EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000007811 (Gene tree)
Gene ID: 103475665
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4016 bases
Position: chrLG14:3573835-3577850
Accession: 103475665
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000011489	RRM_1	PF00076.22	1.6e-15	1	2
ENSPREP00000011489	RRM_1	PF00076.22	1.6e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000011616	-	1335	XM_008427469	ENSPREP00000011489	444 (aa)	XP_008425691	UPI0004A3CBE3

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.550	ENSG00000102241	HTATSF1	100	61.049	Homo_sapiens
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	82.080	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	82.080	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.131	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.379	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.610	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	81.046	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	81.140	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	82.018	Amphiprion_percula
ENSPREG00000007811	htatsf1	94	81.818	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	81.818	Anabas_testudineus
ENSPREG00000007811	htatsf1	91	63.183	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	64.286	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000007811	htatsf1	77	65.598	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.601	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.396	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	81.278	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	69.231	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	71.150	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000007811	htatsf1	98	57.528	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	51	62.690	Bos_taurus
ENSPREG00000007811	htatsf1	79	39.326	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	38.997	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000007811	htatsf1	81	63.587	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	64.175	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000007811	htatsf1	86	64.631	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	64.467	Canis_familiaris
ENSPREG00000007811	htatsf1	87	65.228	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	50	65.736	Capra_hircus
ENSPREG00000007811	htatsf1	86	64.359	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	64.541	Carlito_syrichta
ENSPREG00000007811	htatsf1	81	64.674	ENSCCAG00000022701	-	50	65.375	Cebus_capucinus
ENSPREG00000007811	htatsf1	81	63.514	ENSCCAG00000025329	-	55	63.776	Cebus_capucinus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	64.484	Cercocebus_atys
ENSPREG00000007811	htatsf1	92	60.900	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	64.484	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	62.363	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.281	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	45.924	ENSCING00000005914	-	70	45.652	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000007811	htatsf1	89	40.343	ENSCSAVG00000000371	-	93	43.817	Ciona_savignyi
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.286	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	64.987	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	88.514	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	88.514	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	68.996	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.467	Danio_rerio
ENSPREG00000007811	htatsf1	87	44.275	FBgn0037081	barc	69	44.275	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000007811	htatsf1	90	53.995	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.206	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000007811	htatsf1	90	62.654	ENSEASG00005003440	HTATSF1	50	63.145	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000007811	htatsf1	90	62.654	ENSECAG00000009156	HTATSF1	50	63.145	Equus_caballus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	63.948	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	65.953	Esox_lucius
ENSPREG00000007811	htatsf1	86	63.868	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	64.213	Felis_catus
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	61.638	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	61.638	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000007811	htatsf1	97	60.364	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	56	60.364	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	89.910	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.910	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	76.099	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.099	Gadus_morhua
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	61.522	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.527	Gallus_gallus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	95.270	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	95.270	Gambusia_affinis
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	77.629	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	77.629	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.550	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	65.239	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.617	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	81.498	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	71.141	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	72.235	Hippocampus_comes
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	66.316	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	65.890	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.533	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	65.063	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	85.078	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	78.414	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.121	Labrus_bergylta
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	62.084	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.084	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	45.648	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.588	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	86	64.467	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.467	Loxodonta_africana
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	64.484	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	64.484	Macaca_mulatta
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	64.322	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.757	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	64.484	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	79.458	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	79.458	Mastacembelus_armatus
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ENSPREG00000007811	htatsf1	95	61.785	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	63.073	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.904	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.467	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000007811	htatsf1	91	61.005	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	61.005	Microcebus_murinus
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ENSPREG00000007811	htatsf1	100	63.020	ENSMODG00000014087	-	98	63.020	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	77.951	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.951	Monopterus_albus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.439	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.631	Mus_caroli
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ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.310	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	81.195	Neolamprologus_brichardi
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ENSPREG00000007811	htatsf1	100	77.655	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	79.912	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.912	Oryzias_melastigma
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ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.550	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	65.239	Pan_troglodytes
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	68.490	ENSPKIG00000024852	htatsf1	100	68.341	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000007811	htatsf1	75	67.630	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	97	67.536	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	74.222	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	74.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.075	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	64.484	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000007811	htatsf1	99	57.837	ENSPCIG00000018896	-	99	57.837	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000007811	htatsf1	96	61.644	ENSPCIG00000030173	-	96	61.644	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	97.072	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	97.072	Poecilia_formosa
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	97.072	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	97.072	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	97.072	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	97.072	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.286	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	50	64.824	Pongo_abelii
ENSPREG00000007811	htatsf1	89	57.000	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	53	57.000	Procavia_capensis
ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.369	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	64.286	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000007811	htatsf1	87	62.595	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.595	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.396	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	81.278	Pundamilia_nyererei
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ENSPREG00000007811	htatsf1	100	81.579	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	82.456	Stegastes_partitus
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