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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000010315 (Gene tree)
Gene ID: 103473085
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35622 bases
Position: chrLG11:28512891-28548512
Accession: 103473085
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000015319	PAZ	PF02170.22	7.4e-28	1	1
ENSPREP00000015336	PAZ	PF02170.22	7.7e-28	1	1
ENSPREP00000015301	PAZ	PF02170.22	8e-28	1	1
ENSPREP00000015319	Piwi	PF02171.17	1.2e-105	1	1
ENSPREP00000015336	Piwi	PF02171.17	1.2e-105	1	1
ENSPREP00000015301	Piwi	PF02171.17	1.3e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000015458	-	2742	-	ENSPREP00000015301	913 (aa)	-	-
ENSPRET00000015476	-	6825	XM_008423038	ENSPREP00000015319	874 (aa)	XP_008421260	UPI000293C88A
ENSPRET00000015493	-	4377	-	ENSPREP00000015336	891 (aa)	-	UPI0004A4885F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000010315	ago4	86	83.972	ENSPREG00000009084	-	99	83.972
ENSPREG00000010315	ago4	99	81.401	ENSPREG00000006534	ago1	99	81.401
ENSPREG00000010315	ago4	99	77.968	ENSPREG00000002072	ago2	97	79.951
ENSPREG00000010315	ago4	100	79.548	ENSPREG00000006604	ago3a	100	79.548

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSG00000134698	AGO4	100	96.339	Homo_sapiens
ENSPREG00000010315	ago4	96	99.761	ENSAPOG00000023867	ago4	99	99.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.872	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	95.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000010315	ago4	92	98.509	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.509	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000010315	ago4	92	94.037	ENSAPEG00000022426	ago4	100	94.037	Amphiprion_percula
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSATEG00000006717	ago4	100	99.876	Anabas_testudineus
ENSPREG00000010315	ago4	98	96.503	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	96.503	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.298	ENSACAG00000017275	AGO4	99	95.298	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSANAG00000031428	AGO4	100	96.224	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSACLG00000005181	ago4	100	99.886	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSAMXG00000010318	ago4	100	99.771	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.408	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.602	Bos_taurus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.522	Canis_familiaris
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	96.224	Capra_hircus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.528	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.528	Carlito_syrichta
ENSPREG00000010315	ago4	94	91.304	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	91.304	Cavia_aperea
ENSPREG00000010315	ago4	99	93.929	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	94.444	Cavia_porcellus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	Cebus_capucinus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.296	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	96.296	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	96.339	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000010315	ago4	80	97.640	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	97.640	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.313	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	96.203	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.313	ENSCANG00000016914	AGO4	100	96.313	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000010315	ago4	100	95.767	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	95.767	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.949	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	95.949	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000010315	ago4	92	92.193	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.193	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000010315	ago4	100	98.513	ENSDARG00000100854	ago4	100	98.513	Danio_rerio
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	96.224	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000010315	ago4	59	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSEASG00005012079	AGO4	100	96.339	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSECAG00000024686	AGO4	100	96.339	Equus_caballus
ENSPREG00000010315	ago4	78	94.035	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	94.035	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.089	ENSELUG00000023873	ago4	100	99.089	Esox_lucius
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	96.224	Felis_catus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.528	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	96.528	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000010315	ago4	97	89.374	ENSFHEG00000019658	ago4	100	89.374	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000010315	ago4	99	97.816	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.816	Gadus_morhua
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSGALG00000039713	AGO4	100	96.522	Gallus_gallus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	Gambusia_affinis
ENSPREG00000010315	ago4	99	98.163	ENSGACG00000002683	ago4	99	98.270	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000010315	ago4	99	93.155	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	93.155	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	96.339	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.516	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.542	ENSHCOG00000003725	ago4	100	99.542	Hippocampus_comes
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSIPUG00000015600	ago4	100	99.771	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.334	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000010315	ago4	100	100.000	ENSKMAG00000018602	ago4	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000010315	ago4	100	98.977	ENSLBEG00000010670	ago4	100	98.977	Labrus_bergylta
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.314	ENSLOCG00000000584	ago4	100	99.314	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000010315	ago4	93	95.936	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.936	Loxodonta_africana
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	96.339	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.096	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.825	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.412	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	96.412	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.657	ENSMAMG00000003874	ago4	100	99.730	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSMZEG00005026346	ago4	100	99.886	Maylandia_zebra
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.968	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	96.065	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000010315	ago4	83	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	98	94.991	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.185	ENSMICG00000033507	AGO4	99	96.185	Microcebus_murinus
ENSPREG00000010315	ago4	100	95.881	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	95.881	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000010315	ago4	92	97.019	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.019	Mola_mola
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.453	ENSMODG00000017888	AGO4	100	96.453	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.429	ENSMALG00000011797	ago4	99	96.429	Monopterus_albus
ENSPREG00000010315	ago4	100	95.538	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	Mus_caroli
ENSPREG00000010315	ago4	100	95.309	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	Mus_musculus
ENSPREG00000010315	ago4	100	94.851	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.851	Mus_pahari
ENSPREG00000010315	ago4	100	95.309	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	95.309	Mus_spretus
ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.522	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.857	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	95.857	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.528	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	96.528	Nannospalax_galili
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSNBRG00000013492	ago4	100	99.886	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.412	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	96.412	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000010315	ago4	88	96.605	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.605	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000010315	ago4	99	89.352	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	89.352	Ochotona_princeps
ENSPREG00000010315	ago4	93	96.415	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	Octodon_degus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	ENSONIG00000013603	ago4	100	99.886	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000010315	ago4	92	96.646	ENSOANG00000002082	AGO4	100	96.646	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	96.224	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSORLG00000009865	ago4	94	98.083	Oryzias_latipes
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSORLG00020016978	ago4	94	98.083	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSORLG00015008800	ago4	94	98.083	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.771	ENSOMEG00000006399	ago4	100	99.771	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000010315	ago4	100	87.872	ENSOGAG00000027107	-	100	87.872	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000010315	ago4	93	95.556	ENSOGAG00000004233	-	100	95.556	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000010315	ago4	99	95.413	ENSOARG00000019568	AGO4	99	94.863	Ovis_aries
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.412	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	96.412	Pan_paniscus
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	96.224	Panthera_pardus
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.412	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	96.412	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	Pan_troglodytes
ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.522	Papio_anubis
ENSPREG00000010315	ago4	100	99.314	ENSPKIG00000022598	ago4	100	99.314	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.313	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	96.313	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000010315	ago4	92	98.385	ENSPMGG00000023325	ago4	100	98.385	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000010315	ago4	89	97.143	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000010315	ago4	100	96.453	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000010315	ago4	100	100.000	ENSPFOG00000001935	ago4	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSPREG00000010315	ago4	100	98.741	ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000010315	ago4	100	100.000	ENSPMEG00000005049	ago4	100	100.000	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000010315	ago4	99	96.412	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	96.412	Pongo_abelii
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ENSPREG00000010315	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
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