EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000012148 (Gene tree)
Gene ID: 103465242
Gene Symbol: RAB7A (1 of many)
Alias: RAB7
Full Name: ras-related protein Rab-7a
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6345 bases
Position: chrLG5:24322636-24328980
Accession: 103465242
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000017966	MMR_HSR1	PF01926.23	4.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000018157	RAB7A (1 of many)-201	2826	XM_008409882	ENSPREP00000017966	207 (aa)	XP_008408104	UPI000293A220

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret04137	Mitophagy - animal	KEGG
pret04140	Autophagy - animal	KEGG
pret04144	Endocytosis	KEGG
pret04145	Phagosome	KEGG
pret05132	Salmonella infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000012148	RAB7A	79	34.337	ENSPREG00000013962	rab42a	74	34.337
ENSPREG00000012148	RAB7A	85	31.638	ENSPREG00000009813	rab34b	69	31.638
ENSPREG00000012148	RAB7A	73	33.553	ENSPREG00000006363	rras	81	34.146
ENSPREG00000012148	RAB7A	82	35.882	ENSPREG00000017337	rab25b	79	35.882
ENSPREG00000012148	RAB7A	95	37.879	ENSPREG00000014634	rab30	90	37.879
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	34.911	ENSPREG00000010228	dnajc27	86	34.911
ENSPREG00000012148	RAB7A	99	39.320	ENSPREG00000010146	rab5c	79	42.697
ENSPREG00000012148	RAB7A	78	39.877	ENSPREG00000006336	-	72	39.877
ENSPREG00000012148	RAB7A	96	35.323	ENSPREG00000015480	rab6ba	92	35.323
ENSPREG00000012148	RAB7A	79	39.264	ENSPREG00000003616	rab1ba	79	39.264
ENSPREG00000012148	RAB7A	97	36.150	ENSPREG00000017344	-	95	36.150
ENSPREG00000012148	RAB7A	84	54.335	ENSPREG00000012522	-	86	54.335
ENSPREG00000012148	RAB7A	86	53.933	ENSPREG00000006970	rab9b	81	53.933
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	36.686	ENSPREG00000007129	RAB39B	77	36.686
ENSPREG00000012148	RAB7A	83	40.462	ENSPREG00000022167	-	84	40.476
ENSPREG00000012148	RAB7A	82	38.824	ENSPREG00000004889	-	79	38.824
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	30.058	ENSPREG00000012803	rhebl1	88	30.058
ENSPREG00000012148	RAB7A	98	35.885	ENSPREG00000007017	zgc:101559	86	35.885
ENSPREG00000012148	RAB7A	76	34.591	ENSPREG00000022509	rab23	83	35.057
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	30.899	ENSPREG00000006055	rasl11a	67	30.899
ENSPREG00000012148	RAB7A	96	36.500	ENSPREG00000009535	RAB41	92	36.500
ENSPREG00000012148	RAB7A	86	37.989	ENSPREG00000017567	rab13	88	37.989
ENSPREG00000012148	RAB7A	75	33.333	ENSPREG00000018287	KRAS	87	33.929
ENSPREG00000012148	RAB7A	78	39.877	ENSPREG00000017324	rab11al	73	39.877
ENSPREG00000012148	RAB7A	86	34.270	ENSPREG00000020276	RAB29	86	34.270
ENSPREG00000012148	RAB7A	92	36.649	ENSPREG00000014888	rab2a	83	36.649
ENSPREG00000012148	RAB7A	83	38.150	ENSPREG00000005323	si:dkey-16l2.16	80	38.150
ENSPREG00000012148	RAB7A	80	31.737	ENSPREG00000017010	rasd4	78	31.737
ENSPREG00000012148	RAB7A	96	36.000	ENSPREG00000021505	rab6a	94	36.000
ENSPREG00000012148	RAB7A	80	34.706	ENSPREG00000019783	RAB15	77	34.706
ENSPREG00000012148	RAB7A	76	30.357	ENSPREG00000013742	nkiras1	81	30.357
ENSPREG00000012148	RAB7A	58	30.579	ENSPREG00000016664	rap2b	91	33.333
ENSPREG00000012148	RAB7A	88	37.705	ENSPREG00000010154	rab4a	84	37.705
ENSPREG00000012148	RAB7A	78	41.718	ENSPREG00000009605	rab11a	73	41.718
ENSPREG00000012148	RAB7A	82	38.506	ENSPREG00000003221	rab33a	50	38.506
ENSPREG00000012148	RAB7A	84	36.559	ENSPREG00000000880	rab33ba	77	36.559
ENSPREG00000012148	RAB7A	77	34.161	ENSPREG00000016102	si:ch73-116o1.2	80	35.465
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	37.725	ENSPREG00000005923	rab18a	66	37.725
ENSPREG00000012148	RAB7A	79	37.576	ENSPREG00000009597	-	76	37.576
ENSPREG00000012148	RAB7A	84	34.078	ENSPREG00000001864	-	72	34.078
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.585	ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585
ENSPREG00000012148	RAB7A	86	53.371	ENSPREG00000022241	si:dkey-13a21.4	87	53.371
ENSPREG00000012148	RAB7A	80	34.940	ENSPREG00000014761	rabl2	78	34.940
ENSPREG00000012148	RAB7A	96	36.683	ENSPREG00000020321	rab1ab	96	36.683
ENSPREG00000012148	RAB7A	78	40.491	ENSPREG00000014269	rab11bb	72	40.491
ENSPREG00000012148	RAB7A	82	39.645	ENSPREG00000017517	zgc:171927	77	39.645
ENSPREG00000012148	RAB7A	80	35.542	ENSPREG00000006119	rab25a	80	36.567
ENSPREG00000012148	RAB7A	79	40.244	ENSPREG00000010920	rab22a	82	40.244
ENSPREG00000012148	RAB7A	99	51.942	ENSPREG00000001832	rab9a	99	51.942
ENSPREG00000012148	RAB7A	84	34.857	ENSPREG00000010284	rab15	80	34.857
ENSPREG00000012148	RAB7A	90	30.481	ENSPREG00000019341	hrasb	96	31.313
ENSPREG00000012148	RAB7A	78	39.877	ENSPREG00000006357	rab11ba	56	39.877
ENSPREG00000012148	RAB7A	81	36.686	ENSPREG00000017487	rab12	76	37.368

Orthologs

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ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSG00000075785	RAB7A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	100.000	ENSAPOG00000016091	-	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	99.034	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	98.068	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.551	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	98.551	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	87.440	ENSACIG00000022208	-	100	87.440	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	96.618	ENSACIG00000022381	-	100	96.618	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	100.000	ENSAOCG00000008820	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	99.034	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	99.034	Amphiprion_percula
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ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSATEG00000017237	RAB7A	100	99.034	Anabas_testudineus
ENSPREG00000012148	RAB7A	85	98.870	ENSAPLG00000004323	RAB7A	100	98.870	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.551	ENSACAG00000005993	RAB7A	100	98.551	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSANAG00000029692	RAB7A	100	98.068	Aotus_nancymaae
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ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	99.034	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	78.095	ENSACLG00000024456	-	100	78.095	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	95.652	ENSAMXG00000002254	-	100	95.652	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.517	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	99.517	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	91.304	ENSAMXG00000031957	zgc:100918	100	91.304	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.585	ENSBTAG00000010193	RAB7A	100	97.585	Bos_taurus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCJAG00000017521	RAB7A	100	98.068	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	98.068	Canis_familiaris
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	98.068	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.101	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	97.101	Capra_hircus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	98.068	Carlito_syrichta
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.551	ENSCAPG00000010881	RAB7A	100	98.551	Cavia_aperea
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.551	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	98.551	Cavia_porcellus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	98.068	Cebus_capucinus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	75.845	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	75.845	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCSAG00000008628	RAB7A	100	98.068	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000012148	RAB7A	85	98.864	ENSCHOG00000000365	RAB7A	100	98.864	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCPBG00000014343	RAB7A	100	98.068	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	83.575	ENSCING00000007769	-	100	83.575	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	83.092	ENSCSAVG00000011162	-	100	83.092	Ciona_savignyi
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	98.068	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.585	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	97.585	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.585	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	97.585	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSCSEG00000005357	-	100	99.034	Cynoglossus_semilaevis
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ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.551	ENSCVAG00000000281	RAB7A	100	98.551	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.517	ENSCVAG00000005429	-	100	99.517	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	91.304	ENSDARG00000087243	zgc:100918	100	91.304	Danio_rerio
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	88.406	ENSDARG00000021287	rab7b	100	88.406	Danio_rerio
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.517	ENSDARG00000020497	rab7a	100	99.517	Danio_rerio
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	98.068	ENSDORG00000027671	-	100	98.068	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	76.812	FBgn0015795	Rab7	100	76.812	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	76.329	ENSEBUG00000003339	-	100	76.329	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.101	ENSEASG00005006800	RAB7A	100	97.101	Equus_asinus_asinus
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ENSPREG00000012148	RAB7A	100	90.338	ENSELUG00000000175	zgc:100918	100	90.338	Esox_lucius
ENSPREG00000012148	RAB7A	100	99.034	ENSELUG00000006539	RAB7A	100	99.034	Esox_lucius
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