EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPRG00000025077 (Gene tree)
Gene ID: 109259961
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_pardus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32356 bases
Position: chrKV860272.1:24826397-24858752
Accession: 109259961
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPRP00000000041	MMR_HSR1	PF01926.23	1.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPRT00000035197	RAB1A-201	2453	XM_019437979	ENSPPRP00000000041	205 (aa)	XP_019293524	UPI0000001259
ENSPPRT00000035200	RAB1A-204	390	-	ENSPPRP00000000044	129 (aa)	-	UPI000002B217
ENSPPRT00000035198	RAB1A-202	522	-	ENSPPRP00000000042	173 (aa)	-	UPI00005994D2
ENSPPRT00000035199	RAB1A-203	426	-	ENSPPRP00000000043	141 (aa)	-	UPI000002B216

Gene Model

Click here to download ENSPPRG00000025077's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPRG00000025077's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPRG00000025077	RAB1A	85	52.299	ENSPPRG00000010471	RAB11A	81	52.299
ENSPPRG00000025077	RAB1A	90	48.108	ENSPPRG00000012945	RAB2A	99	45.238
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	47.619	ENSPPRG00000023944	RAB33A	71	47.619
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	37.805	ENSPPRG00000007389	KRAS	95	35.912
ENSPPRG00000025077	RAB1A	95	37.629	ENSPPRG00000016807	RAB22A	97	37.629
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	93.069	ENSPPRG00000010280	-	100	93.069
ENSPPRG00000025077	RAB1A	57	32.203	ENSPPRG00000022808	ARL8B	61	32.203
ENSPPRG00000025077	RAB1A	76	39.623	ENSPPRG00000011181	RAB9B	79	39.623
ENSPPRG00000025077	RAB1A	57	31.092	ENSPPRG00000016572	ARL4C	61	31.092
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	35.928	ENSPPRG00000005624	MRAS	80	35.928
ENSPPRG00000025077	RAB1A	88	46.703	ENSPPRG00000010314	RAB18	93	45.361
ENSPPRG00000025077	RAB1A	81	46.988	ENSPPRG00000006611	RAB25	78	46.988
ENSPPRG00000025077	RAB1A	84	32.948	ENSPPRG00000012453	RAB23	73	32.948
ENSPPRG00000025077	RAB1A	82	32.544	ENSPPRG00000018707	RHEB	91	32.544
ENSPPRG00000025077	RAB1A	95	43.814	ENSPPRG00000001655	-	90	43.814
ENSPPRG00000025077	RAB1A	78	39.264	ENSPPRG00000003104	-	79	39.264
ENSPPRG00000025077	RAB1A	87	32.973	ENSPPRG00000003131	RERG	90	32.973
ENSPPRG00000025077	RAB1A	62	35.878	ENSPPRG00000021892	ARL14	65	35.878
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	50.909	ENSPPRG00000007555	RAB15	78	50.909
ENSPPRG00000025077	RAB1A	94	36.410	ENSPPRG00000023437	RAB6B	94	36.410
ENSPPRG00000025077	RAB1A	71	36.986	ENSPPRG00000008185	HRAS	84	36.986
ENSPPRG00000025077	RAB1A	81	50.602	ENSPPRG00000023881	RAB30	82	50.602
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	53.960	ENSPPRG00000013225	RAB35	100	53.960
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	42.169	ENSPPRG00000003974	RAB17	77	42.169
ENSPPRG00000025077	RAB1A	94	38.384	ENSPPRG00000009543	RAB6A	94	38.384
ENSPPRG00000025077	RAB1A	86	43.820	ENSPPRG00000017193	RAB39B	84	43.820
ENSPPRG00000025077	RAB1A	95	38.660	ENSPPRG00000015082	RAB31	97	38.660
ENSPPRG00000025077	RAB1A	90	55.435	ENSPPRG00000008865	-	90	55.435
ENSPPRG00000025077	RAB1A	95	42.564	ENSPPRG00000005745	RAB5C	89	42.564
ENSPPRG00000025077	RAB1A	82	50.296	ENSPPRG00000024521	RAB12	69	50.296
ENSPPRG00000025077	RAB1A	78	38.650	ENSPPRG00000014170	RAB36	55	38.650
ENSPPRG00000025077	RAB1A	90	48.649	ENSPPRG00000005831	RAB2B	86	48.649
ENSPPRG00000025077	RAB1A	57	31.933	ENSPPRG00000015025	ARL4A	59	31.933
ENSPPRG00000025077	RAB1A	57	34.746	ENSPPRG00000003884	ARL8A	63	35.052
ENSPPRG00000025077	RAB1A	77	39.752	ENSPPRG00000001286	RAB34	62	39.752
ENSPPRG00000025077	RAB1A	76	39.623	ENSPPRG00000017129	RAB9A	79	39.623
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	38.415	ENSPPRG00000007102	NRAS	86	38.415
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	44.554	ENSPPRG00000021393	RAB14	93	44.554
ENSPPRG00000025077	RAB1A	80	52.727	ENSPPRG00000010160	RAB11B	81	52.727
ENSPPRG00000025077	RAB1A	73	36.184	ENSPPRG00000014642	-	63	36.184
ENSPPRG00000025077	RAB1A	83	43.429	ENSPPRG00000006119	RAB33B	76	43.429
ENSPPRG00000025077	RAB1A	69	32.215	ENSPPRG00000015764	ARL4D	73	32.215

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	97.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSPPRG00000025077	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSPPRG00000025077	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.552	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.588	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSPCIG00000023212	RAB1A	100	99.512	Phascolarctos_cinereus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	93.137	ENSPFOG00000000498	-	99	93.137	Poecilia_formosa
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.059	ENSPLAG00000015592	-	100	94.059	Poecilia_latipinna
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.059	ENSPMEG00000005288	-	100	94.059	Poecilia_mexicana
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	Pongo_abelii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSPCOG00000017244	RAB1A	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.040	ENSPNYG00000015841	-	100	96.040	Pundamilia_nyererei
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSRNOG00000004992	Rab1a	100	100.000	Rattus_norvegicus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSSBOG00000023732	RAB1A	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPRG00000025077	RAB1A	98	98.010	ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	Sarcophilus_harrisii
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	ENSSMAG00000021049	-	100	95.545	Scophthalmus_maximus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	96.040	ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	Seriola_dumerili
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	99.512	ENSSPUG00000012822	RAB1A	100	99.512	Sphenodon_punctatus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	Stegastes_partitus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	97.073	ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	Taeniopygia_guttata
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.050	ENSTRUG00000024994	RAB1A	100	95.050	Takifugu_rubripes
ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	ENSUMAG00000021038	RAB1A	99	100.000	Ursus_maritimus
ENSPPRG00000025077	RAB1A	97	99.495	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	99.495	Vicugna_pacos
ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus