EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000018773 (Gene tree)
Gene ID: 103475137
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49548 bases
Position: chrLG13:31021948-31071495
Accession: 103475137
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000027765	Wyosine_form	PF08608.12	1.8e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000028069	-	2154	XM_008426553	ENSPREP00000027765	717 (aa)	XP_008424775	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000018773	tyw1	99	65.265	ENSG00000198874	TYW1	99	64.762	Homo_sapiens
ENSPREG00000018773	tyw1	99	57.542	ENSG00000277149	TYW1B	99	57.063	Homo_sapiens
ENSPREG00000018773	tyw1	99	79.400	ENSAPOG00000014391	tyw1	98	78.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000018773	tyw1	97	74.583	ENSACIG00000007325	tyw1	100	73.066	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	79.428	ENSAOCG00000016792	tyw1	98	78.747	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000018773	tyw1	99	79.700	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	81.928	Amphiprion_percula
ENSPREG00000018773	tyw1	89	75.412	ENSATEG00000006856	tyw1	92	74.813	Anabas_testudineus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.538	ENSANAG00000037051	-	99	63.896	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.543	ENSACLG00000018688	tyw1	98	75.136	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000018773	tyw1	97	71.389	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	71.905	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.348	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	64.626	Bos_taurus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.402	ENSCJAG00000004295	-	99	64.402	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	63.896	ENSCAFG00000010867	-	99	63.488	Canis_familiaris
ENSPREG00000018773	tyw1	99	56.528	ENSCAFG00020005367	-	99	59.794	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.075	ENSCHIG00000019510	-	99	64.666	Capra_hircus
ENSPREG00000018773	tyw1	87	64.384	ENSTSYG00000008236	-	99	64.231	Carlito_syrichta
ENSPREG00000018773	tyw1	85	62.520	ENSCAPG00000013569	-	100	62.201	Cavia_aperea
ENSPREG00000018773	tyw1	96	62.826	ENSCPOG00000011182	-	98	63.411	Cavia_porcellus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.762	ENSCCAG00000026643	-	99	64.441	Cebus_capucinus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.489	ENSCATG00000043677	-	99	64.986	Cercocebus_atys
ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.000	ENSCLAG00000006321	-	98	63.862	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000018773	tyw1	98	63.768	ENSCSAG00000018274	-	99	63.166	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000018773	tyw1	51	82.479	ENSCHOG00000003801	-	56	82.479	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000018773	tyw1	99	64.665	ENSCPBG00000014896	-	96	65.084	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000018773	tyw1	79	57.746	ENSCING00000004125	-	97	57.168	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000018773	tyw1	86	55.662	ENSCSAVG00000005712	-	100	54.304	Ciona_savignyi
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.353	ENSCANG00000033209	-	99	64.850	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000018773	tyw1	69	73.148	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	73.148	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000018773	tyw1	99	76.060	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	74.828	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000018773	tyw1	89	78.195	ENSCVAG00000001054	tyw1	94	77.744	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	69.589	ENSDARG00000062987	tyw1	96	70.467	Danio_rerio
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.898	ENSDNOG00000024165	-	99	64.481	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000018773	tyw1	85	61.254	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	62.007	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000018773	tyw1	60	74.074	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000018773	tyw1	96	65.837	ENSEASG00005008818	-	98	65.694	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.823	ENSECAG00000023164	-	98	64.815	Equus_caballus
ENSPREG00000018773	tyw1	57	81.818	ENSEEUG00000005950	-	55	81.818	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	71.214	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.018	Esox_lucius
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.437	ENSFCAG00000014262	-	99	64.891	Felis_catus
ENSPREG00000018773	tyw1	96	61.634	ENSFALG00000013810	-	99	62.500	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000018773	tyw1	98	63.179	ENSFDAG00000013270	-	99	61.757	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000018773	tyw1	81	77.850	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	77.362	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	63.144	ENSGALG00000001110	-	99	63.094	Gallus_gallus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	73.907	ENSGACG00000012692	tyw1	99	72.678	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000018773	tyw1	97	65.385	ENSGAGG00000022393	-	98	65.100	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000018773	tyw1	88	58.204	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	57.674	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.272	ENSHBUG00000002640	tyw1	98	74.864	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000018773	tyw1	86	66.937	ENSHGLG00000012093	-	100	66.234	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000018773	tyw1	98	63.946	ENSHGLG00100011743	TYW1	99	63.351	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000018773	tyw1	97	67.094	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	66.667	Hippocampus_comes
ENSPREG00000018773	tyw1	97	69.596	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	69.735	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	63.008	ENSSTOG00000004067	-	92	63.279	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000018773	tyw1	96	63.483	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	63.966	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	77.929	ENSKMAG00000018599	tyw1	98	77.520	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	60.569	ENSLACG00000018917	tyw1	97	61.164	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000018773	tyw1	96	69.861	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.942	Lepisosteus_oculatus
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.625	ENSMNEG00000041992	-	99	68.819	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.625	ENSMLEG00000039741	-	99	65.123	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	76.294	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	74.234	Mastacembelus_armatus
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	62.652	ENSMGAG00000002176	-	98	63.310	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.617	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	64.295	Mesocricetus_auratus
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	75.533	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	74.538	Mola_mola
ENSPREG00000018773	tyw1	96	63.462	ENSMODG00000025697	-	98	64.454	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000018773	tyw1	99	76.391	ENSMALG00000010238	tyw1	98	76.119	Monopterus_albus
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ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.714	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	64.575	Mus_musculus
ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.846	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	64.888	Mus_pahari
ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.435	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	64.296	Mus_spretus
ENSPREG00000018773	tyw1	89	67.638	ENSMPUG00000016191	-	95	67.025	Mustela_putorius_furo
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.730	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	64.454	Nannospalax_galili
ENSPREG00000018773	tyw1	93	76.374	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	76.162	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.722	ENSNLEG00000013210	-	98	64.578	Nomascus_leucogenys
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ENSPREG00000018773	tyw1	88	62.986	ENSODEG00000014729	-	95	62.246	Octodon_degus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	76.126	ENSONIG00000005872	tyw1	98	75.716	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000018773	tyw1	96	64.804	ENSOCUG00000003173	-	98	64.681	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.136	ENSORLG00000001393	tyw1	98	75.646	Oryzias_latipes
ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.102	ENSORLG00020019361	tyw1	98	75.374	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000018773	tyw1	99	74.627	ENSORLG00015008095	tyw1	98	74.898	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000018773	tyw1	93	65.657	ENSOGAG00000016555	-	94	65.468	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.770	ENSOARG00000010673	-	99	64.499	Ovis_aries
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.337	ENSPTIG00000019545	-	99	64.787	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000018773	tyw1	99	59.865	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	59.405	Pan_troglodytes
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.217	ENSPANG00000019053	-	99	64.714	Papio_anubis
ENSPREG00000018773	tyw1	97	70.198	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	70.621	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000018773	tyw1	94	72.340	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	72.340	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.484	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.027	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000018773	tyw1	99	90.366	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	89.589	Poecilia_formosa
ENSPREG00000018773	tyw1	99	90.095	ENSPLAG00000000838	tyw1	99	88.939	Poecilia_latipinna
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.217	ENSPPYG00000017514	TYW1	99	64.850	Pongo_abelii
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ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.353	ENSRBIG00000039619	-	99	64.986	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.625	ENSRROG00000039780	-	99	65.123	Rhinopithecus_roxellana
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