EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000012392 (Gene tree)
Gene ID: 100172284
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45085 bases
Position: chr2a:50104509-50149593
Accession: 100172284
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000013823	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6e-28	1	2
ENSPPYP00000013823	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000014383	PAPOLG-201	7051	XM_002812007	ENSPPYP00000013823	736 (aa)	XP_002812053	H2P650

Gene Model

Click here to download ENSPPYG00000012392's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPYG00000012392's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	58.879	ENSPPYG00000006128	PAPOLA	98	59.151

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	99.049	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.193	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	94.444	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.444	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.471	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.377	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.193	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.460	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.326	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.594	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.557	ENSATEG00000009007	papolg	97	70.884	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	98	74.224	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.819	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	80	64.909	ENSACAG00000015048	-	100	64.909	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.234	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	98.234	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.271	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.013	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.980	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.980	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.602	Bos_taurus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.505	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.505	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.042	Canis_familiaris
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.976	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.976	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.467	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	Capra_hircus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	96.626	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.626	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	52	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.816	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.641	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.641	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	90	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.142	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.641	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	98.641	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	89	93.475	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	68	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	66	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.777	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	98.777	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	93.179	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.179	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	93.179	ENSCGRG00000005552	-	100	93.179	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.612	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.175	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.200	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	73.280	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.280	Danio_rerio
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.792	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.792	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	99.068	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	73.984	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.919	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	65	56.695	ENSEBUG00000005042	-	82	56.695	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	61	71.503	ENSEBUG00000004020	papolg	91	71.503	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.547	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	95.547	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.412	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	94.986	Equus_caballus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	83.536	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.536	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.631	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.755	Esox_lucius
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.602	Felis_catus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	65.344	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.344	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.142	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.142	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	66	62.549	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.065	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	87	83.729	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	Gadus_morhua
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.573	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.306	Gallus_gallus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.725	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.474	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.771	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	99.321	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	99.321	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.271	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.013	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	94.986	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.986	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.412	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.856	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.257	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.654	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.727	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.816	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.816	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	98.834	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.834	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.628	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.106	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	67.949	ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.949	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	70.494	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.494	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	73.037	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.037	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.943	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.641	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	98.641	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.641	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	98.641	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	89.879	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	89.879	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.505	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	98.505	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.059	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.677	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.271	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.759	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.643	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.375	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	93.042	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.042	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.547	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.924	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.514	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.333	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.867	Mola_mola
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	87.131	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.131	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.193	ENSMALG00000007012	papolg	89	72.193	Monopterus_albus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.792	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.299	Mus_caroli
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.792	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	Mus_musculus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.657	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	Mus_pahari
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.657	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	Mus_spretus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.602	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	93.724	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.724	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.412	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.412	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	63.214	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.479	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	99.534	ENSNLEG00000009507	-	100	99.534	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	81	79.452	ENSMEUG00000013605	-	87	79.452	Notamacropus_eugenii
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.872	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.872	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	94.131	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	Octodon_degus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	65.638	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.726	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	85.791	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.791	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	96.221	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.221	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.721	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.040	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.227	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.360	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.721	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.040	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.693	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.733	Oryzias_melastigma
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	89.535	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.535	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.332	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.332	Ovis_aries
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	99.049	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	99.049	Pan_paniscus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.602	Panthera_pardus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.467	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.467	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	99.049	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	99.049	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.444	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	94.444	Papio_anubis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	94	70.423	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.096	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.096	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	79.380	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	Pelodiscus_sinensis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	92.769	ENSPEMG00000008960	-	100	92.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	52.078	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.886	Petromyzon_marinus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	87.316	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.635	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.272	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.725	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.617	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.676	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.366	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	Poecilia_reticulata
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	81.497	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.497	Procavia_capensis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	84.480	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.480	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	89	94.991	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	Pteropus_vampyrus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.963	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.963	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	73.396	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.252	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.252	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	92.527	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	92.527	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.505	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	98.505	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.370	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.370	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	94	87.518	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.293	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.293	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	64.276	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.276	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	78	81.707	ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.386	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.102	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.421	Seriola_dumerili
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.925	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.059	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	79.333	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	79.333	Sphenodon_punctatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.182	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.149	Stegastes_partitus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.412	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	Sus_scrofa
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	72	77.256	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	77.256	Taeniopygia_guttata
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.867	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.867	Takifugu_rubripes
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	66.446	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.446	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	88.027	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.027	Tupaia_belangeri
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	90.283	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.283	Tursiops_truncatus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	94.407	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	Ursus_americanus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	94.407	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.407	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	91.293	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	Vicugna_pacos
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.872	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.872	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	74.801	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	67	85.484	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.484	Xiphophorus_couchianus
ENSPPYG00000012392	PAPOLG	74	82.897	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	Xiphophorus_maculatus