EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000010358 (Gene tree)
Gene ID: 103477323
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25917 bases
Position: chrLG15:28003150-28029066
Accession: 103477323
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000015352	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.3e-28	1	2
ENSPREP00000015352	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.3e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000015509	-	7196	XM_008430379	ENSPREP00000015352	847 (aa)	XP_008428601	UPI0004A43DCA

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000010358's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000010358's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.059	ENSAPOG00000004798	papolg	100	85.176	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.331	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	68.463	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000010358	papolg	89	78.760	ENSACIG00000010546	papolg	94	96.050	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.412	ENSAOCG00000010254	papolg	100	85.529	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.294	ENSAPEG00000006944	papolg	100	85.412	Amphiprion_percula
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.882	ENSATEG00000009007	papolg	100	86.353	Anabas_testudineus
ENSPREG00000010358	papolg	88	65.695	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.143	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000010358	papolg	72	59.040	ENSACAG00000015048	-	69	73.253	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	67.937	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.647	ENSACLG00000015592	papolg	100	85.647	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000010358	papolg	99	75.000	ENSAMXG00000004611	papolg	100	74.476	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.979	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	68.620	Bos_taurus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.497	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.579	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.709	Canis_familiaris
ENSPREG00000010358	papolg	98	69.251	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.807	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.979	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.490	Capra_hircus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.401	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.010	Carlito_syrichta
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.069	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.359	Cavia_porcellus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.497	Cebus_capucinus
ENSPREG00000010358	papolg	81	81.385	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.385	Cercocebus_atys
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.645	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.401	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	68.366	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000010358	papolg	79	66.422	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.793	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000010358	papolg	58	64.097	ENSCING00000024664	-	92	64.097	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000010358	papolg	57	65.567	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.567	Ciona_savignyi
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	68.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000010358	papolg	88	68.568	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	67.507	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000010358	papolg	88	68.568	ENSCGRG00000005552	-	100	67.507	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000010358	papolg	89	81.325	ENSCSEG00000000771	papolg	79	96.050	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000010358	papolg	100	88.850	ENSCVAG00000016602	papolg	95	98.020	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000010358	papolg	99	74.935	ENSDARG00000012141	papolg	100	74.935	Danio_rerio
ENSPREG00000010358	papolg	89	66.448	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	65.885	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000010358	papolg	51	85.082	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.082	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000010358	papolg	89	56.266	ENSETEG00000011815	PAPOLG	75	66.187	Echinops_telfairi
ENSPREG00000010358	papolg	52	71.503	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.503	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000010358	papolg	55	58.658	ENSEBUG00000005042	-	79	58.658	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.277	ENSEASG00005002038	PAPOLG	89	80.729	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.277	ENSECAG00000009859	PAPOLG	87	80.702	Equus_caballus
ENSPREG00000010358	papolg	89	61.358	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	75	73.056	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000010358	papolg	89	70.708	ENSELUG00000014497	papolg	94	89.085	Esox_lucius
ENSPREG00000010358	papolg	97	69.221	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	68.791	Felis_catus
ENSPREG00000010358	papolg	87	59.416	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	58.146	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	68.052	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000010358	papolg	66	84.135	ENSFHEG00000019080	papolg	97	85.478	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000010358	papolg	78	92.101	ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.101	Gadus_morhua
ENSPREG00000010358	papolg	100	94.824	ENSGAFG00000003263	papolg	100	94.588	Gambusia_affinis
ENSPREG00000010358	papolg	89	85.903	ENSGACG00000002718	papolg	100	85.771	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.775	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	68.366	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.647	ENSHBUG00000004882	papolg	100	85.647	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000010358	papolg	88	69.363	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	68.063	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.474	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	68.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.416	ENSHCOG00000006782	papolg	100	83.822	Hippocampus_comes
ENSPREG00000010358	papolg	99	74.707	ENSIPUG00000021642	papolg	100	74.474	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.194	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	78	80.729	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000010358	papolg	51	85.315	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.315	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000010358	papolg	100	86.033	ENSKMAG00000016439	papolg	100	85.563	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000010358	papolg	100	83.162	ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.162	Labrus_bergylta
ENSPREG00000010358	papolg	99	62.861	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	62.861	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000010358	papolg	99	75.425	ENSLOCG00000016130	papolg	89	88.576	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.872	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.615	Loxodonta_africana
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	68.627	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	68.627	Macaca_mulatta
ENSPREG00000010358	papolg	89	61.769	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	61.899	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.643	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	68.366	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.242	ENSMAMG00000010667	papolg	100	85.412	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.647	ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.647	Maylandia_zebra
ENSPREG00000010358	papolg	88	62.903	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	72	75.888	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000010358	papolg	88	69.261	ENSMAUG00000009088	Papolg	77	82.155	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.463	ENSMICG00000010042	PAPOLG	80	80.870	Microcebus_murinus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.372	ENSMOCG00000006857	Papolg	78	81.185	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000010358	papolg	99	84.868	ENSMMOG00000008020	papolg	99	85.132	Mola_mola
ENSPREG00000010358	papolg	88	68.792	ENSMODG00000002160	PAPOLG	71	83.490	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.588	ENSMALG00000007012	papolg	100	85.176	Monopterus_albus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.908	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.915	Mus_caroli
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.908	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.915	Mus_musculus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.645	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	76	83.183	Mus_pahari
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.908	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.915	Mus_spretus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.318	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	68.449	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000010358	papolg	88	68.874	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	77	81.239	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.231	ENSNGAG00000001120	Papolg	78	81.010	Nannospalax_galili
ENSPREG00000010358	papolg	89	74.967	ENSNBRG00000011943	papolg	84	84.022	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000010358	papolg	51	84.848	ENSNLEG00000009507	-	100	84.848	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000010358	papolg	54	68.790	ENSMEUG00000013605	-	67	68.790	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.586	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	67.662	Ochotona_princeps
ENSPREG00000010358	papolg	50	82.270	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.270	Octodon_degus
ENSPREG00000010358	papolg	99	77.297	ENSONIG00000002985	papolg	100	77.339	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000010358	papolg	98	68.497	ENSOANG00000012403	PAPOLG	85	82.963	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.194	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	78	80.556	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.706	ENSORLG00000001577	papolg	100	84.977	Oryzias_latipes
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.806	ENSORLG00020002482	papolg	100	84.977	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.706	ENSORLG00015008836	papolg	100	84.977	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000010358	papolg	100	84.606	ENSOMEG00000001406	papolg	100	85.194	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000010358	papolg	52	56.484	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	65	74.717	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.979	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.490	Ovis_aries
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	68.717	Pan_paniscus
ENSPREG00000010358	papolg	97	69.221	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	68.791	Panthera_pardus
ENSPREG00000010358	papolg	97	69.091	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.661	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	68.717	Pan_troglodytes
ENSPREG00000010358	papolg	89	65.440	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	65.319	Papio_anubis
ENSPREG00000010358	papolg	98	73.760	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.585	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000010358	papolg	83	74.579	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	74.579	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000010358	papolg	88	66.577	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	81.495	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000010358	papolg	88	69.079	ENSPEMG00000008960	-	77	81.449	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000010358	papolg	88	52.041	ENSPMAG00000002961	papolg	75	61.796	Petromyzon_marinus
ENSPREG00000010358	papolg	58	64.789	ENSPMAG00000004864	-	98	64.789	Petromyzon_marinus
ENSPREG00000010358	papolg	99	68.889	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	92	83.119	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000010358	papolg	100	97.521	ENSPFOG00000012909	papolg	100	97.521	Poecilia_formosa
ENSPREG00000010358	papolg	100	97.521	ENSPLAG00000018445	papolg	100	97.521	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000010358	papolg	100	97.285	ENSPMEG00000003961	papolg	100	97.285	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.366	Pongo_abelii
ENSPREG00000010358	papolg	96	62.834	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	77	83.227	Procavia_capensis
ENSPREG00000010358	papolg	89	63.386	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	93	75.174	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000010358	papolg	77	80.680	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.647	ENSPNYG00000006729	papolg	95	96.230	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000010358	papolg	99	74.674	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.602	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.372	ENSRNOG00000006261	Papolg	78	81.010	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000010358	papolg	89	64.559	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	77	75.306	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000010358	papolg	89	69.038	ENSRROG00000035954	PAPOLG	80	81.261	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	68.758	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000010358	papolg	84	68.560	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	84.462	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000010358	papolg	89	73.012	ENSSFOG00015002383	papolg	82	85.638	Scleropages_formosus
ENSPREG00000010358	papolg	89	64.267	ENSSFOG00015011874	papolg	80	78.169	Scleropages_formosus
ENSPREG00000010358	papolg	67	94.755	ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.350	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000010358	papolg	100	86.353	ENSSDUG00000000912	papolg	98	96.595	Seriola_dumerili
ENSPREG00000010358	papolg	100	86.118	ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000010358	papolg	89	66.579	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	75	81.536	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000010358	papolg	100	85.318	ENSSPAG00000009004	papolg	100	86.768	Stegastes_partitus
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.889	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.442	Sus_scrofa
ENSPREG00000010358	papolg	63	72.744	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.744	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000010358	papolg	89	79.895	ENSTRUG00000006410	papolg	78	94.245	Takifugu_rubripes
ENSPREG00000010358	papolg	89	77.588	ENSTNIG00000017106	papolg	100	76.005	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000010358	papolg	88	62.533	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	61.911	Tupaia_belangeri
ENSPREG00000010358	papolg	96	64.360	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	64.286	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000010358	papolg	97	68.010	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	68.775	Ursus_americanus
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.643	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	68.775	Ursus_maritimus
ENSPREG00000010358	papolg	88	65.000	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	78	77.018	Vicugna_pacos
ENSPREG00000010358	papolg	96	68.709	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.840	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000010358	papolg	89	66.449	ENSXETG00000002208	papolg	100	65.882	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000010358	papolg	59	98.397	ENSXCOG00000006611	papolg	73	98.397	Xiphophorus_couchianus
ENSPREG00000010358	papolg	65	95.800	ENSXMAG00000007383	papolg	96	95.800	Xiphophorus_maculatus