EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000017744 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2510 bases
Position: chrLG16:16019268-16021777
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000026250	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	6.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000026518	-	837	-	ENSPREP00000026250	278 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.351	ENSG00000152464	RPP38	100	42.262	Homo_sapiens
ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.891	ENSAPOG00000001240	rpp38	93	63.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.254	ENSAMEG00000018832	RPP38	96	41.343	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.891	ENSACIG00000011592	rpp38	94	64.151	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	60.595	ENSAOCG00000017293	rpp38	93	61.071	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.314	ENSAPEG00000002315	rpp38	93	64.286	Amphiprion_percula
ENSPREG00000017744	rpp38	95	63.258	ENSATEG00000000731	rpp38	94	62.879	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017744	rpp38	91	43.922	ENSAPLG00000002054	RPP38	92	44.403	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.922	ENSACLG00000016958	rpp38	93	63.774	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.314	ENSACLG00000016962	rpp38	93	64.151	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017744	rpp38	92	40.613	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.860	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.351	ENSBTAG00000007702	RPP38	96	40.345	Bos_taurus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.049	ENSCAFG00000024373	RPP38	96	40.283	Canis_familiaris
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.049	ENSCAFG00020008008	RPP38	96	40.283	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000017744	rpp38	93	42.045	ENSCHIG00000012484	RPP38	89	42.007	Capra_hircus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	42.435	ENSCPOG00000003981	RPP38	90	42.701	Cavia_porcellus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.869	ENSCLAG00000010194	RPP38	96	41.869	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000017744	rpp38	95	40.071	ENSCSAG00000019055	RPP38	89	41.379	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.105	ENSCHOG00000004335	RPP38	96	42.268	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000017744	rpp38	93	39.615	ENSCGRG00001001395	Rpp38	89	39.768	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000017744	rpp38	93	39.615	ENSCGRG00000017441	Rpp38	89	39.768	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000017744	rpp38	93	55.939	ENSCSEG00000001721	rpp38	95	54.982	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000017744	rpp38	96	72.000	ENSCVAG00000001676	rpp38	99	72.028	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	46.617	ENSDARG00000040350	rpp38	93	46.350	Danio_rerio
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.845	ENSDNOG00000040314	RPP38	96	40.845	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.985	ENSDORG00000009783	Rpp38	89	41.221	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.313	ENSETEG00000002839	RPP38	89	39.033	Echinops_telfairi
ENSPREG00000017744	rpp38	93	38.931	ENSEASG00005019783	RPP38	88	39.474	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	38.202	ENSEEUG00000014677	RPP38	90	37.736	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	49.643	ENSELUG00000010160	rpp38	95	48.797	Esox_lucius
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.215	ENSFCAG00000022449	RPP38	96	40.893	Felis_catus
ENSPREG00000017744	rpp38	91	42.969	ENSFALG00000014804	RPP38	90	42.164	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000017744	rpp38	97	39.860	ENSFDAG00000018669	RPP38	96	39.860	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000017744	rpp38	96	75.000	ENSFHEG00000013741	rpp38	99	75.175	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000017744	rpp38	91	47.287	ENSGALG00000008794	RPP38	88	45.522	Gallus_gallus
ENSPREG00000017744	rpp38	53	68.243	ENSGACG00000009258	rpp38	91	68.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.922	ENSHBUG00000010937	rpp38	93	63.396	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.053	ENSHGLG00000012144	RPP38	96	40.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000017744	rpp38	92	41.245	ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.377	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.304	ENSSTOG00000025699	RPP38	87	39.925	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	42.857	ENSJJAG00000007523	Rpp38	90	41.667	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	59.542	ENSKMAG00000003986	rpp38	92	59.636	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000017744	rpp38	95	61.194	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	61.567	Labrus_bergylta
ENSPREG00000017744	rpp38	91	45.353	ENSLACG00000006502	RPP38	92	43.214	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000017744	rpp38	95	42.336	ENSLOCG00000018347	rpp38	92	43.333	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.636	ENSLAFG00000000509	RPP38	96	40.636	Loxodonta_africana
ENSPREG00000017744	rpp38	95	40.071	ENSMMUG00000007679	RPP38	96	40.426	Macaca_mulatta
ENSPREG00000017744	rpp38	94	59.696	ENSMAMG00000012774	rpp38	91	60.456	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.922	ENSMZEG00005003200	rpp38	93	63.774	Maylandia_zebra
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.706	ENSMZEG00005003189	rpp38	93	64.151	Maylandia_zebra
ENSPREG00000017744	rpp38	91	48.062	ENSMGAG00000008217	RPP38	88	45.556	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000017744	rpp38	93	39.231	ENSMAUG00000003644	Rpp38	89	39.768	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.000	ENSMOCG00000007020	Rpp38	89	40.000	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000017744	rpp38	94	56.654	ENSMMOG00000003446	rpp38	92	56.654	Mola_mola
ENSPREG00000017744	rpp38	96	42.238	ENSMODG00000024091	RPP38	96	42.708	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000017744	rpp38	95	56.522	ENSMALG00000002356	rpp38	94	56.522	Monopterus_albus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.684	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	89	41.154	Mus_caroli
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.684	ENSMUSG00000049950	Rpp38	89	41.065	Mus_musculus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.825	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	89	41.762	Mus_pahari
ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.065	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	89	41.445	Mus_spretus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.606	ENSMPUG00000018523	RPP38	97	41.696	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000017744	rpp38	72	44.076	ENSMLUG00000002153	RPP38	96	39.362	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.353	ENSNGAG00000011066	Rpp38	89	42.366	Nannospalax_galili
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.281	ENSNBRG00000006994	rpp38	94	64.528	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.062	ENSONIG00000020467	rpp38	92	64.906	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000017744	rpp38	90	39.313	ENSOCUG00000022768	-	89	40.152	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000017744	rpp38	90	39.474	ENSOCUG00000024367	-	89	40.152	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000017744	rpp38	96	62.222	ENSORLG00000009219	rpp38	99	61.786	Oryzias_latipes
ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.646	ENSORLG00020011503	rpp38	93	61.957	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.202	ENSORLG00015017702	rpp38	90	63.670	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.035	ENSOMEG00000005414	rpp38	93	62.547	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.840	ENSOGAG00000008059	RPP38	89	41.762	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000017744	rpp38	93	42.045	ENSOARG00000004534	RPP38	89	42.007	Ovis_aries
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.053	ENSPPAG00000041577	RPP38	88	41.404	Pan_paniscus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.522	ENSPPRG00000015329	RPP38	96	40.206	Panthera_pardus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.522	ENSPTIG00000007188	RPP38	96	40.206	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.053	ENSPTRG00000002318	RPP38	88	41.404	Pan_troglodytes
ENSPREG00000017744	rpp38	96	44.043	ENSPKIG00000025652	rpp38	90	44.526	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000017744	rpp38	94	43.446	ENSPSIG00000001527	RPP38	91	43.446	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.310	ENSPEMG00000008375	Rpp38	89	41.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000017744	rpp38	93	43.123	ENSPCIG00000009096	RPP38	85	42.366	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000017744	rpp38	78	88.532	ENSPFOG00000016823	rpp38	100	88.532	Poecilia_formosa
ENSPREG00000017744	rpp38	97	92.565	ENSPLAG00000007626	rpp38	95	92.565	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000017744	rpp38	93	82.946	ENSPMEG00000020392	rpp38	94	83.271	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.702	ENSPPYG00000002113	RPP38	96	41.053	Pongo_abelii
ENSPREG00000017744	rpp38	95	41.281	ENSPVAG00000007155	RPP38	96	41.869	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.314	ENSPNYG00000004293	rpp38	93	63.774	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000017744	rpp38	92	43.023	ENSPNAG00000010633	rpp38	93	42.164	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000017744	rpp38	93	44.402	ENSRNOG00000038025	Rpp38	89	42.636	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	42.379	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	42.586	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000017744	rpp38	95	60.000	ENSSMAG00000018276	rpp38	93	59.623	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	61.240	ENSSDUG00000001651	rpp38	94	61.798	Seriola_dumerili
ENSPREG00000017744	rpp38	92	63.178	ENSSLDG00000014355	rpp38	94	62.172	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000017744	rpp38	93	36.822	ENSSARG00000012099	RPP38	87	36.822	Sorex_araneus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	41.509	ENSSPUG00000005237	-	90	39.700	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	42.322	ENSSPUG00000018363	-	90	42.322	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000017744	rpp38	94	40.449	ENSSPUG00000008560	-	91	38.491	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000017744	rpp38	92	58.824	ENSSPAG00000020387	rpp38	92	58.491	Stegastes_partitus
ENSPREG00000017744	rpp38	93	38.768	ENSSSCG00000027110	RPP38	89	38.768	Sus_scrofa
ENSPREG00000017744	rpp38	91	44.706	ENSTGUG00000001366	RPP38	93	44.403	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000017744	rpp38	99	53.818	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	53.818	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000017744	rpp38	97	40.206	ENSTTRG00000004420	RPP38	96	39.519	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.606	ENSUAMG00000002618	RPP38	96	40.636	Ursus_americanus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.308	ENSUMAG00000012382	RPP38	96	41.754	Ursus_maritimus
ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.403	ENSVVUG00000005272	RPP38	96	41.549	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000017744	rpp38	96	38.652	ENSXETG00000003419	rpp38	99	38.776	Xenopus_tropicalis