EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000005027 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23798 bases
Position: chr12:122541666-122565463
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000005729	RRM_1	PF00076.22	3e-31	1	2
ENSPPYP00000005729	RRM_1	PF00076.22	3e-31	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000005949	MSI1-201	1089	-	ENSPPYP00000005729	362 (aa)	-	H2NIV3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000005027	MSI1	52	40.385	ENSPPYG00000009316	DAZAP1	55	40.385
ENSPPYG00000005027	MSI1	50	36.813	ENSPPYG00000003855	-	75	34.440
ENSPPYG00000005027	MSI1	50	39.560	ENSPPYG00000001012	-	61	40.741
ENSPPYG00000005027	MSI1	51	39.286	ENSPPYG00000013564	-	61	39.153
ENSPPYG00000005027	MSI1	52	35.602	ENSPPYG00000004746	-	67	32.184
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	65.201	ENSPPYG00000008244	-	100	67.033
ENSPPYG00000005027	MSI1	50	40.761	ENSPPYG00000017853	-	72	41.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSG00000135097	MSI1	100	99.171	Homo_sapiens
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.967	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	82.967	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.425	ENSAPOG00000023458	-	100	83.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000005027	MSI1	91	81.763	ENSACIG00000017754	-	78	81.763	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.967	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	82.967	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	76.608	ENSAOCG00000009031	-	95	76.901	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.967	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	82.967	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.425	ENSAPEG00000006857	-	84	83.425	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	78.142	ENSATEG00000023779	-	100	78.142	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	95.592	ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.592	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000005027	MSI1	82	95.302	ENSANAG00000027901	-	92	95.302	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSANAG00000027151	MSI1	100	99.171	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.418	ENSACLG00000011230	MSI1	100	82.418	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.149	ENSACLG00000000117	-	100	84.457	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.171	Bos_taurus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	99.171	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.895	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	98.895	Canis_familiaris
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	93.767	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	93.767	Capra_hircus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.123	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.123	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	99.171	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSCATG00000030019	MSI1	100	99.171	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.123	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.123	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000005027	MSI1	75	95.307	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	95.307	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	95.028	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.028	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.171	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	77.419	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.419	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.692	ENSCSEG00000005834	-	100	82.692	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.320	ENSCSEG00000008352	-	100	82.320	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000005027	MSI1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.425	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	83.425	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSPPYG00000005027	MSI1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSEASG00005004736	MSI1	100	99.171	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSECAG00000017526	MSI1	100	99.171	Equus_caballus
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	79.558	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.558	Esox_lucius
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	80.352	ENSELUG00000023280	-	100	80.059	Esox_lucius
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.171	Felis_catus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.967	ENSFHEG00000003560	-	100	82.967	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.702	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	83.702	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	75.758	ENSGMOG00000017838	-	100	75.758	Gadus_morhua
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	81.768	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	81.492	Gadus_morhua
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.189	Gallus_gallus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	84.503	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.503	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	65.312	ENSGAFG00000005860	-	100	65.312	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.597	ENSGACG00000012679	MSI1	100	82.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	79.834	ENSGACG00000008674	-	100	79.834	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	94.751	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	94.751	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.149	ENSHBUG00000011841	-	100	83.149	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.418	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	82.418	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.895	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	98.895	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	80.059	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.059	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	78.962	ENSHCOG00000012067	-	100	78.962	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	81.492	ENSIPUG00000001976	msi1	100	81.492	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.702	ENSJJAG00000010643	-	100	83.425	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	99.171	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.873	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	82.873	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	82.698	ENSKMAG00000019877	-	100	82.698	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.418	ENSLBEG00000001375	-	100	82.418	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.425	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	83.425	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	86.550	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.550	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000005027	MSI1	50	67.273	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	67.273	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	99.123	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.123	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000005027	MSI1	97	97.436	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	97.436	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	99.171	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000005027	MSI1	96	85.100	ENSMAMG00000018426	-	100	82.967	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.597	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.597	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.149	ENSMZEG00005000340	-	100	83.149	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	82.418	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.418	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000005027	MSI1	64	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000005027	MSI1	71	98.765	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.765	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	99.171	ENSMICG00000033181	MSI1	100	99.171	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.895	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	98.895	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	75.439	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	75.439	Mola_mola
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	82.067	ENSMMOG00000012265	-	96	82.067	Mola_mola
ENSPPYG00000005027	MSI1	91	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000005027	MSI1	98	84.164	ENSMALG00000001426	-	100	84.164	Monopterus_albus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.149	ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.149	Monopterus_albus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.619	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	98.619	Mus_caroli
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.619	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	98.619	Mus_musculus
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.343	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	98.343	Mus_pahari
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.619	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	98.619	Mus_spretus
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000005027	MSI1	94	100.000	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000005027	MSI1	100	83.149	ENSNBRG00000000841	-	100	83.149	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000005027	MSI1	88	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000005027	MSI1	91	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
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