EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000001121 (Gene tree)
Gene ID: 103469302
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14636 bases
Position: chrLG8:22099697-22114332
Accession: 103469302
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000001573	IBN_N	PF03810.19	1.4e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000001615	TNPO2 (1 of many)-201	7632	XM_008416900	ENSPREP00000001573	890 (aa)	XP_008415122	UPI0004A43E0F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000001121	TNPO2	99	86.839	ENSPREG00000020705	tnpo1	99	86.839
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.820	ENSPREG00000000415	TNPO2	99	93.820

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSG00000105576	TNPO2	100	91.910	Homo_sapiens
ENSPREG00000001121	TNPO2	82	94.215	ENSAPOG00000013185	-	96	93.526	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	89.333	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	89.222	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000001121	TNPO2	87	96.891	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	96.891	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000001121	TNPO2	87	93.790	ENSACIG00000009586	-	100	93.790	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	97.303	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSAOCG00000010152	-	100	93.708	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	97.303	Amphiprion_percula
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSAPEG00000013268	-	100	93.708	Amphiprion_percula
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSATEG00000019171	-	100	93.708	Anabas_testudineus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	96.629	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	96.629	Anabas_testudineus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.584	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	92.809	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.910	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	91.798	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	97.303	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	87.191	ENSACLG00000020672	-	100	87.079	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.802	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	92.802	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.910	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	91.798	Bos_taurus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.000	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.889	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	92.022	Canis_familiaris
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.022	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	87.333	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	87.333	Capra_hircus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.910	Carlito_syrichta
ENSPREG00000001121	TNPO2	93	89.667	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	89.549	Cavia_aperea
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	91.910	Cavia_porcellus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	91.910	Cebus_capucinus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.000	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	90.889	Cercocebus_atys
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.910	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	91.910	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.472	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	92.697	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000001121	TNPO2	96	92.191	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	92.075	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.111	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	91.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	92.022	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.480	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	92.480	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000001121	TNPO2	87	91.871	ENSCSEG00000011477	-	100	91.871	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	98.539	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	98.539	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	93.708	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.348	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	91.573	Danio_rerio
ENSPREG00000001121	TNPO2	88	83.185	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	83.057	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	85.477	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	88.321	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	72.483	FBgn0024921	Tnpo	100	72.371	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000001121	TNPO2	91	83.920	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	83.920	Echinops_telfairi
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.247	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	92.135	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.247	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	92.135	Equus_caballus
ENSPREG00000001121	TNPO2	87	83.440	ENSELUG00000016542	-	99	83.825	Esox_lucius
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.902	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	93.902	Esox_lucius
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.000	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	90.889	Felis_catus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	91.910	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	99.101	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	99.101	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000001121	TNPO2	97	93.148	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	93.148	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000001121	TNPO2	80	92.345	ENSGMOG00000014237	-	90	92.345	Gadus_morhua
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	86.480	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	86.480	Gadus_morhua
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	99.551	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	99.551	Gambusia_affinis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	93.708	Gambusia_affinis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.472	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	92.697	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	97.303	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSHBUG00000018317	-	100	93.708	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.910	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	91.798	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	90.333	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	90.222	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.596	ENSHCOG00000020440	-	100	93.596	Hippocampus_comes
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	95.393	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	95.393	Hippocampus_comes
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.820	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	94.045	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.258	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	93.258	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	92.022	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.000	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	90.889	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.483	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.371	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.933	ENSLBEG00000005301	-	100	93.933	Labrus_bergylta
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	96.404	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	96.404	Labrus_bergylta
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	90.337	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.337	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	94.270	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.270	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.111	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.000	Loxodonta_africana
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.000	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	90.889	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	91.910	Macaca_mulatta
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	91.910	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000001121	TNPO2	96	91.132	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	91.014	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSMAMG00000011862	-	100	93.708	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	94.900	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	94.900	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	97.303	Maylandia_zebra
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSMZEG00005007408	-	100	93.708	Maylandia_zebra
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.593	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.031	Maylandia_zebra
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	91.910	Microcebus_murinus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	92.022	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000001121	TNPO2	87	90.897	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	91.282	Mola_mola
ENSPREG00000001121	TNPO2	88	93.223	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	93.223	Mola_mola
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.556	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	91.556	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	95.730	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	95.955	Monopterus_albus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.483	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	93.483	Monopterus_albus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	92.022	Mus_caroli
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	92.022	Mus_musculus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.360	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	92.247	Mus_pahari
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	92.022	Mus_spretus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	92.022	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000001121	TNPO2	96	92.191	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	92.075	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	92.022	Nannospalax_galili
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.135	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	92.135	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	93.708	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	93.708	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	82.222	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	82.111	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	86.000	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	86.111	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.022	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	91.910	Octodon_degus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	97.303	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	97.303	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.547	ENSONIG00000017706	-	100	92.770	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.573	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	91.573	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000001121	TNPO2	91	92.320	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	92.320	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000001121	TNPO2	56	92.814	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.816	Oryzias_latipes
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	96.629	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	96.629	Oryzias_latipes
ENSPREG00000001121	TNPO2	56	92.615	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.617	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000001121	TNPO2	100	96.629	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	96.629	Oryzias_latipes_hni
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ENSPREG00000001121	TNPO2	100	96.404	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	96.404	Oryzias_latipes_hsok
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