EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000017746 (Gene tree)
Gene ID: 103473255
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18970 bases
Position: chrLG12:3603656-3622625
Accession: 103473255
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000026306	ResIII	PF04851.15	1.8e-07	1	1
ENSPREP00000026321	ResIII	PF04851.15	2.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000026574	-	3915	-	ENSPREP00000026306	1304 (aa)	-	-
ENSPRET00000026589	-	5147	XM_008423349	ENSPREP00000026321	1405 (aa)	XP_008421571	UPI0004A444F8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000017746	sbno1	75	65.596	ENSPREG00000006755	si:ch73-63e15.2	62	65.596

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.753	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.740	Homo_sapiens
ENSPREG00000017746	sbno1	88	92.900	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.524	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.562	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000017746	sbno1	100	86.178	ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.389	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	92.839	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.689	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017746	sbno1	99	92.755	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	90.618	Amphiprion_percula
ENSPREG00000017746	sbno1	100	91.335	ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.335	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017746	sbno1	98	76.327	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.147	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000017746	sbno1	98	74.929	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.754	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.666	ENSANAG00000029958	-	99	83.154	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000017746	sbno1	99	86.323	ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.650	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017746	sbno1	100	81.644	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	82.211	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	75.961	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.949	Bos_taurus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	76.037	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.792	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.768	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	84.752	Canis_familiaris
ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.790	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.969	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.154	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.154	Capra_hircus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.753	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.117	Carlito_syrichta
ENSPREG00000017746	sbno1	96	77.013	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.303	Cavia_aperea
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.303	Cavia_porcellus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	71.640	ENSCCAG00000035316	SBNO1	91	82.707	Cebus_capucinus
ENSPREG00000017746	sbno1	91	83.935	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	83.483	Cercocebus_atys
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.303	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000017746	sbno1	89	81.826	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.186	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000017746	sbno1	93	83.150	ENSCHOG00000008814	SBNO1	88	83.251	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000017746	sbno1	98	75.827	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.372	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000017746	sbno1	98	74.119	ENSCANG00000042688	-	99	72.062	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000017746	sbno1	95	82.079	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000017746	sbno1	95	82.079	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000017746	sbno1	100	87.633	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.562	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000017746	sbno1	100	95.164	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	94.950	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	82.123	ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.219	Danio_rerio
ENSPREG00000017746	sbno1	99	78.327	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	78.327	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	71.345	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.700	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000017746	sbno1	93	72.642	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	Echinops_telfairi
ENSPREG00000017746	sbno1	73	65.209	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.941	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000017746	sbno1	51	72.902	ENSEASG00005012595	-	77	88.397	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.944	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.616	Equus_caballus
ENSPREG00000017746	sbno1	81	77.596	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.596	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	86.391	ENSELUG00000002886	sbno1	99	82.790	Esox_lucius
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.874	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.721	Felis_catus
ENSPREG00000017746	sbno1	98	76.471	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.147	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.797	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.251	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000017746	sbno1	100	95.092	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	94.879	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000017746	sbno1	94	85.135	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.071	Gadus_morhua
ENSPREG00000017746	sbno1	88	76.452	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.316	Gallus_gallus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	97.794	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	97.794	Gambusia_affinis
ENSPREG00000017746	sbno1	95	88.897	ENSGACG00000015633	sbno1	100	88.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000017746	sbno1	94	83.643	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.509	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.303	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000017746	sbno1	99	80.164	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	79.449	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000017746	sbno1	95	84.029	ENSHGLG00000014165	-	99	83.633	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000017746	sbno1	92	91.865	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	91.865	Hippocampus_comes
ENSPREG00000017746	sbno1	100	81.683	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	82.249	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.303	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.734	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.783	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	92.939	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	92.939	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	88.944	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	89.086	Labrus_bergylta
ENSPREG00000017746	sbno1	100	72.312	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.324	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000017746	sbno1	100	81.351	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.929	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.315	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.299	Loxodonta_africana
ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.107	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.107	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.107	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.107	Macaca_mulatta
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.303	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	91.032	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	90.819	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000017746	sbno1	98	76.652	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.325	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000017746	sbno1	50	74.148	ENSMAUG00000004834	-	82	90.487	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.762	ENSMICG00000006573	-	99	80.287	Microcebus_murinus
ENSPREG00000017746	sbno1	95	82.796	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.796	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000017746	sbno1	100	82.942	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	83.736	Mola_mola
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.649	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.865	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.915	ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.915	Monopterus_albus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.439	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.228	Mus_caroli
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.456	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.228	Mus_musculus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	76.059	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.228	Mus_pahari
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.386	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.228	Mus_spretus
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ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.755	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.510	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000017746	sbno1	92	84.180	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.180	Nannospalax_galili
ENSPREG00000017746	sbno1	100	85.480	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	85.552	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000017746	sbno1	99	72.950	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.404	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000017746	sbno1	62	72.956	ENSMEUG00000008768	-	93	73.585	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000017746	sbno1	96	81.389	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.581	Ochotona_princeps
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.483	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.483	Octodon_degus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.844	ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.915	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000017746	sbno1	98	75.036	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.946	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.062	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.062	Oryzias_latipes
ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.481	ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.552	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.339	ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.410	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000017746	sbno1	99	90.855	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	88.762	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000017746	sbno1	50	72.034	ENSOGAG00000010781	-	98	72.521	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000017746	sbno1	100	75.490	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.792	Ovis_aries
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.303	Pan_paniscus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.874	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.721	Panthera_pardus
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.772	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.740	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.303	Pan_troglodytes
ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.303	Papio_anubis
ENSPREG00000017746	sbno1	100	80.707	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.452	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000017746	sbno1	89	79.679	ENSPSIG00000009256	-	99	74.786	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000017746	sbno1	98	75.627	ENSPSIG00000009572	-	99	75.405	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000017746	sbno1	95	82.616	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.616	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.828	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.952	Phascolarctos_cinereus
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ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.607	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	83.607	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000017746	sbno1	87	83.698	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.698	Pteropus_vampyrus
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