EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000015545 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 91051 bases
Position: chr5:72878266-72969316
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000017375	IBN_N	PF03810.19	4.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000018080	TNPO1-201	2812	-	ENSPPYP00000017375	897 (aa)	-	H2PFU0

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	85.231	ENSPPYG00000009602	TNPO2	99	85.231

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.708	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	98.891	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.765	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.765	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.820	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.820	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.371	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	98	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.443	ENSANAG00000022453	-	100	99.443	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	64.309	ENSANAG00000027118	-	99	64.088	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	88.307	ENSANAG00000025351	-	100	88.307	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	91.461	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.601	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.666	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.666	Bos_taurus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.650	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	Canis_familiaris
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	96.963	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.963	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	Capra_hircus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	95.593	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.849	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.443	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.889	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.443	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.777	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.777	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	94	87.013	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	75.309	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.309	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.889	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.532	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.532	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.135	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.135	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.146	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.480	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	Danio_rerio
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.527	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.527	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	92	99.639	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000015545	TNPO1	94	85.000	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.889	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.666	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.666	Equus_caballus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	86.383	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.948	Esox_lucius
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.889	Felis_catus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.490	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	89.744	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	Gadus_morhua
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.265	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.841	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.841	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	83.128	ENSGGOG00000022535	-	99	83.128	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.889	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.034	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.220	ENSHGLG00000000970	-	100	99.220	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.065	ENSHGLG00100017090	-	99	99.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	75.390	ENSHGLG00100000963	-	100	74.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	99.553	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.483	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	90	90.012	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	Labrus_bergylta
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	95.190	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	96	99.076	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.889	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.777	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.777	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.889	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.889	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.371	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.809	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	99.442	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	95.745	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	99.108	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.108	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.397	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.397	Mola_mola
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.247	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.332	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.443	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.332	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.777	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.777	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.185	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.636	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.636	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.889	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000015545	TNPO1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.220	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	Octodon_degus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.111	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.111	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	91	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.607	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.777	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.777	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.666	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	Ovis_aries
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.889	Pan_paniscus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.889	Panthera_pardus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.889	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.889	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000015545	TNPO1	93	86.878	ENSPTRG00000047731	-	100	86.878	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.889	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.889	Papio_anubis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	90.449	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	90.348	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.532	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	98.202	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.202	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.057	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.258	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.161	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	Poecilia_reticulata
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ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.555	Pteropus_vampyrus
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