EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000000708 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC103470354
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12178 bases
Position: chrLG9:22910349-22922526
Accession: 103470354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000000970	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-06	1	1

Transcripts

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ENSPRET00000001008	-	1275	XM_008418741	ENSPREP00000000970	425 (aa)	XP_008416963	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	57.763	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	57.763

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	60.093	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	59.497	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	98	59.497	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.155	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	88.155	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.383	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	88.383	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	60.000	Amphiprion_ocellaris
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.155	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	88.155	Amphiprion_percula
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	60.227	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	60.227	Anabas_testudineus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	87.244	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	98	87.244	Anabas_testudineus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	57.306	ENSACAG00000028632	-	97	57.306	Anolis_carolinensis
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.838	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	88.838	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	59.910	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	98	59.910	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	78.409	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	98	78.409	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	81	61.782	ENSCING00000020807	-	92	61.782	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	98	54.756	ENSCSAVG00000009987	-	96	54.884	Ciona_savignyi
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	85.649	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	93	85.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	59.767	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	97	59.767	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	91.344	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	91.344	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	60.909	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	71.939	Danio_rerio
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	81.136	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.136	Danio_rerio
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	82	56.056	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.056	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	79.224	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	79.224	Esox_lucius
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	59.864	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	98	59.864	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	90.433	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	90.433	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	92	53.960	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	53.960	Gadus_morhua
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	94.305	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	94.305	Gambusia_affinis
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	86	65.591	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	61.728	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	60	93.798	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	59.276	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	59.276	Haplochromis_burtoni
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	81.567	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	81.567	Hippocampus_comes
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	98	60.284	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.284	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	76.765	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	76.765	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	82	58.449	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	58.449	Ictalurus_punctatus
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	85.877	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	85.877	Labrus_bergylta
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	69.195	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	69.195	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	71.918	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	71.918	Lepisosteus_oculatus
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ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	58.851	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	97	58.851	Mola_mola
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