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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPRG00000000370 (Gene tree)
Gene ID: 109277538
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_pardus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25684 bases
Position: chrKV860322.1:4198419-4224102
Accession: 109277538
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPRP00000004171	RRM_1	PF00076.22	5.7e-34	1	2
ENSPPRP00000004171	RRM_1	PF00076.22	5.7e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPRT00000001781	MSI1-201	1539	XM_019467271	ENSPPRP00000004171	362 (aa)	XP_019322816	UPI0000073DD8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	40.686	ENSPPRG00000022322	HNRNPA3	69	38.403
ENSPPRG00000000370	MSI1	50	41.209	ENSPPRG00000022225	-	63	38.750
ENSPPRG00000000370	MSI1	52	41.346	ENSPPRG00000012584	DAZAP1	55	41.346
ENSPPRG00000000370	MSI1	53	40.000	ENSPPRG00000008329	-	69	40.000
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	37.766	ENSPPRG00000015090	-	76	37.766
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	34.426	ENSPPRG00000005893	-	58	34.426
ENSPPRG00000000370	MSI1	67	30.709	ENSPPRG00000009266	-	82	30.709
ENSPPRG00000000370	MSI1	68	36.842	ENSPPRG00000009507	RBM38	63	42.373
ENSPPRG00000000370	MSI1	50	42.308	ENSPPRG00000012587	HNRNPA1	76	41.584
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	36.508	ENSPPRG00000005026	-	88	35.468
ENSPPRG00000000370	MSI1	50	38.816	ENSPPRG00000022946	-	69	38.816
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	44.162	ENSPPRG00000012258	HNRNPD	72	40.161
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	69.298	ENSPPRG00000001848	MSI2	91	80.531
ENSPPRG00000000370	MSI1	51	41.436	ENSPPRG00000018110	-	79	37.500
ENSPPRG00000000370	MSI1	50	42.308	ENSPPRG00000015383	-	75	39.004

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.791	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.254	ENSAPOG00000023458	-	100	84.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPRG00000000370	MSI1	91	82.675	ENSACIG00000017754	-	78	82.675	Amphilophus_citrinellus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.791	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.791	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	77.485	ENSAOCG00000009031	-	95	77.778	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.791	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.791	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.254	ENSAPEG00000006857	-	84	84.254	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	78.415	ENSATEG00000023779	-	100	78.415	Anabas_testudineus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	96.419	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	Anolis_carolinensis
ENSPPRG00000000370	MSI1	82	96.309	ENSANAG00000027901	-	92	96.309	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.242	ENSACLG00000011230	MSI1	100	83.242	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.978	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	99.724	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.724	Canis_familiaris
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	94.580	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	94.580	Capra_hircus
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPPRG00000000370	MSI1	75	96.390	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	95.856	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.149	ENSCSEG00000008352	-	100	83.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	78.299	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	78.299	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.516	ENSCSEG00000005834	-	100	83.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.254	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.254	Cyprinodon_variegatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSPPRG00000000370	MSI1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	100	100.000	Equus_caballus
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	80.387	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.387	Esox_lucius
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	81.232	ENSELUG00000023280	-	100	80.938	Esox_lucius
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	Felis_catus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.791	ENSFHEG00000003560	-	100	83.791	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.530	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.530	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	Gadus_morhua
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	76.584	ENSGMOG00000017838	-	100	76.584	Gadus_morhua
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.957	Gallus_gallus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	65.205	ENSGAFG00000005860	-	100	65.205	Gambusia_affinis
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	85.380	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.380	Gambusia_affinis
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	80.663	ENSGACG00000008674	-	100	80.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.425	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	95.580	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.580	Gopherus_agassizii
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.242	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	83.242	Haplochromis_burtoni
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.978	ENSHBUG00000011841	-	100	83.978	Haplochromis_burtoni
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	99.724	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	78.689	ENSHCOG00000012067	-	100	78.689	Hippocampus_comes
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	80.938	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.938	Hippocampus_comes
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	82.320	ENSIPUG00000001976	msi1	100	82.320	Ictalurus_punctatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.530	ENSJJAG00000010643	-	100	84.254	Jaculus_jaculus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.702	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	83.578	ENSKMAG00000019877	-	100	83.578	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.242	ENSLBEG00000001375	-	100	83.242	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	84.254	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	84.254	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	87.427	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSPPRG00000000370	MSI1	50	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPPRG00000000370	MSI1	97	98.291	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.291	Macaca_mulatta
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPRG00000000370	MSI1	96	85.960	ENSMAMG00000018426	-	100	83.791	Mastacembelus_armatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.425	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.242	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	Maylandia_zebra
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.978	ENSMZEG00005000340	-	100	83.978	Maylandia_zebra
ENSPPRG00000000370	MSI1	64	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSPPRG00000000370	MSI1	71	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	99.724	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	Microtus_ochrogaster
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	81.571	ENSMMOG00000012265	-	99	80.415	Mola_mola
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	76.316	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	76.316	Mola_mola
ENSPPRG00000000370	MSI1	91	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	83.978	ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	Monopterus_albus
ENSPPRG00000000370	MSI1	98	85.044	ENSMALG00000001426	-	100	85.044	Monopterus_albus
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	99.448	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	99.448	Mus_caroli
ENSPPRG00000000370	MSI1	100	99.448	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	99.448	Mus_musculus
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