EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000008320 (Gene tree)
Gene ID: 100173557
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 52941 bases
Position: chr17:44537638-44590578
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000009352	GTP_EFTU	PF00009.27	1.4e-43	1	1
ENSPPYP00000009353	GTP_EFTU	PF00009.27	1.5e-43	1	1
ENSPPYP00000009353	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.3e-13	1	1
ENSPPYP00000009352	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.6e-13	1	1
ENSPPYP00000009353	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-23	1	1
ENSPPYP00000009352	EFG_IV	PF03764.18	1.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000009729	EFTUD2-201	4453	-	ENSPPYP00000009352	972 (aa)	-	H2NTS7
ENSPPYT00000009730	EFTUD2-202	4408	-	ENSPPYP00000009353	957 (aa)	-	H2NTS8

Gene Model

Click here to download ENSPPYG00000008320's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPYG00000008320's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	86	39.181	ENSPPYG00000009393	EEF2	97	39.181
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	53	40.449	ENSPPYG00000015556	GFM2	60	40.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	90.844	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.354	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.408	ENSACIG00000009096	eftud2	100	89.200	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	88	88.228	ENSAOCG00000023385	eftud2	99	88.228	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.152	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	90.947	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.461	ENSATEG00000000457	eftud2	100	91.255	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	99	92.894	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	92.894	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.296	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.296	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.853	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.853	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	ENSACLG00000001296	eftud2	100	90.844	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.379	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.276	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	98.045	Bos_taurus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	99	69.333	WBGene00001166	eftu-2	99	69.128	Caenorhabditis_elegans
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.957	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.957	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.354	Canis_familiaris
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.354	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.045	Capra_hircus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.148	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.531	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	97.531	Cavia_aperea
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.531	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.531	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.560	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.560	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.428	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.428	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.560	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	91	87.275	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	87.275	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.222	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.222	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	76.513	ENSCING00000009372	-	100	76.513	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	99	76.986	ENSCSAVG00000004985	-	98	80.072	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.560	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.045	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	98.045	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.432	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	90.844	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.723	ENSDARG00000012261	eftud2	100	89.815	Danio_rerio
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.942	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.942	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.942	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.942	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	74.154	FBgn0039566	CG4849	100	74.154	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.354	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.251	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.251	Equus_caballus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.712	ENSELUG00000017169	eftud2	100	89.712	Esox_lucius
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.251	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.251	Felis_catus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.502	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	96.502	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.737	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.737	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.152	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	90.947	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.021	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	90.432	Gadus_morhua
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.605	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	97.091	Gallus_gallus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	90.741	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.329	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.560	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	90.741	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.325	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.325	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.325	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.325	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.815	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	89.815	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.021	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	90.638	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	92.078	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	92.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	96	97.970	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.970	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	90.329	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	95	90.399	ENSLBEG00000005875	eftud2	99	92.747	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	93.004	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.525	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	90.947	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.840	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.560	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.560	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.560	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.358	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	91.152	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	90.844	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.612	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	96.612	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	98.045	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.560	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	ENSMOCG00000009039	-	100	98.148	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	91	83.200	ENSMOCG00000017653	-	90	83.200	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	88	94.055	ENSMMOG00000020811	eftud2	99	94.055	Mola_mola
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.148	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	88	92.390	ENSMALG00000014501	eftud2	99	92.390	Monopterus_albus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.840	Mus_caroli
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.840	Mus_musculus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.840	Mus_pahari
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.840	Mus_spretus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	98.093	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.093	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.354	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.045	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	90.741	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	96.706	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.706	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	94.547	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.547	Notamacropus_eugenii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.021	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.021	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.119	ENSODEG00000018041	-	100	97.119	Octodon_degus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	ENSONIG00000000912	eftud2	100	90.844	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.354	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.638	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	ENSORLG00020009865	eftud2	100	90.535	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	ENSORLG00015002611	eftud2	100	92.266	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.594	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.594	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	98.045	Ovis_aries
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.457	Pan_paniscus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.354	Panthera_pardus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.354	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.457	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.560	Papio_anubis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	93	95.590	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	95.590	Pelodiscus_sinensis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	83.419	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	83.316	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	98.045	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.251	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.251	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	90.741	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	90.741	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	90.741	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	94.239	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.239	Procavia_capensis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.457	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	93.416	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.416	Pteropus_vampyrus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	90.741	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.152	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.840	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	98.457	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.457	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	33.893	YKL173W	SNU114	97	33.730	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.560	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	98.188	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.188	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.329	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	90.329	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	90.638	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.152	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	90.947	Seriola_dumerili
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.255	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.712	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.712	Sorex_araneus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.193	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.193	Sphenodon_punctatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.255	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.049	Stegastes_partitus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.148	Sus_scrofa
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	84	95.499	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	95.499	Taeniopygia_guttata
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.123	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	89.918	Takifugu_rubripes
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	87.487	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.280	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	92.901	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.901	Tupaia_belangeri
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.506	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.506	Tursiops_truncatus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.228	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.228	Ursus_americanus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.354	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.354	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	93.497	ENSXETG00000003394	eftud2	98	94.450	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	81	93.677	ENSXCOG00000017309	eftud2	95	93.677	Xiphophorus_couchianus
ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	90.741	Xiphophorus_maculatus