAG00000041577RPP389076.868ENSHGLG00000012144RPP389977.143Heterocephalus_glaber_female
ENSPPAG00000041577RPP388041.600ENSIPUG00000022879rpp389941.935Ictalurus_punctatus
ENSPPAG00000041577RPP389277.972ENSSTOG00000025699RPP389977.972Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPAG00000041577RPP389176.140ENSJJAG00000007523Rpp3810075.789Jaculus_jaculus
ENSPPAG00000041577RPP388043.295ENSKMAG00000003986rpp389342.806Kryptolebias_marmoratus
ENSPPAG00000041577RPP388444.322ENSLBEG00000006853rpp389445.055Labrus_bergylta
ENSPPAG00000041577RPP388652.098ENSLACG00000006502RPP3810052.000Latimeria_chalumnae
ENSPPAG00000041577RPP388649.638ENSLOCG00000018347rpp389449.281Lepisosteus_oculatus
ENSPPAG00000041577RPP389180.986ENSLAFG00000000509RPP3810080.634Loxodonta_africana
ENSPPAG00000041577RPP389193.286ENSMMUG00000007679RPP3810093.286Macaca_mulatta
ENSPPAG00000041577RPP388745.196ENSMAMG00000012774rpp389645.000Mastacembelus_armatus
ENSPPAG00000041577RPP388643.728ENSMZEG00005003189rpp389743.525Maylandia_zebra
ENSPPAG00000041577RPP388643.728ENSMZEG00005003200rpp389943.662Maylandia_zebra
ENSPPAG00000041577RPP388452.256ENSMGAG00000008217RPP389252.899Meleagris_gallopavo
ENSPPAG00000041577RPP389173.684ENSMAUG00000003644Rpp3810075.439Mesocricetus_auratus
ENSPPAG00000041577RPP389176.842ENSMOCG00000007020Rpp3810076.491Microtus_ochrogaster
ENSPPAG00000041577RPP388542.143ENSMMOG00000003446rpp389442.545Mola_mola
ENSPPAG00000041577RPP388666.790ENSMODG00000024091RPP3810066.316Monodelphis_domestica
ENSPPAG00000041577RPP388341.887ENSMALG00000002356rpp389341.887Monopterus_albus
ENSPPAG00000041577RPP389176.140MGP_CAROLIEiJ_G0023133Rpp3810076.140Mus_caroli
ENSPPAG00000041577RPP389175.789ENSMUSG00000049950Rpp3810075.789Mus_musculus
ENSPPAG00000041577RPP389176.842MGP_PahariEiJ_G0019193Rpp3810076.842Mus_pahari
ENSPPAG00000041577RPP389175.088MGP_SPRETEiJ_G0024051Rpp3810075.088Mus_spretus
ENSPPAG00000041577RPP389076.512ENSMPUG00000018523RPP389976.512Mustela_putorius_furo
ENSPPAG00000041577RPP388581.509ENSMLUG00000002153RPP3810081.625Myotis_lucifugus
ENSPPAG00000041577RPP389175.789ENSNGAG00000011066Rpp3810075.789Nannospalax_galili
ENSPPAG00000041577RPP388643.728ENSNBRG00000006994rpp389842.806Neolamprologus_brichardi
ENSPPAG00000041577RPP388643.369ENSONIG00000020467rpp389643.011Oreochromis_niloticus
ENSPPAG00000041577RPP388575.188ENSOCUG00000024367-10075.352Oryctolagus_cuniculus
ENSPPAG00000041577RPP388576.316ENSOCUG00000022768-10076.408Oryctolagus_cuniculus
ENSPPAG00000041577RPP388041.509ENSORLG00000009219rpp389640.357Oryzias_latipes
ENSPPAG00000041577RPP388042.803ENSORLG00020011503rpp389041.264Oryzias_latipes_hni
ENSPPAG00000041577RPP389038.176ENSORLG00015017702rpp389937.874Oryzias_latipes_hsok
ENSPPAG00000041577RPP388041.860ENSOMEG00000005414rpp389940.136Oryzias_melastigma
ENSPPAG00000041577RPP389181.979ENSOGAG00000008059RPP3810081.979Otolemur_garnettii
ENSPPAG00000041577RPP389174.912ENSOARG00000004534RPP3810074.912Ovis_aries
ENSPPAG00000041577RPP389175.618ENSPPRG00000015329RPP3810075.618Panthera_pardus
ENSPPAG00000041577RPP389175.265ENSPTIG00000007188RPP3810075.265Panthera_tigris_altaica
ENSPPAG00000041577RPP3810099.678ENSPTRG00000002318RPP3810099.678Pan_troglodytes
ENSPPAG00000041577RPP388444.604ENSPKIG00000025652rpp389344.803Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPAG00000041577RPP388858.065ENSPSIG00000001527RPP389857.895Pelodiscus_sinensis
ENSPPAG00000041577RPP389176.842ENSPEMG00000008375Rpp3810078.246Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPAG00000041577RPP389268.293ENSPCIG00000009096RPP389567.944Phascolarctos_cinereus
ENSPPAG00000041577RPP385546.196ENSPFOG00000016823rpp388246.196Poecilia_formosa
ENSPPAG00000041577RPP388141.221ENSPLAG00000007626rpp389841.608Poecilia_latipinna
ENSPPAG00000041577RPP387938.911ENSPMEG00000020392rpp389338.889Poecilia_mexicana
ENSPPAG00000041577RPP388841.404ENSPREG00000017744rpp389741.053Poecilia_reticulata
ENSPPAG00000041577RPP389198.587ENSPPYG00000002113RPP3810098.587Pongo_abelii
ENSPPAG00000041577RPP388579.245ENSPVAG00000007155RPP3810079.505Pteropus_vampyrus
ENSPPAG00000041577RPP388643.728ENSPNYG00000004293rpp389743.525Pundamilia_nyererei
ENSPPAG00000041577RPP388043.529ENSPNAG00000010633rpp389944.245Pygocentrus_nattereri
ENSPPAG00000041577RPP388973.477ENSRNOG00000038025Rpp389973.477Rattus_norvegicus
ENSPPAG00000041577RPP389168.772ENSSHAG00000015529RPP389969.258Sarcophilus_harrisii
ENSPPAG00000041577RPP388643.116ENSSMAG00000018276rpp389543.116Scophthalmus_maximus
ENSPPAG00000041577RPP388642.545ENSSDUG00000001651rpp389844.170Seriola_dumerili
ENSPPAG00000041577RPP388642.545ENSSLDG00000014355rpp389842.857Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPAG00000041577RPP389156.537ENSSARG00000012099RPP3810056.184Sorex_araneus
ENSPPAG00000041577RPP388753.986ENSSPUG00000008560-9754.348Sphenodon_punctatus
ENSPPAG00000041577RPP389158.333ENSSPUG00000005237-10057.986Sphenodon_punctatus
ENSPPAG00000041577RPP389057.692ENSSPUG00000018363-9957.343Sphenodon_punctatus
ENSPPAG00000041577RPP388645.055ENSSPAG00000020387rpp389645.324Stegastes_partitus
ENSPPAG00000041577RPP389172.028ENSSSCG00000027110RPP3810072.028Sus_scrofa
ENSPPAG00000041577RPP388350.000ENSTGUG00000001366RPP389751.064Taeniopygia_guttata
ENSPPAG00000041577RPP388643.772ENSTNIG00000001334rpp389643.772Tetraodon_nigroviridis
ENSPPAG00000041577RPP389173.852ENSTTRG00000004420RPP3810073.852Tursiops_truncatus
ENSPPAG00000041577RPP389179.152ENSUAMG00000002618RPP3810079.152Ursus_americanus
ENSPPAG00000041577RPP389177.817ENSUMAG00000012382RPP3810078.873Ursus_maritimus
ENSPPAG00000041577RPP389174.912ENSVVUG00000005272RPP3810074.912Vulpes_vulpes
ENSPPAG00000041577RPP388448.162ENSXETG00000003419rpp389748.582Xenopus_tropicalis

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us