EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPRG00000002050 (Gene tree)
Gene ID: 109268968
Gene Symbol: TNPO3
Alias: -
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_pardus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 78280 bases
Position: chrKV860295.1:8479874-8558153
Accession: 109268968
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPRP00000006570	Xpo1	PF08389.12	1.6e-28	1	1
ENSPPRP00000006554	Xpo1	PF08389.12	1.6e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPRT00000004292	TNPO3-202	4297	XM_019452697	ENSPPRP00000006570	923 (aa)	XP_019308242	UPI00005A2B3F
ENSPPRT00000004273	TNPO3-201	2580	-	ENSPPRP00000006554	859 (aa)	-	UPI0001B79349

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSG00000064419	TNPO3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.566	ENSAPOG00000018347	tnpo3	100	86.566	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	96.429	ENSAMEG00000005135	TNPO3	98	96.429	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPRG00000002050	TNPO3	96	84.145	ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	Amphilophus_citrinellus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.674	ENSAOCG00000008264	tnpo3	100	86.674	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000002050	TNPO3	96	86.636	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	86.636	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.590	ENSATEG00000003197	tnpo3	100	85.590	Anabas_testudineus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	72	94.340	ENSAPLG00000005946	TNPO3	91	94.340	Anas_platyrhynchos
ENSPPRG00000002050	TNPO3	82	92.773	ENSACAG00000013470	TNPO3	95	92.773	Anolis_carolinensis
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.767	ENSANAG00000037940	TNPO3	100	99.767	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.915	ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.915	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.241	ENSAMXG00000016236	tnpo3	100	86.241	Astyanax_mexicanus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.242	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	99.242	Bos_taurus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	84	31.754	WBGene00006647	tsr-1	82	30.675	Caenorhabditis_elegans
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.767	ENSCJAG00000018085	TNPO3	100	99.767	Callithrix_jacchus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSCAFG00000001543	TNPO3	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSCAFG00020022462	TNPO3	99	99.568	Canis_lupus_dingo
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.242	ENSCHIG00000011721	TNPO3	100	99.242	Capra_hircus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.884	ENSTSYG00000002989	TNPO3	100	99.884	Carlito_syrichta
ENSPPRG00000002050	TNPO3	70	97.849	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	97.849	Cavia_aperea
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.350	ENSCPOG00000039784	TNPO3	100	99.350	Cavia_porcellus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.884	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	99.884	Cebus_capucinus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	98.813	ENSCLAG00000016298	TNPO3	100	98.813	Chinchilla_lanigera
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.783	ENSCSAG00000009966	TNPO3	100	99.783	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	71.083	ENSCHOG00000011547	TNPO3	99	71.083	Choloepus_hoffmanni
ENSPPRG00000002050	TNPO3	93	94.866	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	94.866	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	48.911	ENSCING00000005042	-	99	48.911	Ciona_intestinalis
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	47.219	ENSCSAVG00000008623	-	94	54.182	Ciona_savignyi
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.567	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	100	99.567	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.567	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	100	99.567	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	84.940	ENSCSEG00000005952	tnpo3	100	84.940	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.699	ENSCVAG00000020285	tnpo3	100	85.699	Cyprinodon_variegatus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.083	ENSDARG00000045680	tnpo3	100	85.807	Danio_rerio
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.892	ENSDNOG00000002556	TNPO3	100	99.892	Dasypus_novemcinctus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	62	97.582	ENSDORG00000002433	Tnpo3	95	97.582	Dipodomys_ordii
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	42.582	FBgn0031456	Tnpo-SR	99	42.519	Drosophila_melanogaster
ENSPPRG00000002050	TNPO3	95	99.560	ENSETEG00000002101	TNPO3	90	99.560	Echinops_telfairi
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	74.722	ENSEBUG00000016931	tnpo3	100	71.289	Eptatretus_burgeri
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.783	ENSEASG00005008677	TNPO3	100	99.783	Equus_asinus_asinus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.783	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	99.783	Equus_caballus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	99.718	ENSEEUG00000005178	TNPO3	98	93.723	Erinaceus_europaeus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	61	32.701	ENSEEUG00000011681	IPO13	73	30.493	Erinaceus_europaeus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	86.942	ENSELUG00000012153	tnpo3	99	86.942	Esox_lucius
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	96	89.632	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	89.632	Ficedula_albicollis
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.243	ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	Fukomys_damarensis
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.699	ENSFHEG00000012859	tnpo3	100	85.699	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.590	ENSGMOG00000007324	tnpo3	100	85.590	Gadus_morhua
ENSPPRG00000002050	TNPO3	61	94.306	ENSGALG00000039420	TNPO3	98	94.306	Gallus_gallus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.807	ENSGACG00000000699	tnpo3	100	85.807	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	93	94.749	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	94.749	Gopherus_agassizii
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.915	ENSHBUG00000008351	tnpo3	100	85.915	Haplochromis_burtoni
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.783	ENSHGLG00000004463	TNPO3	100	99.783	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.783	ENSHGLG00100005509	TNPO3	100	99.783	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.265	ENSHCOG00000007221	tnpo3	100	85.265	Hippocampus_comes
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.915	ENSKMAG00000010497	tnpo3	100	85.915	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	95	86.667	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	84.371	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000002050	TNPO3	96	81.767	ENSLBEG00000011988	-	99	81.767	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000002050	TNPO3	84	90.270	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	90.270	Latimeria_chalumnae
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	87.757	ENSLOCG00000015556	tnpo3	100	87.757	Lepisosteus_oculatus
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.241	ENSMAMG00000021096	tnpo3	100	86.241	Mastacembelus_armatus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.915	ENSMZEG00005015084	tnpo3	100	85.915	Maylandia_zebra
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	68	35.659	ENSMICG00000011003	IPO13	77	33.136	Microcebus_murinus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.567	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	100	99.567	Microtus_ochrogaster
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	97.725	ENSMODG00000014700	TNPO3	100	97.725	Monodelphis_domestica
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.083	ENSMALG00000006675	tnpo3	100	85.699	Monopterus_albus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.458	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	100	99.458	Mus_caroli
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.458	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	100	99.458	Mus_musculus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.350	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	100	99.350	Mus_pahari
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.350	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	100	99.350	Mus_spretus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSMPUG00000006021	TNPO3	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	89.382	ENSMLUG00000000947	TNPO3	100	89.382	Myotis_lucifugus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.892	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	100	99.892	Nannospalax_galili
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.089	ENSNBRG00000019001	tnpo3	100	85.569	Neolamprologus_brichardi
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.884	ENSNLEG00000012491	TNPO3	100	99.884	Nomascus_leucogenys
ENSPPRG00000002050	TNPO3	92	80.858	ENSMEUG00000002445	TNPO3	91	80.858	Notamacropus_eugenii
ENSPPRG00000002050	TNPO3	91	99.457	ENSOPRG00000006163	TNPO3	90	99.457	Ochotona_princeps
ENSPPRG00000002050	TNPO3	98	99.335	ENSODEG00000012826	TNPO3	100	99.335	Octodon_degus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	86.132	ENSONIG00000007604	tnpo3	100	86.132	Oreochromis_niloticus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	95	93.268	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	93.268	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	99	96.008	ENSOCUG00000010105	TNPO3	99	96.008	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.000	ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	Oryzias_latipes
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.000	ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	Oryzias_latipes_hni
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.278	ENSORLG00015002610	tnpo3	100	84.940	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.278	ENSOMEG00000021006	tnpo3	100	85.049	Oryzias_melastigma
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ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.025	ENSOARG00000004026	TNPO3	100	99.025	Ovis_aries
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSPTIG00000016167	TNPO3	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	100.000	ENSPANG00000022226	TNPO3	100	100.000	Papio_anubis
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