EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000001713 (Gene tree)
Gene ID: 100442603
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10346 bases
Position: chr1:205160757-205171102
Accession: 100442603
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000001980	SYF2	PF08231.12	2.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000002042	SYF2-201	1776	-	ENSPPYP00000001980	243 (aa)	XP_002811315	H2N8J1

Gene Model

Click here to download ENSPPYG00000001713's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPYG00000001713's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.765	ENSG00000117614	SYF2	100	98.765	Homo_sapiens
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.508	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000001713	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000001713	SYF2	98	92.946	ENSAMEG00000010115	-	99	92.946	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.735	ENSACIG00000023688	syf2	88	81.735	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000001713	SYF2	98	80.252	ENSAOCG00000022046	syf2	99	80.252	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000001713	SYF2	88	79.452	ENSAOCG00000010912	syf2	68	79.452	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000001713	SYF2	95	80.932	ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.932	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000001713	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	92	83.486	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000001713	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000001713	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000001713	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.471	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000001713	SYF2	94	80.702	ENSAMXG00000004051	syf2	95	80.702	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.492	Bos_taurus
ENSPPYG00000001713	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.639	Caenorhabditis_elegans
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.443	ENSCAFG00000012895	-	99	93.443	Canis_familiaris
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	83.128	ENSCAFG00000030331	-	100	83.128	Canis_familiaris
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.443	ENSCAFG00020021091	-	99	93.443	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000001713	SYF2	74	89.011	ENSCAFG00020021094	-	83	97.436	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	Capra_hircus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.827	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000001713	SYF2	81	98.990	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	Cavia_aperea
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.443	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	98.354	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	ENSCATG00000026917	SYF2	100	97.942	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	94.672	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.942	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000001713	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	77.348	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000001713	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	87.446	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000001713	SYF2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000001713	SYF2	87	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	84.774	ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.774	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000001713	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.059	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	77.917	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.917	Danio_rerio
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.827	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.827	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	92.149	ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	56.818	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000001713	SYF2	94	77.293	ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000001713	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.837	ENSEASG00005004224	-	100	91.837	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	81.893	ENSEASG00005004232	-	100	81.893	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	92.975	ENSECAG00000010440	-	99	93.277	Equus_caballus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.878	ENSECAG00000012023	-	100	93.878	Equus_caballus
ENSPPYG00000001713	SYF2	75	81.421	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	80.672	ENSELUG00000003465	syf2	100	80.672	Esox_lucius
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.852	ENSFCAG00000043095	-	99	93.852	Felis_catus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	94.286	ENSFCAG00000010324	-	85	94.286	Felis_catus
ENSPPYG00000001713	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.034	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.827	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSPPYG00000001713	SYF2	92	88.393	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	Gallus_gallus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	73.859	ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.859	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000001713	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	92	89.286	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.879	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.177	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	99.177	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.471	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000001713	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	99	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000001713	SYF2	98	78.008	ENSHCOG00000012904	syf2	79	78.008	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000001713	SYF2	91	83.258	ENSIPUG00000019859	syf2	93	83.258	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	60	97.945	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	76.667	ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	99	79.237	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	99	80.417	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000001713	SYF2	97	80.851	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.653	ENSLAFG00000023150	-	100	92.653	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000001713	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	98.354	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	98.354	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	98.354	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.942	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000001713	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.833	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	95	77.966	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.966	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000001713	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000001713	SYF2	82	98.492	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.770	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	79.909	ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	Mola_mola
ENSPPYG00000001713	SYF2	93	88.546	ENSMODG00000013951	-	99	88.546	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	76.763	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.178	Monopterus_albus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.770	Mus_caroli
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.770	Mus_musculus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.770	Mus_pahari
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.770	Mus_spretus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.852	ENSMPUG00000015802	-	99	93.852	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000001713	SYF2	98	94.167	ENSMPUG00000015801	-	98	94.167	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000001713	SYF2	98	93.697	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.917	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000001713	SYF2	97	71.667	ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.667	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.588	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	95.279	ENSODEG00000017664	-	98	95.279	Octodon_degus
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	84.979	ENSODEG00000014338	-	98	84.979	Octodon_degus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.471	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000001713	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	95.082	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.648	ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.648	ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.562	ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	Oryzias_melastigma
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	94.215	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.713	Ovis_aries
ENSPPYG00000001713	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.177	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	99.177	Pan_paniscus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.902	ENSPPRG00000001638	-	100	93.902	Panthera_pardus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.852	ENSPPRG00000001651	-	99	93.852	Panthera_pardus
ENSPPYG00000001713	SYF2	93	96.903	ENSPTIG00000005711	-	82	96.903	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.443	ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.177	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	99.177	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSPANG00000008139	SYF2	100	98.354	Papio_anubis
ENSPPYG00000001713	SYF2	95	80.687	ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.687	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	85.837	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	Pelodiscus_sinensis
ENSPPYG00000001713	SYF2	97	77.966	ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000001713	SYF2	93	93.778	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	93.013	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	ENSPFOG00000004116	syf2	90	80.275	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	ENSPLAG00000006691	syf2	94	80.275	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	73.504	ENSPMEG00000011684	syf2	93	77.523	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000001713	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	99	75.417	Poecilia_reticulata
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	63.786	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.374	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	81.893	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	Pteropus_vampyrus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	ENSPNYG00000004979	syf2	100	76.471	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	79.424	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.770	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	95.885	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.885	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	ENSRROG00000001347	SYF2	100	98.354	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.119	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000001713	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000001713	SYF2	93	92.000	ENSSHAG00000015630	-	92	91.228	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	84.404	ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.404	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.651	ENSSMAG00000009867	syf2	92	81.651	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	92	83.028	Seriola_dumerili
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	74.590	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	Sorex_araneus
ENSPPYG00000001713	SYF2	95	86.266	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.266	Sphenodon_punctatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	95	79.237	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	Stegastes_partitus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	91.770	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	Sus_scrofa
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.193	ENSTRUG00000001499	syf2	88	81.193	Takifugu_rubripes
ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	71.193	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	Tupaia_belangeri
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	Tursiops_truncatus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	92.623	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	Ursus_americanus
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.033	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.033	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.033	Vicugna_pacos
ENSPPYG00000001713	SYF2	84	97.073	ENSVVUG00000027181	-	100	89.919	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.443	ENSVVUG00000027175	-	99	93.443	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000001713	SYF2	96	82.403	ENSXETG00000022797	syf2	94	82.403	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000001713	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.817	Xiphophorus_maculatus