EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPPYG00000017514 (Gene tree)
Gene ID: 100171721
Gene Symbol: TYW1
Alias: RSAFD1
Full Name: Pongo abelii tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae) (TYW1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Pongo_abelii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 272675 bases
Position: chr7:15133630-15406304
Accession: NM_001131387
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPPYP00000019631	Wyosine_form	PF08608.12	4.9e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPPYT00000020403	-	3325	-	ENSPPYP00000019631	732 (aa)	-	H2PLZ5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	98.224	ENSG00000198874	TYW1	100	98.224	Homo_sapiens
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	86.339	ENSG00000277149	TYW1B	100	86.339	Homo_sapiens
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.757	ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.483	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	65.145	ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.007	Amphilophus_citrinellus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.531	ENSAOCG00000016792	tyw1	97	67.483	Amphiprion_ocellaris
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.531	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	68.475	Amphiprion_percula
ENSPPYG00000017514	TYW1	89	66.717	ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.819	Anabas_testudineus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	94.126	ENSANAG00000037051	-	100	94.126	Aotus_nancymaae
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.391	ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.120	Astatotilapia_calliptera
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	68.283	ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.586	Astyanax_mexicanus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	86.339	ENSBTAG00000008446	TYW1	100	86.339	Bos_taurus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	92.760	ENSCJAG00000004295	-	100	92.760	Callithrix_jacchus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	83.582	ENSCAFG00000010867	-	100	84.125	Canis_familiaris
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	74.488	ENSCAFG00020005367	-	99	77.937	Canis_lupus_dingo
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	87.022	ENSCHIG00000019510	-	100	87.022	Capra_hircus
ENSPPYG00000017514	TYW1	90	89.833	ENSTSYG00000008236	-	100	89.833	Carlito_syrichta
ENSPPYG00000017514	TYW1	87	78.438	ENSCAPG00000013569	-	100	77.605	Cavia_aperea
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	82.162	ENSCPOG00000011182	-	100	82.162	Cavia_porcellus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	93.306	ENSCCAG00000026643	-	100	93.306	Cebus_capucinus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.995	ENSCATG00000043677	-	100	96.995	Cercocebus_atys
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	82.361	ENSCLAG00000006321	-	100	82.361	Chinchilla_lanigera
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.699	ENSCSAG00000018274	-	100	84.699	Chlorocebus_sabaeus
ENSPPYG00000017514	TYW1	68	94.017	ENSCHOG00000003801	-	75	94.017	Choloepus_hoffmanni
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	75.000	ENSCPBG00000014896	-	97	74.865	Chrysemys_picta_bellii
ENSPPYG00000017514	TYW1	66	72.487	ENSCING00000004125	-	97	59.222	Ciona_intestinalis
ENSPPYG00000017514	TYW1	73	71.240	ENSCSAVG00000005712	-	100	54.893	Ciona_savignyi
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.721	ENSCANG00000033209	-	100	96.721	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	71	87.529	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	87.731	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.822	ENSCSEG00000005810	tyw1	94	67.545	Cynoglossus_semilaevis
ENSPPYG00000017514	TYW1	89	66.159	ENSCVAG00000001054	tyw1	91	65.957	Cyprinodon_variegatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	68.560	ENSDARG00000062987	tyw1	95	69.391	Danio_rerio
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	87.705	ENSDNOG00000024165	-	100	87.158	Dasypus_novemcinctus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	69.399	ENSDORG00000014772	Tyw1	99	69.399	Dipodomys_ordii
ENSPPYG00000017514	TYW1	51	54.133	ENSETEG00000009904	-	84	54.133	Echinops_telfairi
ENSPPYG00000017514	TYW1	60	72.685	ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	87.842	ENSEASG00005008818	-	100	87.842	Equus_asinus_asinus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	78.552	ENSECAG00000023164	-	100	79.235	Equus_caballus
ENSPPYG00000017514	TYW1	62	93.750	ENSEEUG00000005950	-	62	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	65.844	ENSELUG00000008449	tyw1	98	66.214	Esox_lucius
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.396	ENSFCAG00000014262	-	100	83.446	Felis_catus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.849	ENSFALG00000013810	-	100	67.804	Ficedula_albicollis
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	83.470	ENSFDAG00000013270	-	99	83.470	Fukomys_damarensis
ENSPPYG00000017514	TYW1	83	69.144	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.821	Fundulus_heteroclitus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	69.852	ENSGALG00000001110	-	99	70.968	Gallus_gallus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.025	ENSGACG00000012692	tyw1	98	65.884	Gasterosteus_aculeatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	74.629	ENSGAGG00000022393	-	100	74.224	Gopherus_agassizii
ENSPPYG00000017514	TYW1	90	89.378	ENSGGOG00000001473	TYW1	100	89.378	Gorilla_gorilla
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.436	ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.984	Haplochromis_burtoni
ENSPPYG00000017514	TYW1	88	80.499	ENSHGLG00000012093	-	100	80.187	Heterocephalus_glaber_female
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.426	ENSHGLG00100011743	TYW1	100	84.426	Heterocephalus_glaber_male
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	61.165	ENSHCOG00000019949	tyw1	95	61.050	Hippocampus_comes
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	68.320	ENSIPUG00000016330	tyw1	95	68.655	Ictalurus_punctatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	82.650	ENSSTOG00000004067	-	92	81.557	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	81.557	ENSJJAG00000022959	Tyw1	100	81.557	Jaculus_jaculus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.436	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	66.713	Kryptolebias_marmoratus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.490	ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.176	Latimeria_chalumnae
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	69.482	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.392	Lepisosteus_oculatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.721	ENSMFAG00000035457	-	100	96.721	Macaca_fascicularis
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.721	ENSMMUG00000030374	-	100	96.721	Macaca_mulatta
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.721	ENSMNEG00000041992	-	100	96.721	Macaca_nemestrina
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.995	ENSMLEG00000039741	-	100	96.995	Mandrillus_leucophaeus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.172	ENSMAMG00000016089	tyw1	94	66.897	Mastacembelus_armatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	91	71.257	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	70.326	Maylandia_zebra
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	70.216	ENSMGAG00000002176	-	100	71.294	Meleagris_gallopavo
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.874	ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.874	Mesocricetus_auratus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	89.793	ENSMICG00000014374	-	99	89.793	Microcebus_murinus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.764	ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.491	Microtus_ochrogaster
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	61.646	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	61.080	Mola_mola
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	73.128	ENSMODG00000025697	-	100	73.387	Monodelphis_domestica
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.263	ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.125	Monopterus_albus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.055	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	100	80.055	Mus_caroli
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.464	ENSMUSG00000056310	Tyw1	100	80.464	Mus_musculus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	78.142	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	100	79.098	Mus_pahari
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.191	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	100	80.191	Mus_spretus
ENSPPYG00000017514	TYW1	95	81.097	ENSMPUG00000016191	-	100	79.365	Mustela_putorius_furo
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.261	ENSMLUG00000013582	-	100	84.261	Myotis_lucifugus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	77.610	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	78.022	Nannospalax_galili
ENSPPYG00000017514	TYW1	96	67.045	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	67.045	Neolamprologus_brichardi
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.038	ENSNLEG00000013210	-	99	96.038	Nomascus_leucogenys
ENSPPYG00000017514	TYW1	94	66.764	ENSOPRG00000008734	-	91	66.764	Ochotona_princeps
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	72.814	ENSODEG00000014729	-	99	73.598	Octodon_degus
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.579	ENSONIG00000005872	tyw1	97	67.442	Oreochromis_niloticus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	85.246	ENSOCUG00000003173	-	100	85.246	Oryctolagus_cuniculus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.298	ENSORLG00000001393	tyw1	98	65.090	Oryzias_latipes
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.575	ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.508	Oryzias_latipes_hni
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.391	ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.890	Oryzias_latipes_hsok
ENSPPYG00000017514	TYW1	94	88.970	ENSOGAG00000016555	-	99	86.364	Otolemur_garnettii
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	86.703	ENSOARG00000010673	-	100	86.703	Ovis_aries
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.699	ENSPPRG00000004945	-	100	83.743	Panthera_pardus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.973	ENSPTIG00000019545	-	100	84.016	Panthera_tigris_altaica
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	91.180	ENSPTRG00000023076	TYW1B	99	91.180	Pan_troglodytes
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.448	ENSPANG00000019053	-	100	96.448	Papio_anubis
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.712	ENSPKIG00000006545	tyw1	97	66.893	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPPYG00000017514	TYW1	96	65.823	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	65.449	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.601	ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.601	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.527	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.984	Poecilia_formosa
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.578	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	66.239	Poecilia_latipinna
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.712	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	65.042	Poecilia_mexicana
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	64.850	ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.217	Poecilia_reticulata
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	72.268	ENSPCOG00000015294	-	94	86.667	Propithecus_coquereli
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.956	ENSPNYG00000022381	tyw1	95	67.680	Pundamilia_nyererei
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	68.776	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	69.188	Pygocentrus_nattereri
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	81.967	ENSRNOG00000024352	Tyw1	100	81.967	Rattus_norvegicus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.448	ENSRBIG00000039619	-	100	96.448	Rhinopithecus_bieti
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	96.585	ENSRROG00000039780	-	100	96.585	Rhinopithecus_roxellana
ENSPPYG00000017514	TYW1	92	41.399	YPL207W	-	75	40.816	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	91.530	ENSSBOG00000025873	-	100	91.530	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	73.813	ENSSHAG00000010346	-	100	74.270	Sarcophilus_harrisii
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	68.176	ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.403	Scleropages_formosus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.575	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.158	Scophthalmus_maximus
ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.627	ENSSDUG00000001552	tyw1	95	70.398	Seriola_dumerili
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ENSPPYG00000017514	TYW1	100	85.109	ENSSSCG00000007733	-	100	85.109	Sus_scrofa
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ENSPPYG00000017514	TYW1	90	70.465	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.015	Tetraodon_nigroviridis
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	84.939	ENSUMAG00000015343	-	100	83.989	Ursus_maritimus
ENSPPYG00000017514	TYW1	100	81.954	ENSVVUG00000016457	-	100	83.039	Vulpes_vulpes
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	69.293	ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.596	Xenopus_tropicalis
ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.079	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	67.456	Xiphophorus_maculatus