EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPRG00000022092 (Gene tree)
Gene ID: 109277735
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_pardus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46170 bases
Position: chrKV860322.1:15305388-15351557
Accession: 109277735
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPRP00000029253	ResIII	PF04851.15	8.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPRT00000031671	SBNO1-201	4179	XM_019467636	ENSPPRP00000029253	1393 (aa)	XP_019323181	UPI000DE7C971

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.420	ENSG00000139697	SBNO1	99	98.420	Homo_sapiens
ENSPPRG00000022092	SBNO1	82	80.825	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.140	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	99.140	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.666	ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	Amphilophus_citrinellus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.228	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.421	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.228	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.421	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.980	ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	Anabas_testudineus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.241	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	92.247	Anas_platyrhynchos
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	87.562	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.562	Anolis_carolinensis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.204	ENSANAG00000029958	-	99	98.913	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.302	ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.465	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	79.516	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	80.228	Astyanax_mexicanus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.994	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	98.994	Bos_taurus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.348	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	98.348	Callithrix_jacchus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.354	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	99.354	Canis_familiaris
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.635	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	98.635	Canis_lupus_dingo
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.779	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.779	Capra_hircus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.779	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.779	Carlito_syrichta
ENSPPRG00000022092	SBNO1	95	98.271	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	98.396	Cavia_aperea
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.629	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	98.396	Cavia_porcellus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	93.970	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	93.970	Cebus_capucinus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	96.470	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	99.457	Cercocebus_atys
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.773	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	98.396	Chinchilla_lanigera
ENSPPRG00000022092	SBNO1	83	99.049	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	99.049	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	96	95.096	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	95.096	Choloepus_hoffmanni
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.391	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	92.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.898	ENSCANG00000042688	-	99	92.826	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.629	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	98.188	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.629	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	98.188	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.596	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	75.596	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.755	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	76.154	Cyprinodon_variegatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	79.372	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.800	Danio_rerio
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.868	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	98.458	Dasypus_novemcinctus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	83.966	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	83.966	Dipodomys_ordii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	93	90.686	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.686	Echinops_telfairi
ENSPPRG00000022092	SBNO1	75	62.884	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.663	Eptatretus_burgeri
ENSPPRG00000022092	SBNO1	51	94.922	ENSEASG00005012595	-	92	94.922	Equus_asinus_asinus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.210	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	99.210	Equus_caballus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	83	99.451	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	99.451	Erinaceus_europaeus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	78.059	ENSELUG00000002886	sbno1	99	78.129	Esox_lucius
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	100.000	ENSFCAG00000015331	SBNO1	100	100.000	Felis_catus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.241	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	92.319	Ficedula_albicollis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	96.193	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.193	Fukomys_damarensis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.847	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.037	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	94	78.234	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	Gadus_morhua
ENSPPRG00000022092	SBNO1	88	92.614	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.451	Gallus_gallus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.899	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.050	Gambusia_affinis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	94	79.252	ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	91.529	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.109	Gopherus_agassizii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.276	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	98.276	Gorilla_gorilla
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	68.567	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.821	Haplochromis_burtoni
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.917	ENSHGLG00000014165	-	99	99.275	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPRG00000022092	SBNO1	91	84.980	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	78.906	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.977	Ictalurus_punctatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.779	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.457	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.204	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	98.204	Jaculus_jaculus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.723	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	75.913	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.891	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	76.240	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	81.500	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.563	Latimeria_chalumnae
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	81.605	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	Lepisosteus_oculatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.557	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.557	Loxodonta_africana
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.276	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	98.276	Macaca_fascicularis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.276	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	98.276	Macaca_mulatta
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	96.552	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	99.457	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.899	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	76.039	Mastacembelus_armatus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.170	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	92.370	Meleagris_gallopavo
ENSPPRG00000022092	SBNO1	50	93.562	ENSMAUG00000004834	-	100	93.562	Mesocricetus_auratus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.629	ENSMICG00000006573	-	99	97.629	Microcebus_murinus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	94.046	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	97.683	Microtus_ochrogaster
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	71.741	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	71.992	Mola_mola
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	95.190	ENSMODG00000012470	SBNO1	99	95.190	Monodelphis_domestica
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.385	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.611	Monopterus_albus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	97.559	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	100	97.559	Mus_caroli
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	97.918	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	97.918	Mus_musculus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	97.918	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	97.918	Mus_pahari
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	97.703	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	97.703	Mus_spretus
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ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.420	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	98.420	Myotis_lucifugus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.348	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	99.408	Nannospalax_galili
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.320	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	74.483	Neolamprologus_brichardi
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	94.468	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	94.468	Nomascus_leucogenys
ENSPPRG00000022092	SBNO1	62	84.810	ENSMEUG00000008768	-	93	89.241	Notamacropus_eugenii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	94.692	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.620	Ochotona_princeps
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.629	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	97.629	Octodon_degus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.581	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.806	Oreochromis_niloticus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	98	96.791	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.791	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.018	ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.345	Oryzias_latipes
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.246	ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.457	Oryzias_latipes_hni
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.141	ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.352	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.193	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.474	Oryzias_melastigma
ENSPPRG00000022092	SBNO1	50	90.272	ENSOGAG00000010781	-	100	90.987	Otolemur_garnettii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.565	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.565	Ovis_aries
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.420	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	98.420	Pan_paniscus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.713	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	99.713	Panthera_tigris_altaica
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.491	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	98.491	Pan_troglodytes
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.276	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	99.457	Papio_anubis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	80.558	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.641	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPRG00000022092	SBNO1	92	88.112	ENSPSIG00000009256	-	100	88.112	Pelodiscus_sinensis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	91.571	ENSPSIG00000009572	-	99	91.559	Pelodiscus_sinensis
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.486	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.188	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	94.405	ENSPCIG00000010985	SBNO1	100	94.620	Phascolarctos_cinereus
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	76.127	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.277	Poecilia_formosa
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.986	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	76.314	Poecilia_latipinna
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	76.073	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	76.104	Poecilia_mexicana
ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.721	ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.874	Poecilia_reticulata
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ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.707	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	98.907	Propithecus_coquereli
ENSPPRG00000022092	SBNO1	87	99.404	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	99.404	Pteropus_vampyrus
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ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	79.418	ENSPNAG00000015622	sbno1	99	79.276	Pygocentrus_nattereri
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