EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000016421 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20250 bases
Position: chrLG8:21804917-21825166
Accession: 103469169
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000024360	Xpo1	PF08389.12	4.5e-20	1	1
ENSPREP00000024360	IBN_N	PF03810.19	4.7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000024606	-	8714	XM_017306419	ENSPREP00000024360	1159 (aa)	XP_017161908	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSG00000169180	XPO6	100	80.952	Homo_sapiens
ENSPREG00000016421	xpo6	96	93.577	ENSAPOG00000012873	xpo6	97	93.666	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.396	ENSAMEG00000011014	XPO6	97	74.396	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.764	ENSACIG00000008055	xpo6	97	91.943	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	93.934	ENSAOCG00000001326	xpo6	97	94.023	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000016421	xpo6	96	93.845	ENSAPEG00000016304	xpo6	97	93.934	Amphiprion_percula
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.150	ENSATEG00000002273	xpo6	97	92.239	Anabas_testudineus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.739	ENSAPLG00000007480	XPO6	97	75.739	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000016421	xpo6	96	66.488	ENSACAG00000016883	XPO6	97	66.488	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.306	ENSANAG00000031761	XPO6	97	74.306	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.596	ENSACLG00000007048	xpo6	97	92.685	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000016421	xpo6	96	76.313	ENSAMXG00000032539	xpo6	97	76.313	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.038	ENSBTAG00000010309	XPO6	97	74.038	Bos_taurus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSCJAG00000006014	XPO6	97	74.485	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSCAFG00000017356	XPO6	97	74.575	Canis_familiaris
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	74.209	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.306	ENSCHIG00000022341	XPO6	97	74.306	Capra_hircus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	71.582	ENSTSYG00000012249	XPO6	98	71.582	Carlito_syrichta
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	ENSCPOG00000012824	XPO6	97	74.217	Cavia_porcellus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	ENSCCAG00000036360	XPO6	97	74.217	Cebus_capucinus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSCATG00000034030	XPO6	97	74.575	Cercocebus_atys
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	ENSCLAG00000012270	XPO6	97	74.217	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000016421	xpo6	88	73.780	ENSCHOG00000004369	XPO6	89	73.780	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000016421	xpo6	82	82.353	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000016421	xpo6	96	44.038	ENSCING00000006884	-	97	44.038	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	43.810	ENSCSAVG00000000850	-	97	43.810	Ciona_savignyi
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSCANG00000041578	XPO6	97	74.485	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.306	ENSCGRG00001013173	Xpo6	97	74.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000016421	xpo6	96	90.901	ENSCSEG00000013622	xpo6	97	90.990	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	95.971	ENSCVAG00000017399	xpo6	97	95.971	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	76.093	ENSDARG00000041217	xpo6	99	76.224	Danio_rerio
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSDNOG00000012449	XPO6	97	74.485	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.306	ENSDORG00000000919	Xpo6	97	74.306	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000016421	xpo6	79	73.359	ENSETEG00000018768	XPO6	82	73.359	Echinops_telfairi
ENSPREG00000016421	xpo6	96	58.519	ENSEBUG00000015560	xpo6	97	58.467	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.664	ENSEASG00005017296	XPO6	97	74.664	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.843	ENSECAG00000008601	XPO6	97	74.843	Equus_caballus
ENSPREG00000016421	xpo6	94	68.727	ENSEEUG00000014587	XPO6	97	68.727	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	84.870	ENSELUG00000009159	xpo6	97	84.870	Esox_lucius
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.664	ENSFCAG00000010309	XPO6	97	74.664	Felis_catus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.918	ENSFALG00000004441	XPO6	96	76.186	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSFDAG00000012689	XPO6	97	74.485	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	95.882	ENSFHEG00000021190	xpo6	97	95.882	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.649	ENSGALG00000035360	XPO6	97	75.649	Gallus_gallus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	98.120	ENSGAFG00000004044	xpo6	97	98.120	Gambusia_affinis
ENSPREG00000016421	xpo6	94	75.390	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	75.390	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.396	ENSGGOG00000005609	XPO6	97	74.396	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.685	ENSHBUG00000019504	xpo6	97	92.774	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000016421	xpo6	90	61.321	ENSHGLG00000003865	-	98	61.321	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.843	ENSHGLG00000009679	-	97	74.843	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000016421	xpo6	90	63.050	ENSHGLG00100001081	-	98	63.050	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.843	ENSHGLG00100003673	-	97	74.843	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000016421	xpo6	96	90.446	ENSHCOG00000004987	xpo6	97	90.544	Hippocampus_comes
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.961	ENSIPUG00000006516	xpo6	97	75.961	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.127	ENSSTOG00000012161	XPO6	97	74.127	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	73.679	ENSJJAG00000019392	Xpo6	97	73.679	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	94.628	ENSKMAG00000010403	xpo6	97	94.628	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.882	ENSLBEG00000023039	xpo6	97	91.971	Labrus_bergylta
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSLACG00000017930	XPO6	97	74.575	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000016421	xpo6	93	81.129	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.129	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	73.948	ENSLAFG00000011960	XPO6	97	73.948	Loxodonta_africana
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSMFAG00000045067	XPO6	97	74.575	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSMMUG00000018623	XPO6	97	74.575	Macaca_mulatta
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSMNEG00000028587	XPO6	97	74.575	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSMLEG00000029685	XPO6	97	74.575	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.507	ENSMAMG00000001351	xpo6	98	92.039	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.685	ENSMZEG00005010620	xpo6	97	92.774	Maylandia_zebra
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.179	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.179	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000016421	xpo6	96	65.804	ENSMAUG00000012539	Xpo6	98	65.536	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.396	ENSMICG00000001923	XPO6	97	74.396	Microcebus_murinus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	ENSMOCG00000008015	Xpo6	97	74.217	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000016421	xpo6	96	90.152	ENSMMOG00000011992	xpo6	97	90.152	Mola_mola
ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.291	ENSMODG00000015516	XPO6	97	75.291	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000016421	xpo6	96	82.363	ENSMALG00000020612	xpo6	97	82.632	Monopterus_albus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	97	74.217	Mus_caroli
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.038	ENSMUSG00000000131	Xpo6	97	74.038	Mus_musculus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	97	74.217	Mus_pahari
ENSPREG00000016421	xpo6	96	73.859	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	97	73.859	Mus_spretus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.038	ENSMPUG00000012920	XPO6	95	74.038	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000016421	xpo6	96	73.948	ENSMLUG00000012970	XPO6	97	73.948	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.306	ENSNGAG00000012740	Xpo6	97	74.306	Nannospalax_galili
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.774	ENSNBRG00000007275	xpo6	97	92.864	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSNLEG00000011518	XPO6	97	74.485	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000016421	xpo6	84	73.615	ENSOPRG00000009278	XPO6	84	73.615	Ochotona_princeps
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSODEG00000012917	XPO6	97	74.575	Octodon_degus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.864	ENSONIG00000019366	xpo6	97	92.953	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.396	ENSOCUG00000002727	XPO6	97	74.396	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.153	ENSORLG00000011231	xpo6	98	90.170	Oryzias_latipes
ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.689	ENSORLG00020000386	xpo6	97	91.689	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.421	ENSORLG00015003636	xpo6	97	91.421	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.046	ENSOMEG00000016505	xpo6	97	92.046	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSOGAG00000012844	XPO6	97	74.575	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	ENSOARG00000000960	XPO6	97	74.217	Ovis_aries
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSPPAG00000033668	XPO6	97	74.485	Pan_paniscus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSPPRG00000001454	XPO6	98	74.485	Panthera_pardus
ENSPREG00000016421	xpo6	94	73.524	ENSPTIG00000016663	XPO6	97	73.524	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.485	ENSPTRG00000007919	XPO6	97	74.485	Pan_troglodytes
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSPANG00000017103	XPO6	97	74.575	Papio_anubis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	79.929	ENSPKIG00000022550	xpo6	97	79.982	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.240	ENSPSIG00000018225	XPO6	98	74.240	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000016421	xpo6	96	90.510	ENSPMGG00000014436	xpo6	98	90.510	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.127	ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	74.127	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000016421	xpo6	96	67.292	ENSPMAG00000003127	xpo6	97	67.292	Petromyzon_marinus
ENSPREG00000016421	xpo6	94	74.816	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	74.816	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	99.016	ENSPFOG00000008763	xpo6	97	99.016	Poecilia_formosa
ENSPREG00000016421	xpo6	96	98.926	ENSPLAG00000014054	xpo6	97	98.926	Poecilia_latipinna
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ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	ENSPCOG00000017886	XPO6	97	74.575	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000016421	xpo6	77	86.842	ENSPVAG00000012234	XPO6	77	86.842	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.685	ENSPNYG00000008375	xpo6	97	92.774	Pundamilia_nyererei
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