EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPPAG00000043779 (Gene tree)
Gene ID: 100981598
Gene Symbol: RPP30
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Pan_paniscus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31525 bases
Position: chr10:91138993-91170517
Accession: 100981598
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPAP00000042415	RNase_P_p30	PF01876.16	1.7e-64	1	1
ENSPPAP00000042419	RNase_P_p30	PF01876.16	2.8e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPAT00000065349	RPP30-202	957	XM_014346574	ENSPPAP00000042419	318 (aa)	XP_014202060	A0A2R9CKD2
ENSPPAT00000065345	RPP30-201	1370	XM_008950681	ENSPPAP00000042415	268 (aa)	XP_008948929	A0A2R9CKB0

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pps03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pps03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	99.254	ENSG00000148688	RPP30	100	99.254	Homo_sapiens
ENSPPAG00000043779	RPP30	96	52.326	ENSAPOG00000023156	rpp30	98	52.326	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPAG00000043779	RPP30	87	58.798	ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	Amphilophus_citrinellus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	56.929	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	56.929	Amphiprion_ocellaris
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	56.929	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	56.929	Amphiprion_percula
ENSPPAG00000043779	RPP30	92	60.729	ENSATEG00000015263	rpp30	89	60.729	Anabas_testudineus
ENSPPAG00000043779	RPP30	90	75.104	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	75.104	Anas_platyrhynchos
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	70.189	ENSACAG00000007996	RPP30	99	70.189	Anolis_carolinensis
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	83.774	ENSANAG00000009439	RPP30	100	78.616	Aotus_nancymaae
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	55.970	ENSACLG00000015389	-	99	55.970	Astatotilapia_calliptera
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	57.463	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	Astyanax_mexicanus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	93.258	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	93.258	Bos_taurus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	95.896	ENSCJAG00000011045	RPP30	100	95.896	Callithrix_jacchus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.030	ENSCAFG00000031801	RPP30	100	94.030	Canis_familiaris
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.030	ENSCAFG00020000258	RPP30	100	94.030	Canis_lupus_dingo
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	89.139	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	89.139	Capra_hircus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.403	ENSTSYG00000013903	RPP30	100	94.403	Carlito_syrichta
ENSPPAG00000043779	RPP30	90	71.667	ENSCAPG00000001326	RPP30	100	71.667	Cavia_aperea
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	92.164	ENSCPOG00000033174	RPP30	100	92.164	Cavia_porcellus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	97.015	ENSCCAG00000029514	RPP30	100	97.015	Cebus_capucinus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.491	ENSCATG00000042072	RPP30	99	98.491	Cercocebus_atys
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.284	ENSCLAG00000008595	RPP30	100	93.284	Chinchilla_lanigera
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.876	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	98.876	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPAG00000043779	RPP30	87	52.734	ENSCHOG00000007023	-	100	52.734	Choloepus_hoffmanni
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	76.692	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	76.692	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPAG00000043779	RPP30	87	40.496	ENSCING00000019714	-	89	39.669	Ciona_intestinalis
ENSPPAG00000043779	RPP30	96	38.603	ENSCSAVG00000011282	-	87	38.603	Ciona_savignyi
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.876	ENSCANG00000041084	RPP30	99	98.876	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	78.358	ENSCGRG00001000834	-	100	78.358	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPAG00000043779	RPP30	87	93.103	ENSCGRG00001017068	-	97	93.103	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	78.731	ENSCGRG00000006196	-	100	78.731	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	92.910	ENSCGRG00000002508	-	100	92.910	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	52.747	ENSCSEG00000001779	rpp30	94	52.347	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	59.259	ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.824	Cyprinodon_variegatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	61.049	ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	Danio_rerio
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.030	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	94.030	Dasypus_novemcinctus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	92.537	ENSDORG00000015333	Rpp30	100	92.537	Dipodomys_ordii
ENSPPAG00000043779	RPP30	87	32.618	FBgn0283652	Rpp30	78	32.618	Drosophila_melanogaster
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	89.179	ENSETEG00000018823	RPP30	100	89.179	Echinops_telfairi
ENSPPAG00000043779	RPP30	56	40.523	ENSEBUG00000003989	-	83	40.523	Eptatretus_burgeri
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	93.633	ENSEASG00005011050	RPP30	99	93.633	Equus_asinus_asinus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	93.633	ENSECAG00000021917	RPP30	99	93.633	Equus_caballus
ENSPPAG00000043779	RPP30	97	65.900	ENSEEUG00000009986	-	99	65.900	Erinaceus_europaeus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	66.543	ENSELUG00000003731	rpp30	95	66.543	Esox_lucius
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.284	ENSFCAG00000029073	RPP30	93	93.284	Felis_catus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	74.906	ENSFALG00000007711	RPP30	99	75.472	Ficedula_albicollis
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	92.509	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	92.830	Fukomys_damarensis
ENSPPAG00000043779	RPP30	92	57.724	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	55.144	Fundulus_heteroclitus
ENSPPAG00000043779	RPP30	91	54.365	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	54.365	Gadus_morhua
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	73.507	ENSGALG00000006486	RPP30	98	75.410	Gallus_gallus
ENSPPAG00000043779	RPP30	96	57.529	ENSGAFG00000001445	rpp30	94	57.529	Gambusia_affinis
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	55.720	ENSGACG00000010285	rpp30	96	55.720	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	74.812	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	74.812	Gopherus_agassizii
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	99.254	ENSGGOG00000026917	RPP30	100	99.254	Gorilla_gorilla
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	56.343	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	56.343	Haplochromis_burtoni
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSHGLG00000013072	RPP30	100	93.657	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSHGLG00100017798	RPP30	100	93.657	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	50.530	ENSHCOG00000004763	-	99	50.530	Hippocampus_comes
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	57.934	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	57.993	Ictalurus_punctatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	92.884	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	92.884	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.403	ENSJJAG00000020041	Rpp30	100	94.403	Jaculus_jaculus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	55.970	ENSKMAG00000015355	rpp30	100	55.556	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	54.982	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	54.982	Labrus_bergylta
ENSPPAG00000043779	RPP30	72	61.644	ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	Latimeria_chalumnae
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	67.537	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	67.658	Lepisosteus_oculatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSLAFG00000015931	RPP30	100	93.657	Loxodonta_africana
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.876	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	98.876	Macaca_fascicularis
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.876	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	98.876	Macaca_mulatta
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.502	ENSMNEG00000033838	RPP30	99	98.502	Macaca_nemestrina
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	98.876	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	98.876	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	57.196	ENSMAMG00000010934	rpp30	100	56.777	Mastacembelus_armatus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	56.343	ENSMZEG00005018508	-	99	56.343	Maylandia_zebra
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	68.284	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	68.657	Meleagris_gallopavo
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSMAUG00000008797	Rpp30	100	93.657	Mesocricetus_auratus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	95.149	ENSMICG00000012019	RPP30	100	95.149	Microcebus_murinus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	91.791	ENSMOCG00000016872	Rpp30	100	91.791	Microtus_ochrogaster
ENSPPAG00000043779	RPP30	97	53.817	ENSMMOG00000009266	rpp30	98	52.612	Mola_mola
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	83.521	ENSMODG00000006863	-	99	83.521	Monodelphis_domestica
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	71.161	ENSMODG00000009342	-	99	71.161	Monodelphis_domestica
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	57.196	ENSMALG00000011718	rpp30	99	57.196	Monopterus_albus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	90.262	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	90.262	Mus_caroli
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	90.299	ENSMUSG00000024800	Rpp30	100	90.299	Mus_musculus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	90.299	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	Mus_pahari
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	90.299	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	Mus_spretus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	93.208	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	93.208	Mustela_putorius_furo
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	95.131	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	95.131	Myotis_lucifugus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	75.373	ENSNGAG00000014392	-	100	75.373	Nannospalax_galili
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.030	ENSNGAG00000012018	-	100	94.030	Nannospalax_galili
ENSPPAG00000043779	RPP30	92	51.626	ENSNBRG00000024170	-	91	51.626	Neolamprologus_brichardi
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	99.254	ENSNLEG00000012383	RPP30	100	99.254	Nomascus_leucogenys
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	73.432	ENSMEUG00000015587	-	100	73.432	Notamacropus_eugenii
ENSPPAG00000043779	RPP30	53	92.958	ENSOPRG00000007367	-	100	92.958	Ochotona_princeps
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	69.030	ENSODEG00000004560	-	100	69.030	Octodon_degus
ENSPPAG00000043779	RPP30	98	92.395	ENSODEG00000004530	-	100	92.395	Octodon_degus
ENSPPAG00000043779	RPP30	77	57.488	ENSONIG00000019140	rpp30	100	57.488	Oreochromis_niloticus
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	82.022	ENSOANG00000003415	RPP30	99	82.022	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	91.418	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	91.418	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPAG00000043779	RPP30	96	58.397	ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	Oryzias_latipes
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	58.582	ENSORLG00020009037	-	100	58.148	Oryzias_latipes_hni
ENSPPAG00000043779	RPP30	99	58.582	ENSORLG00015008300	rpp30	93	58.582	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPAG00000043779	RPP30	68	54.348	ENSOMEG00000012640	-	98	54.348	Oryzias_melastigma
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	94.030	ENSOGAG00000013963	RPP30	100	94.030	Otolemur_garnettii
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	83.582	ENSOARG00000015789	RPP30	100	83.582	Ovis_aries
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSPPRG00000000115	RPP30	100	93.657	Panthera_pardus
ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	ENSPTIG00000014949	RPP30	100	93.657	Panthera_tigris_altaica
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