EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000017326 (Gene tree)
Gene ID: 103473865
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36652 bases
Position: chrLG12:19903523-19940174
Accession: 103473865
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000025677	MIF4G	PF02854.19	5.7e-25	1	1
ENSPREP00000025656	MIF4G	PF02854.19	4.8e-15	1	1
ENSPREP00000025688	MIF4G	PF02854.19	4.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000025933	-	2179	XM_008424481	ENSPREP00000025677	704 (aa)	XP_008422703	UPI0004A4C69A
ENSPRET00000025912	-	5343	-	ENSPREP00000025656	688 (aa)	-	-
ENSPRET00000025944	-	5416	-	ENSPREP00000025688	691 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000017326's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000017326's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.883	ENSG00000134030	CTIF	99	50.989	Homo_sapiens
ENSPREG00000017326	ctif	85	80.601	ENSAPOG00000020192	ctif	99	79.434	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017326	ctif	82	51.624	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	48.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000017326	ctif	100	77.401	ENSACIG00000017099	ctif	100	77.119	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017326	ctif	100	73.901	ENSAOCG00000014275	ctif	100	74.326	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017326	ctif	100	80.142	ENSAPEG00000016975	ctif	100	80.142	Amphiprion_percula
ENSPREG00000017326	ctif	100	80.142	ENSATEG00000016752	ctif	100	79.149	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.661	ENSACAG00000018006	CTIF	86	53.667	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.186	ENSANAG00000024925	CTIF	99	51.412	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000017326	ctif	100	79.149	ENSACLG00000005956	ctif	100	78.582	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017326	ctif	99	61.259	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.259	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.684	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	51.058	Bos_taurus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.676	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	50.494	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000017326	ctif	97	49.928	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	50.279	Canis_familiaris
ENSPREG00000017326	ctif	97	51.359	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	50.279	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.633	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	50.421	Capra_hircus
ENSPREG00000017326	ctif	82	51.531	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	51.361	Carlito_syrichta
ENSPREG00000017326	ctif	99	48.880	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	47.465	Cavia_aperea
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.247	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	49.654	Cavia_porcellus
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.702	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	49.930	Cebus_capucinus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.542	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.000	Cercocebus_atys
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.314	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	50.560	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.542	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	50.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000017326	ctif	99	56.399	ENSCPBG00000025654	CTIF	99	54.993	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.758	ENSCANG00000030916	CTIF	99	54.007	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.654	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	52.514	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.136	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	48.641	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000017326	ctif	100	73.034	ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.140	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000017326	ctif	100	85.248	ENSCVAG00000017158	ctif	100	85.248	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	63.713	ENSDARG00000090617	ctif	100	63.916	Danio_rerio
ENSPREG00000017326	ctif	70	54.141	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	52.823	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.327	ENSDORG00000003221	Ctif	99	50.776	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.774	ENSEASG00005016094	CTIF	100	50.562	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.412	ENSECAG00000020473	CTIF	100	51.271	Equus_caballus
ENSPREG00000017326	ctif	78	53.819	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	52.482	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000017326	ctif	99	61.968	ENSELUG00000008733	ctif	100	62.938	Esox_lucius
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.028	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	50.419	Felis_catus
ENSPREG00000017326	ctif	97	50.798	ENSFALG00000008943	CTIF	98	50.723	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.653	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	49.931	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000017326	ctif	100	87.006	ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000017326	ctif	99	54.028	ENSGALG00000035912	-	74	89.583	Gallus_gallus
ENSPREG00000017326	ctif	100	91.255	ENSGAFG00000011896	ctif	96	98.305	Gambusia_affinis
ENSPREG00000017326	ctif	63	53.258	ENSGAGG00000020663	CTIF	91	56.777	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.883	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	50.141	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000017326	ctif	100	79.291	ENSHBUG00000018092	ctif	100	78.723	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.192	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	50.706	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.334	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	50.565	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000017326	ctif	87	67.965	ENSHCOG00000011784	ctif	98	67.826	Hippocampus_comes
ENSPREG00000017326	ctif	99	61.361	ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.102	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.028	ENSSTOG00000001967	CTIF	91	59.548	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	49.155	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	49.014	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000017326	ctif	100	76.528	ENSKMAG00000014651	ctif	100	76.699	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000017326	ctif	99	63.534	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.114	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	44.939	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	74.717	Loxodonta_africana
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.186	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	65.000	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.542	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	65.000	Macaca_mulatta
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.542	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	65.000	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000017326	ctif	99	53.305	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	65.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000017326	ctif	100	79.149	ENSMAMG00000014741	ctif	100	78.865	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000017326	ctif	90	77.251	ENSMZEG00005019767	ctif	90	76.619	Maylandia_zebra
ENSPREG00000017326	ctif	90	35.670	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.393	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	51.182	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.542	ENSMICG00000010167	CTIF	100	51.685	Microcebus_murinus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.831	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	51.690	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000017326	ctif	100	75.071	ENSMMOG00000000831	ctif	100	75.071	Mola_mola
ENSPREG00000017326	ctif	99	48.641	ENSMODG00000003464	CTIF	100	48.451	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000017326	ctif	68	80.769	ENSMALG00000020553	ctif	99	80.769	Monopterus_albus
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.339	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	49.661	Mus_caroli
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.477	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	50.341	Mus_musculus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.101	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	51.961	Mus_pahari
ENSPREG00000017326	ctif	99	49.932	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	74.510	Mus_spretus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.753	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	50.140	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.700	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	50.560	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.120	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	50.980	Nannospalax_galili
ENSPREG00000017326	ctif	100	75.887	ENSNBRG00000008679	ctif	100	75.319	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.617	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	50.774	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000017326	ctif	99	46.459	ENSMEUG00000000218	CTIF	85	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.700	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	50.909	Ochotona_princeps
ENSPREG00000017326	ctif	99	48.993	ENSODEG00000018390	CTIF	100	48.794	Octodon_degus
ENSPREG00000017326	ctif	87	66.945	ENSONIG00000007750	ctif	100	69.132	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000017326	ctif	81	43.513	ENSOANG00000001337	CTIF	99	43.513	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.843	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	50.702	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000017326	ctif	100	75.141	ENSORLG00000005786	ctif	100	75.141	Oryzias_latipes
ENSPREG00000017326	ctif	100	74.504	ENSORLG00020005385	ctif	100	74.504	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000017326	ctif	100	74.929	ENSORLG00015011872	ctif	100	74.929	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000017326	ctif	100	75.672	ENSOMEG00000007917	ctif	100	75.672	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.199	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	51.058	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.986	ENSOARG00000003754	CTIF	100	50.774	Ovis_aries
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.883	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.000	Pan_paniscus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.955	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	50.349	Panthera_pardus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.743	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	50.139	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.883	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.000	Pan_troglodytes
ENSPREG00000017326	ctif	99	53.305	ENSPANG00000017087	CTIF	98	65.000	Papio_anubis
ENSPREG00000017326	ctif	81	53.779	ENSPKIG00000011234	ctif	93	63.757	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.622	ENSPSIG00000006508	CTIF	99	50.353	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000017326	ctif	100	69.774	ENSPMGG00000022958	ctif	100	67.468	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.477	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	51.336	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000017326	ctif	74	50.286	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	60.725	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000017326	ctif	100	95.056	ENSPFOG00000009243	ctif	100	95.056	Poecilia_formosa
ENSPREG00000017326	ctif	100	95.198	ENSPLAG00000019171	ctif	100	95.198	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000017326	ctif	100	95.056	ENSPMEG00000020089	ctif	100	95.056	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000017326	ctif	81	54.181	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	53.913	Pongo_abelii
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.140	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	49.930	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.809	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	50.912	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000017326	ctif	100	79.291	ENSPNYG00000007879	ctif	100	78.723	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000017326	ctif	89	74.632	ENSPNAG00000029174	ctif	100	64.146	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.977	ENSRNOG00000018342	Ctif	90	64.650	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.260	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	50.563	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.045	ENSRROG00000006039	CTIF	100	50.914	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000017326	ctif	99	51.268	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	50.423	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000017326	ctif	99	47.893	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	48.107	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000017326	ctif	99	63.662	ENSSFOG00015022594	ctif	100	63.083	Scleropages_formosus
ENSPREG00000017326	ctif	89	76.322	ENSSMAG00000005707	ctif	100	76.596	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000017326	ctif	100	77.159	ENSSDUG00000016033	ctif	100	77.994	Seriola_dumerili
ENSPREG00000017326	ctif	87	75.292	ENSSLDG00000007282	ctif	100	76.312	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.684	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	51.893	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000017326	ctif	88	79.545	ENSSPAG00000003721	ctif	96	79.849	Stegastes_partitus
ENSPREG00000017326	ctif	99	50.352	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	50.140	Sus_scrofa
ENSPREG00000017326	ctif	99	49.183	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	49.524	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000017326	ctif	83	71.229	ENSTNIG00000018763	ctif	100	60.085	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000017326	ctif	70	67.500	ENSTBEG00000002613	CTIF	77	67.500	Tupaia_belangeri
ENSPREG00000017326	ctif	99	47.983	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	47.778	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000017326	ctif	85	50.503	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	49.161	Ursus_americanus
ENSPREG00000017326	ctif	99	52.475	ENSUMAG00000002735	CTIF	100	50.847	Ursus_maritimus
ENSPREG00000017326	ctif	97	51.076	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	50.000	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000017326	ctif	73	62.745	ENSXETG00000026836	ctif	79	63.072	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000017326	ctif	58	90.049	ENSXCOG00000002477	ctif	88	89.975	Xiphophorus_couchianus
ENSPREG00000017326	ctif	100	91.489	ENSXMAG00000004236	ctif	100	93.191	Xiphophorus_maculatus