EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000012360 (Gene tree)
Gene ID: 100447267
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44404 bases
Position: chr2a:45702576-45746979
Accession: 100447267
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000024627	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-05	1	1
ENSPPYP00000013783	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000033890	RAB1A-201	1004	-	ENSPPYP00000024627	205 (aa)	XP_002812010	K7EVP1
ENSPPYT00000014342	RAB1A-202	2242	-	ENSPPYP00000013783	205 (aa)	-	H2P612

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon05134	Legionellosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000012360	RAB1A	57	34.746	ENSPPYG00000000352	ARL8A	61	34.746
ENSPPYG00000012360	RAB1A	84	33.526	ENSPPYG00000016739	RAB23	73	33.526
ENSPPYG00000012360	RAB1A	57	32.203	ENSPPYG00000013694	ARL8B	62	32.203
ENSPPYG00000012360	RAB1A	84	35.028	ENSPPYG00000002868	HRAS	93	35.028
ENSPPYG00000012360	RAB1A	80	47.619	ENSPPYG00000020713	RAB33A	71	47.619
ENSPPYG00000012360	RAB1A	81	46.386	ENSPPYG00000000730	RAB25	78	46.386
ENSPPYG00000012360	RAB1A	96	51.269	ENSPPYG00000000790	-	97	51.269
ENSPPYG00000012360	RAB1A	80	37.576	ENSPPYG00000004369	KRAS	95	35.912
ENSPPYG00000012360	RAB1A	57	31.092	ENSPPYG00000013299	ARL4C	59	31.092
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	53.960	ENSPPYG00000005021	RAB35	100	53.960
ENSPPYG00000012360	RAB1A	94	36.410	ENSPPYG00000014116	RAB6B	94	36.410
ENSPPYG00000012360	RAB1A	75	37.179	ENSPPYG00000012000	-	65	37.179
ENSPPYG00000012360	RAB1A	78	39.264	ENSPPYG00000013431	RAB7A	79	39.264
ENSPPYG00000012360	RAB1A	80	38.415	ENSPPYG00000000997	NRAS	86	38.415
ENSPPYG00000012360	RAB1A	83	44.000	ENSPPYG00000015072	RAB33B	76	44.000
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	45.581	ENSPPYG00000009504	RAB11B	99	45.581
ENSPPYG00000012360	RAB1A	81	30.233	ENSPPYG00000012594	DNAJC27	63	30.233
ENSPPYG00000012360	RAB1A	94	37.879	ENSPPYG00000003663	RAB6A	94	37.879
ENSPPYG00000012360	RAB1A	87	33.514	ENSPPYG00000004331	RERG	90	33.514
ENSPPYG00000012360	RAB1A	95	43.814	ENSPPYG00000014074	RAB5A	90	43.814
ENSPPYG00000012360	RAB1A	76	39.623	ENSPPYG00000020591	RAB9B	79	39.623
ENSPPYG00000012360	RAB1A	90	48.108	ENSPPYG00000005597	RAB2B	86	48.108
ENSPPYG00000012360	RAB1A	83	50.292	ENSPPYG00000009015	-	50	50.296
ENSPPYG00000012360	RAB1A	68	37.415	ENSPPYG00000016550	-	94	37.415
ENSPPYG00000012360	RAB1A	86	43.820	ENSPPYG00000020901	RAB39B	84	43.820
ENSPPYG00000012360	RAB1A	81	50.602	ENSPPYG00000003733	RAB30	82	50.602
ENSPPYG00000012360	RAB1A	95	39.086	ENSPPYG00000011171	RAB22A	97	39.086
ENSPPYG00000012360	RAB1A	83	36.207	ENSPPYG00000014142	MRAS	83	36.207
ENSPPYG00000012360	RAB1A	95	43.590	ENSPPYG00000008398	RAB5C	89	43.590
ENSPPYG00000012360	RAB1A	85	52.299	ENSPPYG00000006573	RAB11A	81	52.299
ENSPPYG00000012360	RAB1A	88	46.703	ENSPPYG00000002172	RAB18	93	45.876
ENSPPYG00000012360	RAB1A	90	48.108	ENSPPYG00000018617	RAB2A	99	45.238
ENSPPYG00000012360	RAB1A	60	31.452	ENSPPYG00000025824	ARL4A	62	31.452
ENSPPYG00000012360	RAB1A	69	41.667	ENSPPYG00000008601	-	76	41.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	99.495	ENSCHIG00000014060	RAB1A	97	99.495	Capra_hircus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	98.020	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	98.020	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	98	99.497	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	99.495	ENSMMUG00000021721	RAB1A	92	99.495	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000012360	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	98.990	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000012360	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	96.535	ENSODEG00000011248	-	100	96.535	Octodon_degus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	99.495	ENSOARG00000019997	RAB1A	98	99.495	Ovis_aries
ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	99.495	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
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