EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000017750 (Gene tree)
Gene ID: 103465062
Gene Symbol: RAB7A (1 of many)
Alias: rab7|zgc:64058
Full Name: ras-related protein Rab-7a-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3295 bases
Position: chrLG5:15994104-15997398
Accession: 103465062
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000026260	MMR_HSR1	PF01926.23	5e-07	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret04137	Mitophagy - animal	KEGG
pret04140	Autophagy - animal	KEGG
pret04144	Endocytosis	KEGG
pret04145	Phagosome	KEGG
pret05132	Salmonella infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSPREG00000017750	RAB7A	89	30.108	ENSPREG00000009813	rab34b	72	30.108
ENSPREG00000017750	RAB7A	73	31.788	ENSPREG00000006363	rras	81	32.515
ENSPREG00000017750	RAB7A	97	36.620	ENSPREG00000017344	-	95	36.620
ENSPREG00000017750	RAB7A	86	53.371	ENSPREG00000006970	rab9b	81	53.371
ENSPREG00000017750	RAB7A	96	35.500	ENSPREG00000021505	rab6a	94	35.500
ENSPREG00000017750	RAB7A	76	30.357	ENSPREG00000013742	nkiras1	81	30.357
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ENSPREG00000017750	RAB7A	82	36.612	ENSPREG00000000880	rab33ba	76	36.612
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ENSPREG00000017750	RAB7A	88	36.957	ENSPREG00000014634	rab30	88	36.957
ENSPREG00000017750	RAB7A	82	39.080	ENSPREG00000003221	rab33a	50	39.080
ENSPREG00000017750	RAB7A	78	39.877	ENSPREG00000006336	-	72	39.877
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ENSPREG00000017750	RAB7A	78	41.718	ENSPREG00000009605	rab11a	73	41.718
ENSPREG00000017750	RAB7A	82	39.645	ENSPREG00000017517	zgc:171927	77	39.645
ENSPREG00000017750	RAB7A	99	38.835	ENSPREG00000010146	rab5c	78	42.614
ENSPREG00000017750	RAB7A	81	39.286	ENSPREG00000005923	rab18a	66	39.286
ENSPREG00000017750	RAB7A	73	33.775	ENSPREG00000019341	hrasb	83	34.568
ENSPREG00000017750	RAB7A	78	40.491	ENSPREG00000017324	rab11al	73	40.491
ENSPREG00000017750	RAB7A	82	38.824	ENSPREG00000004889	-	79	38.824
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ENSPREG00000017750	RAB7A	92	36.649	ENSPREG00000014888	rab2a	83	36.649
ENSPREG00000017750	RAB7A	79	39.264	ENSPREG00000003616	rab1ba	79	39.264
ENSPREG00000017750	RAB7A	83	38.150	ENSPREG00000005323	si:dkey-16l2.16	80	38.150
ENSPREG00000017750	RAB7A	78	39.877	ENSPREG00000006357	rab11ba	56	39.877
ENSPREG00000017750	RAB7A	79	35.366	ENSPREG00000009597	-	76	35.366
ENSPREG00000017750	RAB7A	83	40.462	ENSPREG00000022167	-	84	40.476
ENSPREG00000017750	RAB7A	79	35.366	ENSPREG00000007129	RAB39B	76	35.366
ENSPREG00000017750	RAB7A	75	33.333	ENSPREG00000018287	KRAS	87	33.929
ENSPREG00000017750	RAB7A	82	35.882	ENSPREG00000006119	rab25a	80	37.313
ENSPREG00000017750	RAB7A	84	35.955	ENSPREG00000010284	rab15	80	35.955
ENSPREG00000017750	RAB7A	98	35.885	ENSPREG00000007017	zgc:101559	86	35.885
ENSPREG00000017750	RAB7A	54	31.532	ENSPREG00000016664	rap2b	91	33.333
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSPREG00000012148	RAB7A	100	97.585
ENSPREG00000017750	RAB7A	88	37.158	ENSPREG00000010154	rab4a	84	37.158
ENSPREG00000017750	RAB7A	80	34.118	ENSPREG00000019783	RAB15	77	34.118
ENSPREG00000017750	RAB7A	76	34.591	ENSPREG00000022509	rab23	83	35.057
ENSPREG00000017750	RAB7A	80	31.138	ENSPREG00000017010	rasd4	78	31.138
ENSPREG00000017750	RAB7A	79	34.337	ENSPREG00000013962	rab42a	74	34.337
ENSPREG00000017750	RAB7A	86	34.831	ENSPREG00000020276	RAB29	86	34.831
ENSPREG00000017750	RAB7A	96	35.500	ENSPREG00000009535	RAB41	92	35.500
ENSPREG00000017750	RAB7A	79	40.854	ENSPREG00000010920	rab22a	82	40.854
ENSPREG00000017750	RAB7A	77	34.161	ENSPREG00000016102	si:ch73-116o1.2	80	35.465
ENSPREG00000017750	RAB7A	81	35.503	ENSPREG00000010228	dnajc27	86	35.503
ENSPREG00000017750	RAB7A	80	34.940	ENSPREG00000014761	rabl2	78	34.940
ENSPREG00000017750	RAB7A	78	40.491	ENSPREG00000014269	rab11bb	72	40.491
ENSPREG00000017750	RAB7A	78	37.423	ENSPREG00000017337	rab25b	76	37.423

Orthologs

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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSG00000075785	RAB7A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.551	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	98.551	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSAPOG00000016091	-	100	97.585	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	96.135	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	86.473	ENSACIG00000022208	-	100	86.473	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	97.585	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	94.203	ENSACIG00000022381	-	100	94.203	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSAOCG00000008820	-	100	97.585	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.551	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	98.551	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.551	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	98.551	Amphiprion_percula
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSAPEG00000017200	RAB7A	100	97.585	Amphiprion_percula
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.585	ENSATEG00000002860	RAB7A	100	97.585	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.551	ENSATEG00000017237	RAB7A	100	98.551	Anabas_testudineus
ENSPREG00000017750	RAB7A	85	97.740	ENSAPLG00000004323	RAB7A	100	97.740	Anas_platyrhynchos
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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	94.203	ENSACLG00000024502	-	100	94.203	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.551	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	98.551	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.068	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	98.068	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	93.720	ENSAMXG00000002254	-	100	93.720	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	89.855	ENSAMXG00000031957	zgc:100918	100	89.855	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSBTAG00000010193	RAB7A	100	96.135	Bos_taurus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCJAG00000017521	RAB7A	100	96.135	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	96.135	Canis_familiaris
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	96.135	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	95.169	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	95.169	Capra_hircus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	96.135	Carlito_syrichta
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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.618	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	96.618	Cavia_porcellus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	96.135	Cebus_capucinus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	73.913	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	73.913	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCSAG00000008628	RAB7A	100	96.135	Chlorocebus_sabaeus
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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	96.135	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	95.652	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	95.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	95.652	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	95.652	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	97.101	ENSCVAG00000005429	-	100	97.101	Cyprinodon_variegatus
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ENSPREG00000017750	RAB7A	100	98.068	ENSDARG00000020497	rab7a	100	98.068	Danio_rerio
ENSPREG00000017750	RAB7A	100	96.135	ENSDORG00000027671	-	100	96.135	Dipodomys_ordii
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