EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPRG00000012767 (Gene tree)
Gene ID: 109248954
Gene Symbol: URB2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_pardus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36525 bases
Position: chrKV860348.1:10136882-10173406
Accession: 109248954
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPRP00000022176	Urb2	PF10441.9	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPRT00000020669	URB2-201	5035	XM_019419063	ENSPPRP00000022176	1521 (aa)	XP_019274608	UPI000904E41A

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.803	ENSG00000135763	URB2	99	86.747	Homo_sapiens
ENSPPRG00000012767	URB2	89	35.448	ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	85.789	ENSAMEG00000009206	URB2	99	85.789	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.872	ENSAOCG00000019961	urb2	96	53.086	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.808	ENSAPEG00000005263	urb2	96	53.086	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.282	ENSATEG00000020930	urb2	99	33.974	Anabas_testudineus
ENSPPRG00000012767	URB2	97	50.365	ENSAPLG00000002998	URB2	100	50.365	Anas_platyrhynchos
ENSPPRG00000012767	URB2	100	48.131	ENSACAG00000001285	URB2	100	48.003	Anolis_carolinensis
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.118	ENSANAG00000033963	URB2	100	79.987	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000012767	URB2	89	34.852	ENSACLG00000009254	urb2	95	34.530	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000012767	URB2	100	35.810	ENSAMXG00000003474	urb2	100	35.746	Astyanax_mexicanus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	73.670	ENSBTAG00000010180	URB2	99	73.670	Bos_taurus
ENSPPRG00000012767	URB2	95	86.525	ENSCJAG00000010968	URB2	100	79.462	Callithrix_jacchus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	84.484	ENSCAFG00000012118	URB2	100	84.484	Canis_familiaris
ENSPPRG00000012767	URB2	93	83.744	ENSCAFG00020027217	URB2	99	83.744	Canis_lupus_dingo
ENSPPRG00000012767	URB2	99	73.670	ENSCHIG00000014513	URB2	99	73.670	Capra_hircus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	77.544	ENSTSYG00000006924	URB2	99	77.544	Carlito_syrichta
ENSPPRG00000012767	URB2	64	80.247	ENSCPOG00000020777	-	100	80.247	Cavia_porcellus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.724	ENSCCAG00000023932	URB2	100	79.593	Cebus_capucinus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.197	ENSCATG00000043366	URB2	100	80.197	Cercocebus_atys
ENSPPRG00000012767	URB2	100	74.327	ENSCLAG00000006268	URB2	100	74.327	Chinchilla_lanigera
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.131	ENSCSAG00000010599	URB2	100	80.131	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPRG00000012767	URB2	69	81.497	ENSCHOG00000010163	URB2	71	81.497	Choloepus_hoffmanni
ENSPPRG00000012767	URB2	100	54.727	ENSCPBG00000006191	URB2	100	54.727	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.066	ENSCANG00000023711	URB2	100	80.066	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	70.164	ENSCGRG00001009591	Urb2	100	70.164	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPRG00000012767	URB2	100	70.164	ENSCGRG00000011259	Urb2	100	70.164	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPRG00000012767	URB2	99	32.835	ENSCSEG00000000299	urb2	99	32.855	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.851	ENSCVAG00000011011	urb2	99	34.812	Cyprinodon_variegatus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	36.658	ENSDARG00000003217	urb2	94	60.194	Danio_rerio
ENSPPRG00000012767	URB2	97	61.554	ENSDNOG00000043064	URB2	99	61.673	Dasypus_novemcinctus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	72.197	ENSDORG00000014975	Urb2	100	72.197	Dipodomys_ordii
ENSPPRG00000012767	URB2	95	72.248	ENSETEG00000002869	URB2	95	72.248	Echinops_telfairi
ENSPPRG00000012767	URB2	99	81.418	ENSEASG00005012060	URB2	99	81.418	Equus_asinus_asinus
ENSPPRG00000012767	URB2	93	88.652	ENSECAG00000012338	URB2	99	88.652	Equus_caballus
ENSPPRG00000012767	URB2	92	82.979	ENSEEUG00000002669	URB2	92	82.979	Erinaceus_europaeus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	39.083	ENSELUG00000014647	urb2	99	39.263	Esox_lucius
ENSPPRG00000012767	URB2	100	97.962	ENSFCAG00000007662	URB2	100	97.962	Felis_catus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	49.388	ENSFALG00000003385	URB2	100	49.388	Ficedula_albicollis
ENSPPRG00000012767	URB2	100	73.031	ENSFDAG00000021079	URB2	100	73.031	Fukomys_damarensis
ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.263	ENSFHEG00000010357	urb2	99	34.405	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000012767	URB2	88	39.601	ENSGMOG00000012459	urb2	100	35.227	Gadus_morhua
ENSPPRG00000012767	URB2	100	50.482	ENSGALG00000011101	URB2	100	50.225	Gallus_gallus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	37.061	ENSGACG00000016179	urb2	99	37.037	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	54.493	ENSGAGG00000021879	URB2	100	54.493	Gopherus_agassizii
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.869	ENSGGOG00000025643	URB2	100	79.869	Gorilla_gorilla
ENSPPRG00000012767	URB2	99	53.086	ENSHBUG00000018469	urb2	96	53.086	Haplochromis_burtoni
ENSPPRG00000012767	URB2	97	74.579	ENSHGLG00000016561	URB2	99	74.579	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPRG00000012767	URB2	100	72.572	ENSHGLG00100001838	URB2	100	72.572	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPRG00000012767	URB2	100	35.159	ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.144	Ictalurus_punctatus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	72.554	ENSSTOG00000025323	URB2	100	72.554	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	71.840	ENSJJAG00000011998	Urb2	100	71.775	Jaculus_jaculus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	33.233	ENSKMAG00000020129	urb2	99	33.293	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	45.793	ENSLACG00000002038	URB2	100	46.114	Latimeria_chalumnae
ENSPPRG00000012767	URB2	100	40.736	ENSLOCG00000015462	urb2	100	40.633	Lepisosteus_oculatus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	76.559	ENSLAFG00000012484	URB2	100	76.559	Loxodonta_africana
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.118	ENSMFAG00000039905	URB2	100	80.118	Macaca_fascicularis
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.184	ENSMMUG00000009509	URB2	100	80.184	Macaca_mulatta
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.790	ENSMNEG00000038762	URB2	100	79.790	Macaca_nemestrina
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.000	ENSMLEG00000043252	URB2	100	80.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSPPRG00000012767	URB2	94	47.769	ENSMGAG00000012073	URB2	100	47.567	Meleagris_gallopavo
ENSPPRG00000012767	URB2	95	79.433	ENSMAUG00000017980	Urb2	100	67.978	Mesocricetus_auratus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	79.317	ENSMICG00000033302	URB2	99	79.317	Microcebus_murinus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	68.742	ENSMOCG00000020369	Urb2	100	68.742	Microtus_ochrogaster
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.259	ENSMALG00000006529	urb2	99	34.941	Monopterus_albus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	68.500	ENSMUSG00000031976	Urb2	100	68.500	Mus_musculus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	84.089	ENSMPUG00000012438	URB2	100	83.958	Mustela_putorius_furo
ENSPPRG00000012767	URB2	100	70.183	ENSNGAG00000016524	Urb2	100	70.183	Nannospalax_galili
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.869	ENSNLEG00000014450	URB2	100	79.869	Nomascus_leucogenys
ENSPPRG00000012767	URB2	91	61.709	ENSMEUG00000016434	URB2	94	61.709	Notamacropus_eugenii
ENSPPRG00000012767	URB2	92	74.723	ENSOPRG00000009906	URB2	92	74.476	Ochotona_princeps
ENSPPRG00000012767	URB2	100	73.867	ENSODEG00000005593	URB2	100	73.867	Octodon_degus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	37.436	ENSONIG00000017078	urb2	99	37.428	Oreochromis_niloticus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	51.569	ENSOANG00000013732	URB2	100	52.092	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	77.676	ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.676	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.180	ENSORLG00000010915	urb2	99	35.079	Oryzias_latipes
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.398	ENSORLG00020003361	urb2	99	35.280	Oryzias_latipes_hni
ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.458	ENSORLG00015001534	urb2	99	35.419	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.613	ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.512	Oryzias_melastigma
ENSPPRG00000012767	URB2	99	76.378	ENSOGAG00000003021	URB2	99	76.378	Otolemur_garnettii
ENSPPRG00000012767	URB2	99	73.145	ENSOARG00000003102	URB2	99	73.145	Ovis_aries
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.000	ENSPPAG00000040629	URB2	100	80.000	Pan_paniscus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	99.080	ENSPTIG00000012577	URB2	100	99.080	Panthera_tigris_altaica
ENSPPRG00000012767	URB2	100	80.000	ENSPTRG00000002092	URB2	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSPPRG00000012767	URB2	100	77.770	ENSPANG00000002245	URB2	100	77.770	Papio_anubis
ENSPPRG00000012767	URB2	100	40.077	ENSPKIG00000005787	urb2	100	40.077	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPRG00000012767	URB2	100	53.807	ENSPSIG00000002690	URB2	100	53.807	Pelodiscus_sinensis
ENSPPRG00000012767	URB2	96	69.795	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	69.795	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPRG00000012767	URB2	100	62.565	ENSPCIG00000030071	URB2	100	62.565	Phascolarctos_cinereus
ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.684	ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.796	Poecilia_formosa
ENSPPRG00000012767	URB2	99	33.702	ENSPLAG00000014654	urb2	99	34.014	Poecilia_latipinna
ENSPPRG00000012767	URB2	99	33.994	ENSPMEG00000012356	urb2	99	34.012	Poecilia_mexicana
ENSPPRG00000012767	URB2	99	33.951	ENSPREG00000010268	urb2	99	33.827	Poecilia_reticulata
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ENSPPRG00000012767	URB2	99	80.643	ENSPCOG00000023537	URB2	99	80.643	Propithecus_coquereli
ENSPPRG00000012767	URB2	100	66.689	ENSPVAG00000002108	URB2	100	66.689	Pteropus_vampyrus
ENSPPRG00000012767	URB2	89	34.821	ENSPNYG00000016840	urb2	95	34.502	Pundamilia_nyererei
ENSPPRG00000012767	URB2	100	37.236	ENSPNAG00000013684	urb2	100	37.227	Pygocentrus_nattereri
ENSPPRG00000012767	URB2	100	69.830	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	69.830	Rattus_norvegicus
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.672	ENSRBIG00000037937	URB2	100	79.672	Rhinopithecus_bieti
ENSPPRG00000012767	URB2	100	79.672	ENSRROG00000039854	URB2	100	79.672	Rhinopithecus_roxellana
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