EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000018619 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translational release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2803 bases
Position: chrLG2:11412731-11415533
Accession: ZDB-GENE-050220-8
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000027516	RF-1	PF00472.20	5.1e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000027816	-	687	-	ENSPREP00000027516	228 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000018619	mtrf1	94	48.908	ENSPREG00000002347	mtrf1l	53	48.927

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSG00000120662	MTRF1	52	62.661	Homo_sapiens
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSAMEG00000008696	MTRF1	52	63.090	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	75.000	ENSACIG00000001495	mtrf1	93	75.000	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000018619	mtrf1	97	76.695	ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	76.695	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000018619	mtrf1	97	76.271	ENSAPEG00000014844	mtrf1	53	76.271	Amphiprion_percula
ENSPREG00000018619	mtrf1	85	77.143	ENSATEG00000017403	mtrf1	50	77.143	Anabas_testudineus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSAPLG00000009317	MTRF1	54	63.090	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	60.515	ENSACAG00000000897	MTRF1	52	60.515	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	59.227	ENSANAG00000025310	-	64	59.227	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	57.642	ENSANAG00000023063	-	50	57.642	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	77.253	ENSACLG00000023945	mtrf1	52	77.253	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	69.099	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	69.099	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSBTAG00000012260	MTRF1	52	62.232	Bos_taurus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	58.929	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCAFG00000004795	MTRF1	52	62.661	Canis_familiaris
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCAFG00020018178	MTRF1	52	62.661	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSCHIG00000011810	MTRF1	52	62.232	Capra_hircus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.948	ENSTSYG00000006976	MTRF1	52	63.948	Carlito_syrichta
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCAPG00000013163	MTRF1	54	62.661	Cavia_aperea
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCPOG00000005264	MTRF1	52	62.661	Cavia_porcellus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSCCAG00000035116	MTRF1	52	63.090	Cebus_capucinus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSCATG00000009909	MTRF1	52	63.090	Cercocebus_atys
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	62.232	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSCSAG00000017835	MTRF1	52	63.090	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000018619	mtrf1	83	65.025	ENSCHOG00000011915	-	50	65.025	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000018619	mtrf1	97	61.277	ENSCPBG00000007969	MTRF1	52	61.277	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSCANG00000040353	MTRF1	52	63.090	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	52	62.661	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	52	62.661	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	73.391	ENSCSEG00000005667	mtrf1	52	73.391	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	79.752	ENSCVAG00000021729	mtrf1	56	79.752	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	58.369	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	58.369	Danio_rerio
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSDNOG00000034196	MTRF1	75	62.232	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSDORG00000016429	Mtrf1	52	62.661	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	61.803	ENSETEG00000014811	MTRF1	52	61.803	Echinops_telfairi
ENSPREG00000018619	mtrf1	95	53.913	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	53.913	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSEASG00005015715	MTRF1	52	62.661	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSECAG00000014389	MTRF1	51	62.232	Equus_caballus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	45.494	ENSEEUG00000004450	-	52	45.494	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	71.674	ENSELUG00000006544	mtrf1	54	71.674	Esox_lucius
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSFCAG00000031635	MTRF1	52	63.090	Felis_catus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	60.944	ENSFALG00000008036	MTRF1	58	60.944	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	63.090	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	77.155	ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	77.155	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	68.240	ENSGMOG00000008608	mtrf1	61	68.240	Gadus_morhua
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.948	ENSGALG00000016951	MTRF1	51	63.948	Gallus_gallus
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	85.537	ENSGAFG00000007093	mtrf1	55	85.537	Gambusia_affinis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	76.293	ENSGACG00000013728	mtrf1	60	76.293	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	84	62.136	ENSGAGG00000025696	MTRF1	65	62.136	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSGGOG00000002529	MTRF1	52	63.090	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000018619	mtrf1	59	69.799	ENSHBUG00000016875	-	89	69.799	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	60.944	ENSHGLG00000003210	MTRF1	52	60.944	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	60.944	ENSHGLG00100011843	MTRF1	52	60.944	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	72.103	ENSHCOG00000009449	mtrf1	53	72.103	Hippocampus_comes
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	61.803	ENSSTOG00000021682	MTRF1	52	61.803	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	52	63.519	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	73.577	ENSKMAG00000003231	mtrf1	54	73.577	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	76.824	ENSLBEG00000027169	-	93	76.824	Labrus_bergylta
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	76.824	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	76.824	Labrus_bergylta
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	65.665	ENSLACG00000010582	MTRF1	52	65.665	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	66.953	ENSLOCG00000005937	MTRF1	52	66.953	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	95	48.052	ENSLAFG00000030499	-	51	48.052	Loxodonta_africana
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSLAFG00000022177	-	52	62.232	Loxodonta_africana
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMFAG00000037972	MTRF1	52	63.090	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMNEG00000035487	MTRF1	52	63.090	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMLEG00000033582	MTRF1	52	63.090	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	74.678	ENSMAMG00000022048	mtrf1	52	74.678	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	77.253	ENSMZEG00005017922	mtrf1	52	77.253	Maylandia_zebra
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.948	ENSMGAG00000014971	MTRF1	56	63.948	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	52	63.090	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	ENSMICG00000033131	MTRF1	52	63.519	Microcebus_murinus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	52	63.090	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	71.689	ENSMMOG00000013394	mtrf1	95	71.689	Mola_mola
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	ENSMODG00000014772	MTRF1	52	63.519	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	75.966	ENSMALG00000013274	mtrf1	53	75.966	Monopterus_albus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	52	63.090	Mus_caroli
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	52	63.090	Mus_musculus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	52	63.090	Mus_pahari
ENSPREG00000018619	mtrf1	94	64.035	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	51	64.035	Mus_spretus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSMPUG00000001874	MTRF1	52	63.090	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSMLUG00000017237	MTRF1	52	62.661	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	52	63.090	Nannospalax_galili
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	76.395	ENSNBRG00000004634	mtrf1	98	76.395	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSNLEG00000001236	MTRF1	52	62.661	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	64.655	ENSMEUG00000001846	MTRF1	52	64.655	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSODEG00000005782	MTRF1	52	62.661	Octodon_degus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	77.253	ENSONIG00000012476	mtrf1	60	77.253	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	55.785	ENSOANG00000003383	-	77	55.785	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSOCUG00000025207	MTRF1	52	63.090	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	72.614	ENSORLG00000003225	mtrf1	54	72.614	Oryzias_latipes
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	73.820	ENSORLG00020021048	mtrf1	52	73.820	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	71.784	ENSORLG00015020957	mtrf1	54	71.784	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	72.199	ENSOMEG00000002022	mtrf1	54	72.199	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000018619	mtrf1	87	58.962	ENSOGAG00000026411	-	73	58.962	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSOARG00000006994	MTRF1	52	62.232	Ovis_aries
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSPPAG00000000050	MTRF1	52	62.661	Pan_paniscus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	ENSPPRG00000009511	MTRF1	52	63.519	Panthera_pardus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	ENSPTIG00000006673	MTRF1	52	63.519	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSPTRG00000005815	MTRF1	52	62.661	Pan_troglodytes
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSPANG00000010809	MTRF1	52	63.090	Papio_anubis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	64.378	ENSPKIG00000015711	mtrf1	54	64.378	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000018619	mtrf1	97	61.702	ENSPSIG00000004773	MTRF1	52	61.702	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	73.820	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	73.820	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.661	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	52	62.661	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000018619	mtrf1	83	54.808	ENSPMAG00000009849	mtrf1	59	55.288	Petromyzon_marinus
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	64.224	ENSPCIG00000012940	MTRF1	52	64.224	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	87.448	ENSPFOG00000000254	mtrf1	54	87.448	Poecilia_formosa
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	88.285	ENSPLAG00000014280	mtrf1	54	88.285	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000018619	mtrf1	99	87.083	ENSPMEG00000023245	mtrf1	54	87.083	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	62.232	ENSPPYG00000005313	MTRF1	52	62.232	Pongo_abelii
ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	ENSPCOG00000018133	MTRF1	52	63.090	Propithecus_coquereli
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