EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000000900 (Gene tree)
Gene ID: 100440626
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26561 bases
Position: chr1:101275653-101302213
Accession: 17348
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000001054	PRP3	PF08572.10	1.3e-79	1	1
ENSPPYP00000001054	PWI	PF01480.17	2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000001088	PRPF3-201	2789	-	ENSPPYP00000001054	640 (aa)	-	H2N5Z7

Gene Model

Click here to download ENSPPYG00000000900's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPYG00000000900's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000000900	PRPF3	80	87.549	ENSPPYG00000018646	-	100	87.549

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSG00000117360	PRPF3	93	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.606	ENSAPOG00000015584	prpf3	93	71.212	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSAMEG00000001630	PRPF3	93	99.843	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.865	ENSACIG00000007876	prpf3	93	69.803	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.848	ENSAOCG00000011449	prpf3	93	71.145	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.076	ENSATEG00000023583	prpf3	93	70.534	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	94.654	ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	94.654	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	92.175	ENSACAG00000003176	PRPF3	93	92.488	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	93	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.318	ENSACLG00000020127	prpf3	93	71.008	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	73.263	ENSAMXG00000007306	prpf3	93	72.810	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	93	100.000	Bos_taurus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	80	38.417	WBGene00010844	prp-3	75	38.566	Caenorhabditis_elegans
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	93	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	93	100.000	Canis_familiaris
ENSPPYG00000000900	PRPF3	85	100.000	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	93	100.000	Capra_hircus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.370	ENSTSYG00000001383	PRPF3	93	99.370	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000000900	PRPF3	92	80.952	ENSCAPG00000017812	PRPF3	87	81.463	Cavia_aperea
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.528	ENSCPOG00000008068	PRPF3	93	99.528	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	93	100.000	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	83.438	ENSCATG00000041778	PRPF3	84	97.872	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSCLAG00000015009	PRPF3	93	99.843	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000000900	PRPF3	75	100.000	ENSCHOG00000011645	PRPF3	70	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	96.069	ENSCPBG00000008216	PRPF3	93	96.069	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	58	58.466	ENSCING00000003312	-	90	57.937	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	81	53.524	ENSCSAVG00000008720	-	86	54.331	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.213	ENSCANG00000036769	PRPF3	93	99.213	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	93	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	93	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.192	ENSCSEG00000002532	prpf3	93	69.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.233	ENSCVAG00000009318	prpf3	93	70.928	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	72.214	ENSDARG00000086425	prpf3	100	66.667	Danio_rerio
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	88.661	ENSDNOG00000005904	PRPF3	92	89.921	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	92	99.659	ENSDORG00000008664	Prpf3	92	99.659	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	78	51.931	FBgn0036915	Prp3	90	52.096	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	98.898	ENSETEG00000019124	PRPF3	93	98.898	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	62.865	ENSEBUG00000011680	prpf3	93	62.737	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSEASG00005001566	PRPF3	93	99.843	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	99	100.000	Equus_caballus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	83	99.291	ENSEEUG00000007338	PRPF3	78	99.291	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	63.859	ENSELUG00000013624	prpf3	92	64.319	Esox_lucius
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	93	100.000	Felis_catus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSFDAG00000010365	PRPF3	93	99.685	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.914	ENSFHEG00000021746	prpf3	93	71.605	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.152	ENSGMOG00000008535	prpf3	93	70.000	Gadus_morhua
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	94.497	ENSGALG00000028205	PRPF3	93	94.497	Gallus_gallus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.231	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	66.998	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.015	ENSGACG00000011792	prpf3	93	70.320	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	95.755	ENSGAGG00000013765	PRPF3	91	95.409	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	84	100.000	ENSGGOG00000013174	PRPF3	92	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.783	ENSHBUG00000003493	prpf3	93	71.473	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.134	ENSHGLG00000016033	-	91	69.764	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSHGLG00000016569	PRPF3	93	99.685	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.764	ENSHGLG00100008951	-	86	90.909	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSHGLG00100007590	PRPF3	93	99.685	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	67.481	ENSHCOG00000014058	prpf3	93	67.176	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	72.282	ENSIPUG00000000902	PRPF3	93	72.630	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	93	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.665	ENSKMAG00000001390	prpf3	93	69.360	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.173	ENSLBEG00000026310	prpf3	93	70.152	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	82.418	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSLAFG00000004713	PRPF3	93	99.685	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	98	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	96	100.000	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	100.000	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	98	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	65.566	ENSMLEG00000041065	-	90	64.937	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	84	100.000	ENSMLEG00000040609	PRPF3	92	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.973	ENSMAMG00000014968	prpf3	93	70.821	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.624	ENSMZEG00005015970	prpf3	93	69.277	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	94.497	ENSMGAG00000000707	PRPF3	93	94.497	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSMAUG00000017112	Prpf3	93	99.685	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSMICG00000015386	PRPF3	93	99.685	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSMOCG00000000242	Prpf3	93	99.843	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	65.008	ENSMMOG00000016131	prpf3	93	66.058	Mola_mola
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	98.268	ENSMODG00000018774	PRPF3	95	98.534	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000000900	PRPF3	96	70.952	ENSMALG00000007257	prpf3	90	71.270	Monopterus_albus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.528	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	93	99.528	Mus_caroli
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.528	ENSMUSG00000015748	Prpf3	93	99.528	Mus_musculus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.370	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	93	99.370	Mus_pahari
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.528	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	93	99.528	Mus_spretus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	96.378	ENSMPUG00000005080	PRPF3	93	96.378	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.371	ENSMLUG00000004646	-	93	99.371	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.461	ENSNBRG00000003462	prpf3	93	69.162	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000000900	PRPF3	96	100.000	ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000000900	PRPF3	81	100.000	ENSMEUG00000008733	PRPF3	82	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.685	ENSOPRG00000010139	PRPF3	93	99.685	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.370	ENSODEG00000011363	-	93	99.370	Octodon_degus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	73.676	ENSODEG00000014412	-	93	73.676	Octodon_degus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.578	ENSONIG00000006394	prpf3	93	69.428	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	64.844	ENSOANG00000015441	PRPF3	93	64.531	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	93	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.865	ENSORLG00000010330	prpf3	98	70.732	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.865	ENSORLG00020009054	prpf3	98	70.732	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.799	ENSORLG00015015016	prpf3	93	70.840	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.923	ENSOMEG00000000940	prpf3	93	70.615	Oryzias_melastigma
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	93.396	ENSOGAG00000005352	PRPF3	93	93.396	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSOARG00000020798	PRPF3	93	100.000	Ovis_aries
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSPPAG00000030983	PRPF3	93	99.843	Pan_paniscus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	75.316	ENSPPAG00000043769	-	97	74.426	Pan_paniscus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	93	100.000	Panthera_pardus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	93	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	93	100.000	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	74.367	ENSPTRG00000047819	-	92	73.892	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSPANG00000000499	PRPF3	93	99.843	Papio_anubis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	73.201	ENSPKIG00000010501	prpf3	93	73.354	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	95.755	ENSPSIG00000014877	PRPF3	93	95.597	Pelodiscus_sinensis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	66.252	ENSPMGG00000007776	prpf3	92	65.319	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSPEMG00000011672	Prpf3	93	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	60	71.026	ENSPMAG00000005588	prpf3	89	68.395	Petromyzon_marinus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	98.268	ENSPCIG00000008795	PRPF3	93	98.268	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.277	ENSPFOG00000013638	prpf3	93	70.669	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.692	ENSPLAG00000018103	prpf3	93	71.319	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.385	ENSPMEG00000023546	prpf3	93	71.077	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.012	ENSPREG00000017216	prpf3	93	70.706	Poecilia_reticulata
ENSPPYG00000000900	PRPF3	85	98.895	ENSPCAG00000014908	PRPF3	80	98.895	Procavia_capensis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.843	ENSPCOG00000013828	PRPF3	93	99.843	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.055	ENSPVAG00000013472	PRPF3	93	99.055	Pteropus_vampyrus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.783	ENSPNYG00000004279	prpf3	93	71.473	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.903	ENSPNAG00000001799	prpf3	93	72.054	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.370	ENSRNOG00000025629	Prpf3	96	99.349	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	81	94.624	ENSRBIG00000028854	PRPF3	90	94.624	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSRROG00000027464	PRPF3	98	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	92.441	ENSSBOG00000033104	PRPF3	93	98.936	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	98.113	ENSSHAG00000009548	PRPF3	93	98.113	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	72.659	ENSSFOG00015022014	prpf3	93	72.205	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	70.677	ENSSMAG00000015739	prpf3	93	70.376	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	67.643	ENSSDUG00000006840	prpf3	92	67.643	Seriola_dumerili
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.715	ENSSLDG00000015423	prpf3	93	70.015	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	99.370	ENSSARG00000011064	PRPF3	93	99.370	Sorex_araneus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	92.570	ENSSPUG00000000809	PRPF3	93	92.570	Sphenodon_punctatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	69.954	ENSSPAG00000018721	prpf3	93	70.865	Stegastes_partitus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSSSCG00000030119	PRPF3	99	100.000	Sus_scrofa
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	79.717	ENSTGUG00000004552	PRPF3	93	79.717	Taeniopygia_guttata
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.073	ENSTRUG00000014923	prpf3	93	70.762	Takifugu_rubripes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.689	ENSTNIG00000008058	prpf3	93	70.427	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	80	100.000	ENSTBEG00000014072	PRPF3	81	100.000	Tupaia_belangeri
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	93.228	ENSTTRG00000010616	PRPF3	93	93.228	Tursiops_truncatus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	78	100.000	ENSUAMG00000009345	PRPF3	91	100.000	Ursus_americanus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSUMAG00000003720	PRPF3	93	100.000	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000000900	PRPF3	88	100.000	ENSVPAG00000005425	PRPF3	82	100.000	Vicugna_pacos
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	100.000	ENSVVUG00000007933	PRPF3	98	100.000	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	87.832	ENSXETG00000018654	prpf3	93	87.832	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.231	ENSXMAG00000016347	prpf3	93	70.859	Xiphophorus_maculatus