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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000013800 (Gene tree)
Gene ID: 103470731
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38449 bases
Position: chrLG9:32152149-32190597
Accession: 103470731
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000020541	ResIII	PF04851.15	3.4e-08	1	1
ENSPREP00000020608	ResIII	PF04851.15	3.5e-08	1	1
ENSPREP00000020476	ResIII	PF04851.15	3.5e-08	1	1
ENSPREP00000020541	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1
ENSPREP00000020476	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1
ENSPREP00000020608	BRK	PF07533.16	3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000020690	SMARCA2-201	7145	XM_008419373	ENSPREP00000020476	1602 (aa)	XP_008417595	UPI0004A2B868
ENSPRET00000020756	SMARCA2-202	4734	-	ENSPREP00000020541	1568 (aa)	-	-
ENSPRET00000020823	SMARCA2-203	4710	-	ENSPREP00000020608	1569 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000013800	SMARCA2	93	71.371	ENSPREG00000014823	-	98	71.151
ENSPREG00000013800	SMARCA2	93	71.565	ENSPREG00000014608	smarca4a	99	70.204

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.337	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.209	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	90.966	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	90	77.113	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.301	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	87.886	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	87.918	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.526	ENSAOCG00000009647	-	100	91.277	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.147	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	91.090	Amphiprion_percula
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	91.346	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.093	Anabas_testudineus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	89	78.521	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	74.308	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.884	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	78.266	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	77.532	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	79.689	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	87.387	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	88.660	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	83.875	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	83.510	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.606	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	79.022	Bos_taurus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.987	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.473	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.642	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	79.379	Canis_familiaris
ENSPREG00000013800	SMARCA2	73	86.847	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.934	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.606	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	79.022	Capra_hircus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	76.624	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.970	Carlito_syrichta
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	76.333	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	77.170	Cavia_aperea
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.527	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	79.392	Cavia_porcellus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.101	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	79.876	Cebus_capucinus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.077	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	79.591	Cercocebus_atys
ENSPREG00000013800	SMARCA2	82	83.020	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.752	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000013800	SMARCA2	90	79.313	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	80.968	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	83	80.435	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.969	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	82.836	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	83.519	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.778	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	73.079	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	73.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	84.154	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	83.813	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	87	88.097	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	89.970	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	82.477	ENSDARG00000008904	smarca2	100	82.054	Danio_rerio
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.172	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.950	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.821	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	79.516	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	76	60.770	FBgn0000212	brm	83	56.597	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000013800	SMARCA2	86	58.640	ENSEBUG00000002449	-	95	61.456	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	68.173	ENSEBUG00000011442	-	97	67.718	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.542	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	79.255	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	60	91.176	ENSEEUG00000015540	-	69	78.378	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	82.036	ENSELUG00000010318	smarca2	99	80.675	Esox_lucius
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.025	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	79.317	Felis_catus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.810	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.121	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.156	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.659	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	95.318	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	95.318	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	80.964	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.401	Gadus_morhua
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.810	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.703	Gallus_gallus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	90.380	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	98	90.380	Gambusia_affinis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	86.449	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	86.073	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.540	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	79.381	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	88	85.971	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	80.336	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	90.156	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	90.411	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	79.089	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	79.899	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.790	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	79.317	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000013800	SMARCA2	92	80.139	ENSHCOG00000015348	-	97	85.520	Hippocampus_comes
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	82.688	ENSIPUG00000011060	smarca2	98	82.091	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.677	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.186	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	77.407	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	78.899	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	92.839	ENSKMAG00000015844	-	100	92.777	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	50	66.456	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	67.526	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	81.658	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.417	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.313	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.764	Loxodonta_africana
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.670	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	79.722	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.664	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.000	Macaca_mulatta
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.442	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	79.789	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000013800	SMARCA2	90	85.782	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	96	86.497	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.848	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.848	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	90.280	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	90.535	Maylandia_zebra
ENSPREG00000013800	SMARCA2	76	69.190	ENSMGAG00000005160	-	100	68.833	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	77.915	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	79.627	Microcebus_murinus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	77.778	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	79.342	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	84.144	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	84.625	Mola_mola
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.507	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	79.814	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	89.781	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.653	Monopterus_albus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	77.273	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	80.050	Mus_caroli
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.289	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.493	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	79.498	Mus_pahari
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.044	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	87.879	Mus_spretus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	78	84.945	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.023	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	76.013	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.552	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	78.657	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.879	Nannospalax_galili
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.290	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000013800	SMARCA2	91	84.882	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	77.030	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000013800	SMARCA2	93	73.995	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	72.147	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	79	81.087	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.868	Ochotona_princeps
ENSPREG00000013800	SMARCA2	97	76.151	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	79.224	Octodon_degus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	90.652	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.590	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	78	86.313	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	78.655	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	89.526	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	89.838	Oryzias_latipes
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	89.526	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	89.900	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	89.700	ENSOMEG00000009736	-	100	89.451	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000013800	SMARCA2	79	85.320	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.159	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	96	76.731	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	78.272	Ovis_aries
ENSPREG00000013800	SMARCA2	89	85.909	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	85.479	Pan_paniscus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	78.054	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	79.379	Panthera_pardus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.185	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	79.293	Pan_troglodytes
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	75.509	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	75.586	Papio_anubis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	82.649	ENSPKIG00000018469	-	100	82.090	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.050	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	78.986	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	82.194	ENSPMGG00000013696	-	98	82.387	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.299	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	78.846	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	70.183	ENSPMAG00000005337	-	97	69.289	Petromyzon_marinus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.190	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	79.628	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	98.814	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	98.814	Poecilia_formosa
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