EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000003009 (Gene tree)
Gene ID: 103458641
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8689 bases
Position: chrLG22:14058314-14067002
Accession: 103458641
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000004254	SYF2	PF08231.12	6.7e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000004314	-	3112	XM_008399600	ENSPREP00000004254	238 (aa)	XP_008397822	UPI0004A25C08

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000003009's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000003009's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	ENSG00000117614	SYF2	89	81.019	Homo_sapiens
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000003009	syf2	82	80.513	ENSAMEG00000010134	-	100	80.513	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000003009	syf2	99	73.967	ENSAMEG00000010115	-	89	80.093	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000003009	syf2	99	88.511	ENSACIG00000023688	syf2	94	88.511	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	ENSAOCG00000022046	syf2	92	91.667	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000003009	syf2	93	88.235	ENSAOCG00000010912	syf2	69	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.076	Amphiprion_percula
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.496	ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	Anabas_testudineus
ENSPREG00000003009	syf2	84	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000003009	syf2	70	68.862	ENSACAG00000026777	-	100	68.862	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000003009	syf2	86	82.353	ENSACAG00000013653	-	100	82.353	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	ENSANAG00000032473	SYF2	89	81.481	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000003009	syf2	100	80.672	ENSAMXG00000004051	syf2	91	85.185	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000003009	syf2	100	75.102	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	81.019	Bos_taurus
ENSPREG00000003009	syf2	87	52.381	WBGene00019402	syf-2	90	51.659	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	ENSCJAG00000046570	SYF2	89	81.481	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000003009	syf2	91	75.463	ENSCAFG00000030331	-	92	75.463	Canis_familiaris
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	ENSCAFG00000012895	-	88	80.093	Canis_familiaris
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	ENSCAFG00020021091	-	88	80.093	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000003009	syf2	76	71.429	ENSCAFG00020021094	-	95	71.429	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.104	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	81.019	Capra_hircus
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSTSYG00000005114	SYF2	89	80.556	Carlito_syrichta
ENSPREG00000003009	syf2	83	80.303	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	Cavia_aperea
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.682	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	81.019	Cavia_porcellus
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	ENSCCAG00000022459	SYF2	89	81.481	Cebus_capucinus
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSCATG00000026917	SYF2	89	80.093	Cercocebus_atys
ENSPREG00000003009	syf2	97	78.205	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	81.944	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSCSAG00000000948	SYF2	89	80.093	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000003009	syf2	74	57.542	ENSCHOG00000005273	-	88	60.625	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000003009	syf2	94	80.717	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	82.870	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000003009	syf2	93	52.466	ENSCING00000003017	-	89	54.206	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000003009	syf2	89	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSPREG00000003009	syf2	100	65.844	ENSCANG00000037322	SYF2	87	70.833	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.033	ENSCGRG00001020733	Syf2	89	81.944	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000003009	syf2	82	81.633	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.407	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000003009	syf2	92	86.239	ENSCSEG00000000117	syf2	90	86.977	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000003009	syf2	100	93.305	ENSCVAG00000019543	syf2	100	93.724	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000003009	syf2	100	82.773	ENSDARG00000004706	syf2	91	87.037	Danio_rerio
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.021	ENSDNOG00000047605	SYF2	88	80.556	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000003009	syf2	96	78.788	ENSDORG00000001274	Syf2	89	81.481	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000003009	syf2	94	55.310	FBgn0033556	CG12343	96	55.505	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000003009	syf2	88	66.029	ENSETEG00000015729	SYF2	88	67.822	Echinops_telfairi
ENSPREG00000003009	syf2	83	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000003009	syf2	100	68.067	ENSEASG00005004232	-	89	72.222	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000003009	syf2	100	75.918	ENSEASG00005004224	-	88	81.944	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.922	ENSECAG00000010440	-	90	81.944	Equus_caballus
ENSPREG00000003009	syf2	100	75.102	ENSECAG00000012023	-	88	81.481	Equus_caballus
ENSPREG00000003009	syf2	71	65.882	ENSEEUG00000015084	SYF2	85	69.677	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000003009	syf2	100	82.353	ENSELUG00000003465	syf2	91	87.500	Esox_lucius
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.833	ENSFCAG00000043095	-	88	81.019	Felis_catus
ENSPREG00000003009	syf2	99	76.349	ENSFCAG00000010324	-	75	81.944	Felis_catus
ENSPREG00000003009	syf2	86	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	88	80.093	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.350	ENSFDAG00000008310	SYF2	89	81.019	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000003009	syf2	99	77.593	ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000003009	syf2	90	86.977	ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.977	Gadus_morhua
ENSPREG00000003009	syf2	94	81.166	ENSGALG00000013639	SYF2	86	82.870	Gallus_gallus
ENSPREG00000003009	syf2	100	96.639	ENSGAFG00000019435	syf2	100	96.639	Gambusia_affinis
ENSPREG00000003009	syf2	94	88.839	ENSGACG00000007305	syf2	90	91.163	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000003009	syf2	94	81.166	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	83.333	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	ENSGGOG00000012796	SYF2	89	81.019	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000003009	syf2	100	90.756	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.756	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000003009	syf2	93	70.270	ENSHGLG00000004304	-	90	72.222	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000003009	syf2	99	76.667	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	81.481	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000003009	syf2	99	76.667	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	81.481	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000003009	syf2	100	87.815	ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.815	Hippocampus_comes
ENSPREG00000003009	syf2	100	82.845	ENSIPUG00000019859	syf2	100	81.092	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000003009	syf2	61	73.973	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000003009	syf2	84	80.905	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000003009	syf2	100	90.756	ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.336	Labrus_bergylta
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.826	ENSLACG00000012064	SYF2	91	81.944	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000003009	syf2	100	83.613	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000003009	syf2	97	77.872	ENSLAFG00000023150	-	88	81.019	Loxodonta_africana
ENSPREG00000003009	syf2	77	52.717	ENSLAFG00000030814	-	100	52.717	Loxodonta_africana
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSMFAG00000041831	SYF2	89	80.093	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000003009	syf2	91	80.093	ENSMMUG00000002968	SYF2	89	80.093	Macaca_mulatta
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSMNEG00000030180	SYF2	89	80.093	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSMLEG00000030248	SYF2	89	80.093	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.076	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	Maylandia_zebra
ENSPREG00000003009	syf2	84	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	ENSMAUG00000018974	Syf2	89	82.870	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000003009	syf2	84	80.905	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	Microcebus_murinus
ENSPREG00000003009	syf2	97	78.696	ENSMOCG00000022938	Syf2	89	82.407	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000003009	syf2	97	87.826	ENSMMOG00000002396	syf2	90	89.815	Mola_mola
ENSPREG00000003009	syf2	94	75.556	ENSMODG00000013951	-	95	77.523	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000003009	syf2	100	86.307	ENSMALG00000010706	syf2	100	86.722	Monopterus_albus
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	89	82.870	Mus_caroli
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	ENSMUSG00000028821	Syf2	89	82.870	Mus_musculus
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	89	82.870	Mus_pahari
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	89	82.870	Mus_spretus
ENSPREG00000003009	syf2	97	75.847	ENSMPUG00000015801	-	88	81.019	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	ENSMPUG00000015802	-	88	80.093	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000003009	syf2	97	78.355	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	81.019	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000003009	syf2	100	73.577	ENSNGAG00000007912	Syf2	88	81.019	Nannospalax_galili
ENSPREG00000003009	syf2	100	79.752	ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	ENSNLEG00000035185	SYF2	89	81.019	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.486	ENSOPRG00000012870	SYF2	89	80.556	Ochotona_princeps
ENSPREG00000003009	syf2	100	66.393	ENSODEG00000014338	-	90	70.833	Octodon_degus
ENSPREG00000003009	syf2	94	78.475	ENSODEG00000017664	-	91	80.093	Octodon_degus
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.496	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.496	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000003009	syf2	85	80.693	ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.693	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000003009	syf2	99	76.250	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	81.481	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000003009	syf2	97	90.000	ENSORLG00000028820	syf2	93	93.519	Oryzias_latipes
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	ENSORLG00020018333	syf2	91	93.519	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	ENSORLG00015014665	syf2	91	93.519	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	ENSOMEG00000013911	syf2	91	94.444	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000003009	syf2	97	78.632	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	81.944	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000003009	syf2	82	54.359	ENSOARG00000006269	-	100	54.359	Ovis_aries
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.897	ENSOARG00000006348	-	88	80.275	Ovis_aries
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	ENSPPAG00000036579	SYF2	89	81.019	Pan_paniscus
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.833	ENSPPRG00000001651	-	88	81.019	Panthera_pardus
ENSPREG00000003009	syf2	97	78.788	ENSPPRG00000001638	-	88	81.944	Panthera_pardus
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.944	ENSPTIG00000005711	-	79	81.944	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.833	ENSPTIG00000007036	-	88	81.019	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	ENSPTRG00000000352	SYF2	89	81.019	Pan_troglodytes
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSPANG00000008139	SYF2	89	80.093	Papio_anubis
ENSPREG00000003009	syf2	100	81.092	ENSPKIG00000008130	syf2	92	86.111	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000003009	syf2	96	78.112	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	81.944	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000003009	syf2	98	85.470	ENSPMGG00000008755	syf2	84	89.352	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000003009	syf2	100	75.620	ENSPEMG00000008283	Syf2	89	81.944	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000003009	syf2	94	80.269	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	82.407	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000003009	syf2	100	95.816	ENSPFOG00000004116	syf2	99	95.816	Poecilia_formosa
ENSPREG00000003009	syf2	98	96.996	ENSPLAG00000006691	syf2	99	97.414	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000003009	syf2	100	94.958	ENSPMEG00000011684	syf2	100	94.958	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.417	ENSPPYG00000001713	SYF2	89	81.019	Pongo_abelii
ENSPREG00000003009	syf2	97	53.419	ENSPCOG00000027011	SYF2	84	55.093	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000003009	syf2	94	71.300	ENSPVAG00000005841	SYF2	88	72.222	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000003009	syf2	100	89.916	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.916	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000003009	syf2	100	81.513	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	ENSRNOG00000060597	Syf2	89	82.870	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000003009	syf2	100	72.016	ENSRBIG00000042970	SYF2	89	77.778	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	ENSRROG00000001347	SYF2	89	80.093	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	81.481	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000003009	syf2	86	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000003009	syf2	94	78.924	ENSSHAG00000015630	-	87	81.019	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000003009	syf2	93	85.520	ENSSFOG00015023647	syf2	91	86.111	Scleropages_formosus
ENSPREG00000003009	syf2	100	86.134	ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.134	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	ENSSDUG00000013072	syf2	100	88.235	Seriola_dumerili
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	ENSSLDG00000012677	syf2	100	88.235	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000003009	syf2	100	58.403	ENSSARG00000012889	SYF2	89	62.037	Sorex_araneus
ENSPREG00000003009	syf2	99	78.512	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	84.259	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000003009	syf2	100	88.655	ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.655	Stegastes_partitus
ENSPREG00000003009	syf2	100	74.286	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	81.019	Sus_scrofa
ENSPREG00000003009	syf2	63	50.993	ENSTGUG00000001126	SYF2	78	54.430	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000003009	syf2	100	82.917	ENSTRUG00000001499	syf2	91	82.917	Takifugu_rubripes
ENSPREG00000003009	syf2	94	87.444	ENSTNIG00000016912	syf2	97	88.426	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000003009	syf2	97	58.442	ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.648	Tupaia_belangeri
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.104	ENSTTRG00000003550	SYF2	89	81.019	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000003009	syf2	99	75.000	ENSUAMG00000002897	SYF2	88	80.093	Ursus_americanus
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	ENSUMAG00000013108	SYF2	88	80.093	Ursus_maritimus
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.689	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	80.556	Vicugna_pacos
ENSPREG00000003009	syf2	99	74.167	ENSVVUG00000027175	-	88	80.093	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000003009	syf2	86	80.000	ENSVVUG00000027181	-	87	80.093	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000003009	syf2	94	78.027	ENSXETG00000022797	syf2	87	79.167	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000003009	syf2	100	95.798	ENSXMAG00000022698	syf2	100	95.798	Xiphophorus_maculatus