EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000000415 (Gene tree)
Gene ID: 103465657
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin-2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9517 bases
Position: chrLG1:11905475-11914991
Accession: 103465657
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000000555	IBN_N	PF03810.19	1.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000000585	TNPO2 (1 of many)-201	2710	XM_008410681	ENSPREP00000000555	895 (aa)	XP_008408903	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	86.952	ENSPREG00000020705	tnpo1	99	86.727
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.820	ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.820

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSG00000105576	TNPO2	100	93.026	Homo_sapiens
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	99.775	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000000415	TNPO2	81	94.345	ENSAPOG00000013185	-	96	94.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	90.434	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	90.434	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000000415	TNPO2	86	99.611	ENSACIG00000009586	-	100	99.611	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000000415	TNPO2	86	95.720	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	95.349	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSAOCG00000010152	-	100	99.775	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.501	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	95.501	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSAPEG00000013268	-	100	99.775	Amphiprion_percula
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.501	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	95.501	Amphiprion_percula
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSATEG00000019171	-	100	99.775	Anabas_testudineus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.051	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	95.051	Anabas_testudineus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.476	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	93.363	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.913	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	92.913	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.276	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	95.276	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.701	ENSACLG00000020672	-	100	93.701	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.902	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	93.902	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.913	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	92.913	Bos_taurus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.991	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	93.138	Canis_familiaris
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.138	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	88.320	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	88.098	Capra_hircus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.026	Carlito_syrichta
ENSPREG00000000415	TNPO2	93	90.725	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	90.725	Cavia_aperea
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.801	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	92.801	Cavia_porcellus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	93.026	Cebus_capucinus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	91.991	Cercocebus_atys
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.801	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	93.026	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.701	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	93.701	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000000415	TNPO2	96	93.116	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	93.116	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.102	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	92.102	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	93.138	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000000415	TNPO2	86	96.512	ENSCSEG00000011477	-	100	96.512	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.226	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	91.226	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	99.775	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.483	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	93.483	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.451	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	91.451	Danio_rerio
ENSPREG00000000415	TNPO2	87	83.546	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	83.673	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	86.556	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.241	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	73.043	FBgn0024921	Tnpo	100	72.931	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000000415	TNPO2	91	84.171	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	84.171	Echinops_telfairi
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	93.026	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	93.026	Equus_caballus
ENSPREG00000000415	TNPO2	80	95.273	ENSELUG00000016542	-	99	86.556	Esox_lucius
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	94.784	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	94.784	Esox_lucius
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	91.991	Felis_catus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.801	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	92.801	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000000415	TNPO2	96	99.186	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	99.186	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.820	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	93.820	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	86.801	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	86.801	Gadus_morhua
ENSPREG00000000415	TNPO2	80	98.148	ENSGMOG00000014237	-	90	98.148	Gadus_morhua
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	94.270	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	94.270	Gambusia_affinis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.663	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	99.663	Gambusia_affinis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.701	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	93.701	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.888	ENSHBUG00000018317	-	100	99.888	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.276	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	95.276	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.688	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	92.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.101	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	91.101	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.213	ENSHCOG00000020440	-	100	99.213	Hippocampus_comes
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.363	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	93.363	Hippocampus_comes
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	96.854	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	96.854	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.051	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	95.051	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	93.026	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	91.991	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.663	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	99.663	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.789	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	91.789	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.550	ENSLBEG00000005301	-	100	99.550	Labrus_bergylta
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.726	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	95.726	Labrus_bergylta
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	90.551	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.551	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.852	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.852	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	Loxodonta_africana
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	91.991	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	93.026	Macaca_mulatta
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	93.026	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000000415	TNPO2	97	91.234	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	92.042	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.775	ENSMAMG00000011862	-	100	99.775	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.452	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	93.452	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.888	ENSMZEG00005007408	-	100	99.888	Maylandia_zebra
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.031	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.348	Maylandia_zebra
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.276	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	95.276	Maylandia_zebra
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.026	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	93.026	Microcebus_murinus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	93.138	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000000415	TNPO2	86	90.052	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.052	Mola_mola
ENSPREG00000000415	TNPO2	86	99.094	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	99.094	Mola_mola
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.992	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	92.992	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	94.151	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	94.151	Monopterus_albus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.325	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	99.325	Monopterus_albus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	93.138	Mus_caroli
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	93.138	Mus_musculus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	93.138	Mus_pahari
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	93.138	Mus_spretus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	93.138	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000000415	TNPO2	96	93.116	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	93.116	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	93.138	Nannospalax_galili
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	99.888	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	99.888	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	89.989	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	89.989	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	83.000	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	83.000	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	87.319	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	87.319	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	92.801	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	92.801	Octodon_degus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	98.886	ENSONIG00000017706	-	100	98.886	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.388	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	95.388	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.138	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	93.138	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000000415	TNPO2	90	92.779	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	92.936	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.163	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	95.163	Oryzias_latipes
ENSPREG00000000415	TNPO2	56	99.000	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.000	Oryzias_latipes
ENSPREG00000000415	TNPO2	99	95.163	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	95.163	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000000415	TNPO2	56	98.800	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.800	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000000415	TNPO2	56	99.000	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	99.000	Oryzias_latipes_hsok
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