EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000012383 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51279 bases
Position: chr2a:49347941-49399219
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000013810	CRM1_C	PF08767.11	6.5e-134	1	1
ENSPPYP00000013810	Xpo1	PF08389.12	1.5e-38	1	1
ENSPPYP00000013810	IBN_N	PF03810.19	1.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000014370	XPO1-201	4323	-	ENSPPYP00000013810	1034 (aa)	-	H2P637

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pon03013	RNA transport	KEGG
pon05164	Influenza A	KEGG
pon05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	89.423	ENSAPOG00000002354	xpo1a	99	89.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.437	ENSAPOG00000004984	-	100	92.437	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.336	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	95.336	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	95.620	ENSACIG00000010818	-	99	95.620	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	91.880	ENSACIG00000010259	xpo1a	99	91.880	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.437	ENSAOCG00000010121	-	99	93.803	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	88.422	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	88.422	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.437	ENSAPEG00000007038	-	99	93.803	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	91.880	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	91.880	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.437	ENSATEG00000008816	-	100	92.437	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	88.049	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	91.648	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.145	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	95.145	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.958	ENSACAG00000002501	XPO1	100	94.958	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSANAG00000020802	XPO1	100	96.545	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.250	ENSACLG00000015192	-	100	92.250	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	91.987	ENSACLG00000015669	xpo1a	99	91.987	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.717	ENSAMXG00000012704	xpo1b	99	94.130	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	93.085	ENSAMXG00000003069	xpo1a	99	93.085	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	95.425	Bos_taurus
ENSPPYG00000012383	XPO1	99	50.185	WBGene00002078	xpo-1	99	50.185	Caenorhabditis_elegans
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	96.545	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	95.425	Canis_familiaris
ENSPPYG00000012383	XPO1	93	94.980	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	94.980	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	95.425	Capra_hircus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.603	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	95.603	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000012383	XPO1	55	93.972	ENSCAPG00000006454	-	100	93.972	Cavia_aperea
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	93.832	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	93.832	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	77.087	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.273	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.693	ENSCATG00000032674	XPO1	99	99.786	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.145	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.145	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	96.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000012383	XPO1	82	94.828	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	94.828	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.051	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	95.051	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	78.119	ENSCING00000024562	-	100	78.119	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000012383	XPO1	99	77.124	ENSCSAVG00000005965	-	99	77.124	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.250	ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.304	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	94.304	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.304	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	94.304	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	94.973	ENSCSEG00000001693	XPO1	99	94.973	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.344	ENSCVAG00000016788	-	100	92.344	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	87.675	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	87.675	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	93.091	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	93.091	Danio_rerio
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	89.729	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	89.938	Danio_rerio
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.331	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	95.331	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000012383	XPO1	91	91.713	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.713	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000012383	XPO1	99	68.229	FBgn0020497	emb	99	68.229	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000012383	XPO1	94	96.344	ENSETEG00000018045	XPO1	94	96.344	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	80.128	ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSEASG00005007223	XPO1	100	95.425	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.331	Equus_caballus
ENSPPYG00000012383	XPO1	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	92.077	ENSELUG00000014306	-	99	92.077	Esox_lucius
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	94.231	ENSELUG00000012707	xpo1a	99	94.231	Esox_lucius
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	95.425	Felis_catus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.865	ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.865	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.030	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	96.030	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	87.955	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	87.955	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	89.076	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	89.076	Gadus_morhua
ENSPPYG00000012383	XPO1	94	95.080	ENSGMOG00000019063	-	91	95.080	Gadus_morhua
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.145	ENSGALG00000029476	XPO1	100	95.145	Gallus_gallus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	91.667	ENSGAFG00000004408	xpo1a	99	91.667	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	95.620	ENSGAFG00000003355	-	95	95.620	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.157	ENSGACG00000002743	-	100	92.157	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	87.862	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	87.862	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.958	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.958	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	96.545	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.344	ENSHBUG00000020037	-	100	92.344	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	88.515	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	88.515	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.051	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	95.051	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.051	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	95.051	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	94.444	ENSHCOG00000006949	XPO1	99	94.444	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	90.383	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	90.383	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.717	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	92.717	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.143	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.143	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.145	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	95.145	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.308	ENSKMAG00000016218	-	100	92.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	87.862	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	87.862	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	89.043	ENSLBEG00000002104	xpo1a	99	89.043	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	93.655	ENSLBEG00000005740	-	100	93.655	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	73.869	ENSLACG00000018213	XPO1	100	73.869	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	93.091	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	93.091	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.051	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	95.051	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	96.545	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	96.545	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	96.545	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	96.545	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.698	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	94.698	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.250	ENSMAMG00000010568	-	99	93.854	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	88.422	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	88.422	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	88.515	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	88.515	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	92.250	ENSMZEG00005018158	-	95	95.620	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000012383	XPO1	70	97.934	ENSMGAG00000001496	-	100	97.934	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.304	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	94.304	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSMICG00000027770	XPO1	100	95.425	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.761	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	94.761	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	95.406	ENSMMOG00000008001	-	99	95.406	Mola_mola
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	91.774	ENSMMOG00000018767	xpo1a	99	91.774	Mola_mola
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.118	ENSMODG00000002831	XPO1	100	94.118	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	91.970	ENSMALG00000007085	-	99	93.163	Monopterus_albus
ENSPPYG00000012383	XPO1	90	90.715	ENSMALG00000008617	xpo1a	99	90.715	Monopterus_albus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.585	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	94.585	Mus_caroli
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.585	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	94.585	Mus_musculus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.491	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	94.491	Mus_pahari
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	94.585	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	94.585	Mus_spretus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.425	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	95.425	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.331	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	95.331	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000012383	XPO1	100	95.331	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	95.331	Nannospalax_galili
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