EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000017216 (Gene tree)
Gene ID: 103478731
Gene Symbol: prpf3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6629 bases
Position: chrLG16:29215769-29222397
Accession: 103478731
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000025518	PRP3	PF08572.10	4.6e-77	1	1
ENSPREP00000025518	PWI	PF01480.17	2.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000025773	-	2085	XM_008432739	ENSPREP00000025518	691 (aa)	XP_008430961	UPI0004A42218

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSG00000117360	PRPF3	100	72.286	Homo_sapiens
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.963	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	86.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	72.286	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000017216	prpf3	100	85.714	ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.421	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.819	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	87.124	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017216	prpf3	100	87.536	ENSATEG00000023583	prpf3	100	87.536	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.350	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.350	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.327	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.570	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	72.286	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.187	ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.187	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017216	prpf3	100	79.523	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	78.962	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	72.286	Bos_taurus
ENSPREG00000017216	prpf3	81	39.613	WBGene00010844	prp-3	96	36.053	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	72.286	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	72.286	Canis_familiaris
ENSPREG00000017216	prpf3	81	71.631	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.163	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	72.286	Capra_hircus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.143	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	72.429	Carlito_syrichta
ENSPREG00000017216	prpf3	93	62.500	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	62.500	Cavia_aperea
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	72.286	Cavia_porcellus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	72.286	Cebus_capucinus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	59.716	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	60.000	Cercocebus_atys
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.143	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	72.429	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000017216	prpf3	76	81.022	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	80.657	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.714	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	72.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000017216	prpf3	60	59.856	ENSCING00000003312	-	99	59.615	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000017216	prpf3	82	53.913	ENSCSAVG00000008720	-	97	54.087	Ciona_savignyi
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.429	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	71.714	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	72.286	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	72.286	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000017216	prpf3	100	83.569	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	83.711	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000017216	prpf3	100	91.799	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	91.799	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	79.943	ENSDARG00000086425	prpf3	100	79.943	Danio_rerio
ENSPREG00000017216	prpf3	99	66.715	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	67.668	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000017216	prpf3	93	71.649	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	71.957	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000017216	prpf3	80	53.559	FBgn0036915	Prp3	99	53.721	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	72.429	Echinops_telfairi
ENSPREG00000017216	prpf3	100	60.992	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	60.858	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.143	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	72.429	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	72.286	Equus_caballus
ENSPREG00000017216	prpf3	85	71.882	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	71.655	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	73.722	ENSELUG00000013624	prpf3	100	73.722	Esox_lucius
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	72.286	Felis_catus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	72.143	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000017216	prpf3	100	92.507	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	92.507	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	81.508	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	81.508	Gadus_morhua
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.493	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	72.493	Gallus_gallus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	97.685	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	97.685	Gambusia_affinis
ENSPREG00000017216	prpf3	100	84.900	ENSGACG00000011792	prpf3	100	84.900	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.571	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	74.147	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000017216	prpf3	86	77.286	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	76.991	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.207	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	86.207	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	72.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000017216	prpf3	99	52.707	ENSHGLG00000016033	-	100	52.564	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000017216	prpf3	99	52.632	ENSHGLG00100008951	-	100	52.489	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	72.143	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000017216	prpf3	100	82.286	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	83.000	Hippocampus_comes
ENSPREG00000017216	prpf3	100	79.232	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	78.663	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	72.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.963	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	87.249	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.325	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	89.130	Labrus_bergylta
ENSPREG00000017216	prpf3	93	66.615	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.462	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	72.286	Loxodonta_africana
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	72.286	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000017216	prpf3	92	71.518	ENSMMUG00000016301	PRPF3	97	73.003	Macaca_mulatta
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	72.286	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000017216	prpf3	98	49.928	ENSMLEG00000041065	-	97	49.785	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000017216	prpf3	86	77.286	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	76.991	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	85.470	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	85.470	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.486	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	87.055	Maylandia_zebra
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.493	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	72.493	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	72.286	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	74.327	Microcebus_murinus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	72.143	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000017216	prpf3	100	80.254	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	80.395	Mola_mola
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	72.286	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000017216	prpf3	100	82.857	ENSMALG00000007257	prpf3	100	82.951	Monopterus_albus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.714	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	72.000	Mus_caroli
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.714	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	72.000	Mus_musculus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.408	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	71.693	Mus_pahari
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.714	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	72.000	Mus_spretus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	70.429	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	70.714	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.612	ENSMLUG00000004646	-	100	71.897	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	72.286	Nannospalax_galili
ENSPREG00000017216	prpf3	100	85.795	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	86.076	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000017216	prpf3	90	72.524	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.003	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000017216	prpf3	83	63.127	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	64.463	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.920	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	72.206	Ochotona_princeps
ENSPREG00000017216	prpf3	99	54.908	ENSODEG00000014412	-	100	55.050	Octodon_degus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSODEG00000011363	-	100	72.286	Octodon_degus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.913	ENSONIG00000006394	prpf3	100	87.340	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	55.811	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.603	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	72.286	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.475	ENSORLG00000010330	prpf3	100	86.043	Oryzias_latipes
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.619	ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.187	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000017216	prpf3	100	86.331	ENSORLG00015015016	prpf3	100	85.899	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000017216	prpf3	100	88.075	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	88.075	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000017216	prpf3	99	68.324	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.608	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.286	Ovis_aries
ENSPREG00000017216	prpf3	99	71.857	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	72.143	Pan_paniscus
ENSPREG00000017216	prpf3	98	55.733	ENSPPAG00000043769	-	99	55.072	Pan_paniscus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	72.286	Panthera_pardus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	72.286	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	72.286	Pan_troglodytes
ENSPREG00000017216	prpf3	98	54.717	ENSPTRG00000047819	-	99	54.058	Pan_troglodytes
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ENSPREG00000017216	prpf3	100	80.878	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.453	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.103	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	72.103	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000017216	prpf3	100	75.145	ENSPMGG00000007776	prpf3	100	75.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.000	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	72.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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