EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000000446 (Gene tree)
Gene ID: 103465396
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: fc32h05|fi41c08|im:7140483|wu:fc32h05|wu:fi41c08
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8294 bases
Position: chrLG1:12344862-12353155
Accession: 103465396
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000000592	RRM_1	PF00076.22	1.7e-09	1	1
ENSPREP00000000591	RRM_1	PF00076.22	1.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000000621	-	3162	XM_008410164	ENSPREP00000000591	1053 (aa)	XP_008408386	UPI0004A2D9CC
ENSPRET00000000622	-	3069	-	ENSPREP00000000592	1022 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000000446's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000000446's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	69	39.623	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	70	39.315	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	75	38.486	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	77	40.909	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	75	38.034	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	77	40.535	Amphiprion_percula
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	62	42.573	ENSATEG00000020218	-	73	82.278	Anabas_testudineus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	86	82.803	ENSACLG00000019359	-	80	82.911	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	71	86.684	ENSGAFG00000011120	si:dkey-93h22.8	98	88.677	Gambusia_affinis
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	86	82.803	ENSHBUG00000019347	-	80	82.911	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	83	41.739	ENSHCOG00000015325	-	66	34.076	Hippocampus_comes
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	67	60.645	ENSIPUG00000021651	si:dkey-93h22.8	68	69.531	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	71	39.461	ENSLBEG00000024075	-	71	39.344	Labrus_bergylta
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	85	83.974	ENSMAMG00000011169	-	84	83.544	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	86	82.803	ENSMZEG00005008228	-	84	82.911	Maylandia_zebra
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	86	80.128	ENSMALG00000005052	-	91	78.481	Monopterus_albus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	84	74.522	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	88	74.684	Oryzias_latipes
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	68	33.952	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	70	34.483	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	84	75.472	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	87	75.316	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	100	91.833	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	100	91.833	Poecilia_formosa
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	100	91.512	ENSPLAG00000001769	si:dkey-93h22.8	100	91.512	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	100	91.548	ENSPMEG00000014605	si:dkey-93h22.8	100	91.548	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	86	82.911	ENSPNYG00000002682	-	84	82.911	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	76	40.454	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	91	82.278	Seriola_dumerili
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	91	82.692	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.278	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	74	39.695	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	77	39.781	Stegastes_partitus
ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	77	88.752	ENSXMAG00000000243	si:dkey-93h22.8	100	90.702	Xiphophorus_maculatus