EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000016472 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11715 bases
Position: chr6:32458325-32470039
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000018419	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.3e-41	1	1
ENSPPYP00000018419	DEAD	PF00270.29	1.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000019154	SKIV2L-201	4650	-	ENSPPYP00000018419	1246 (aa)	-	H2PIL8

Gene Model

Click here to download ENSPPYG00000016472's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pon03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPPYG00000016472's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	78	35.636	ENSPPYG00000015469	MTREX	89	35.636

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	98.716	ENSG00000204351	SKIV2L	100	98.716	Homo_sapiens
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.270	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.606	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.061	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.061	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.808	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.274	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.904	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.254	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.745	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.093	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.748	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.835	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	64.863	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	65.976	Anolis_carolinensis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.950	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	96.950	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.331	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.464	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	59.109	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.189	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.061	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	94.061	Bos_taurus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	96	39.702	WBGene00008502	skih-2	99	39.702	Caenorhabditis_elegans
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.790	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	96.790	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.222	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	94.222	Canis_familiaris
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.141	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	94.141	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.981	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	93.981	Capra_hircus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.981	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	93.981	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	91.894	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.055	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.790	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	96.790	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	98.154	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	98.154	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.536	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.536	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.673	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	97.673	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	87	65.497	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.497	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	50.550	ENSCING00000005576	-	99	50.466	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	98.153	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	98.153	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.023	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.116	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.814	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	60.835	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.157	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.335	Danio_rerio
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	93.590	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	87.901	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	93	43.923	FBgn0039117	tst	97	43.923	Drosophila_melanogaster
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	69	92.031	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	92.031	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	89	56.163	ENSEBUG00000013680	-	95	56.939	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	93	94.660	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	94.660	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	96	93.866	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	94.492	Equus_caballus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	54	95.257	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	95.257	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.000	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.391	Esox_lucius
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.543	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	94.543	Felis_catus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	89.254	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.495	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	59.792	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.946	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.265	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.286	Gadus_morhua
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	79	60.081	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.203	Gallus_gallus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.997	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.187	Gambusia_affinis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.905	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.097	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	98.555	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	98.555	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.173	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.303	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	90.946	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.186	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	88.381	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	88.622	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	59.235	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.235	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.558	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.663	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.981	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.981	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	71	60.911	ENSLACG00000002986	-	73	60.705	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.579	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.579	Loxodonta_africana
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.913	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	97.913	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.833	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	97.833	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.833	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.833	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	98.074	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	98.074	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.635	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.821	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.252	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.384	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	70	51.055	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.050	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.302	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.382	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.864	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	94.864	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	91.099	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.179	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.772	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.845	Mola_mola
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	87.670	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.581	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	Monopterus_albus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.622	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.622	Mus_caroli
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.702	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	92.702	Mus_musculus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.061	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.061	Mus_pahari
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.462	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.462	Mus_spretus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.820	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	93.820	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.098	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	93.098	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.526	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.887	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	94.690	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.690	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	78	93.805	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	93.805	Notamacropus_eugenii
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.499	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.499	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	91.734	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	91.734	Octodon_degus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.594	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.862	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.302	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.302	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.014	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.205	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.856	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.124	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.522	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.706	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.477	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.433	Oryzias_melastigma
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.061	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.061	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	88.410	ENSOARG00000002411	-	100	88.410	Ovis_aries
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	97.831	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	97.831	Pan_paniscus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.623	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	94.623	Panthera_pardus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.222	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.222	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	98.796	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	98.796	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	96.785	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	96.785	Papio_anubis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.842	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.984	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.016	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.325	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.023	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	93.023	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	87.280	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.280	Phascolarctos_cinereus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.918	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.107	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.045	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.236	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.997	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.187	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.003	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.058	Poecilia_reticulata
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	77	93.702	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.702	Procavia_capensis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	95.746	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.746	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.178	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.178	Pteropus_vampyrus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	93	66.116	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	66.116	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	60.643	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.643	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.023	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.023	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	95.304	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	95.304	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.994	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	97.994	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	93	37.510	YLR398C	-	93	37.589	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.790	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	96.790	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	87.030	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.989	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.914	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.262	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.575	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.045	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.236	Seriola_dumerili
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.016	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.081	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.860	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.028	Sphenodon_punctatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	60.452	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.645	Stegastes_partitus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.141	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.141	Sus_scrofa
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	85	54.889	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.689	Takifugu_rubripes
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.681	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.677	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	92.270	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.270	Tupaia_belangeri
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	89.005	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.005	Tursiops_truncatus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.543	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.543	Ursus_americanus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	93	94.660	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	94.660	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	94.377	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	94.377	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	58.016	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.329	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.408	Xiphophorus_couchianus
ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.728	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.915	Xiphophorus_maculatus