EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000020242 (Gene tree)
Gene ID: 103458022
Gene Symbol: srp9
Alias: zgc:56668
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2324 bases
Position: chrLG21:22237821-22240144
Accession: 103458022
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000029897	SRP9-21	PF05486.12	1.1e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000030238	-	261	XM_008398557	ENSPREP00000029897	86 (aa)	XP_008396779	UPI0004A31AF0

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000020242's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000020242's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSG00000143742	SRP9	100	79.070	Homo_sapiens
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSAPOG00000006089	srp9	100	95.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	80.233	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000020242	srp9	100	70.930	ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSAOCG00000014643	srp9	100	95.349	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSAPEG00000004398	srp9	100	95.349	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSATEG00000014339	srp9	100	97.674	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020242	srp9	81	82.857	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	82.857	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSACAG00000005788	SRP9	100	80.233	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSANAG00000022626	SRP9	100	80.233	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSACLG00000018392	srp9	100	97.674	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSAMXG00000010366	srp9	100	95.349	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	80.233	Bos_taurus
ENSPREG00000020242	srp9	88	53.947	WBGene00013984	ZK512.4	100	53.947	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	80.233	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	80.233	Canis_familiaris
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	80.233	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	80.233	Capra_hircus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	77.907	Carlito_syrichta
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	80.233	Cavia_porcellus
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	79.070	Cebus_capucinus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSCATG00000041813	SRP9	100	77.907	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSCLAG00000001368	-	100	79.070	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020242	srp9	99	70.588	ENSCLAG00000017687	-	99	70.588	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020242	srp9	100	54.651	ENSCHOG00000012912	-	100	54.651	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCHOG00000006096	-	100	80.233	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020242	srp9	58	74.000	ENSCHOG00000008435	-	100	74.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020242	srp9	100	83.721	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	83.721	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000020242	srp9	100	76.744	ENSCANG00000012015	-	100	76.744	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSCANG00000030765	-	100	77.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	80.233	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020242	srp9	74	75.000	ENSCGRG00000009651	Srp9	84	75.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020242	srp9	100	94.186	ENSCSEG00000018438	srp9	100	94.186	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020242	srp9	100	98.837	ENSCVAG00000001083	srp9	100	98.837	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSDARG00000042851	srp9	100	95.349	Danio_rerio
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSDNOG00000013412	-	100	80.233	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000020242	srp9	90	41.558	FBgn0035827	Srp9	100	41.558	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000020242	srp9	100	70.930	ENSETEG00000012291	SRP9	100	70.930	Echinops_telfairi
ENSPREG00000020242	srp9	98	71.429	ENSEBUG00000009080	srp9	100	71.429	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSECAG00000033839	SRP9	100	80.233	Equus_caballus
ENSPREG00000020242	srp9	100	74.419	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	74.419	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000020242	srp9	100	94.186	ENSELUG00000001506	srp9	100	94.186	Esox_lucius
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	80.233	Felis_catus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSFALG00000011689	SRP9	100	80.233	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000020242	srp9	100	82.558	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	82.558	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000020242	srp9	100	98.837	ENSFHEG00000011666	srp9	100	98.837	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000020242	srp9	100	90.698	ENSGMOG00000003565	srp9	100	90.698	Gadus_morhua
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSGALG00000026009	SRP9	100	81.395	Gallus_gallus
ENSPREG00000020242	srp9	100	100.000	ENSGAFG00000009506	srp9	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020242	srp9	100	96.512	ENSGACG00000004110	srp9	100	96.512	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	83.721	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	83.721	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	79.070	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSHBUG00000021430	srp9	100	97.674	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000020242	srp9	100	74.419	ENSHGLG00000020168	-	100	74.419	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020242	srp9	93	80.000	ENSHGLG00000020925	-	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020242	srp9	81	80.000	ENSHGLG00000019830	-	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020242	srp9	98	71.429	ENSHGLG00000006535	-	99	71.429	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	80.233	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020242	srp9	98	71.429	ENSHGLG00100009760	-	99	71.429	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020242	srp9	100	69.767	ENSHGLG00100011806	-	100	69.767	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSHGLG00100019986	-	100	81.395	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020242	srp9	95	78.049	ENSHGLG00100016521	-	100	78.049	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020242	srp9	100	74.419	ENSHGLG00100020800	-	100	74.419	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020242	srp9	100	69.767	ENSHCOG00000006978	srp9	100	69.767	Hippocampus_comes
ENSPREG00000020242	srp9	100	94.186	ENSIPUG00000020674	srp9	100	94.186	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	80.233	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	80.233	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000020242	srp9	100	96.512	ENSKMAG00000014117	srp9	100	96.512	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020242	srp9	100	96.512	ENSLBEG00000020620	srp9	100	96.512	Labrus_bergylta
ENSPREG00000020242	srp9	100	84.884	ENSLACG00000007546	SRP9	100	84.884	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000020242	srp9	100	90.698	ENSLOCG00000015903	srp9	100	90.698	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	Loxodonta_africana
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	77.907	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	77.907	Macaca_mulatta
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	77.907	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	77.907	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSMAMG00000004755	srp9	100	97.674	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSMZEG00005015517	srp9	100	97.674	Maylandia_zebra
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	81.395	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	80.233	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMICG00000030104	-	100	77.907	Microcebus_murinus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	77.907	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000020242	srp9	100	93.103	ENSMMOG00000014838	srp9	100	93.103	Mola_mola
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSMODG00000025664	SRP9	100	81.395	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSMALG00000004262	srp9	100	95.349	Monopterus_albus
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	79.070	Mus_caroli
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	79.070	Mus_musculus
ENSPREG00000020242	srp9	100	76.744	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	76.744	Mus_pahari
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	79.070	Mus_spretus
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	79.070	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	80.233	Nannospalax_galili
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSNBRG00000010915	srp9	100	97.674	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	79.070	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	80.233	Ochotona_princeps
ENSPREG00000020242	srp9	100	74.419	ENSODEG00000015075	-	100	74.419	Octodon_degus
ENSPREG00000020242	srp9	100	69.318	ENSODEG00000010125	-	76	69.318	Octodon_degus
ENSPREG00000020242	srp9	100	96.512	ENSONIG00000011409	srp9	100	96.512	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSOANG00000001472	SRP9	100	81.395	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	80.233	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000020242	srp9	100	93.023	ENSORLG00020003090	srp9	100	93.023	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000020242	srp9	100	93.023	ENSORLG00015001636	srp9	89	93.023	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000020242	srp9	100	94.186	ENSOMEG00000020548	srp9	100	94.186	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000020242	srp9	100	76.744	ENSOGAG00000031299	-	100	76.744	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000020242	srp9	100	76.744	ENSOGAG00000001752	-	100	76.744	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	79.070	Pan_paniscus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	80.233	Panthera_pardus
ENSPREG00000020242	srp9	71	77.049	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	77.049	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	79.070	Pan_troglodytes
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSPANG00000030164	SRP9	100	77.907	Papio_anubis
ENSPREG00000020242	srp9	100	88.372	ENSPKIG00000015012	srp9	100	88.372	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000020242	srp9	100	83.721	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	83.721	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000020242	srp9	100	67.442	ENSPMGG00000002318	srp9	100	67.442	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	81.395	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	81.395	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000020242	srp9	97	79.518	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	79.518	Pongo_abelii
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	79.070	Procavia_capensis
ENSPREG00000020242	srp9	71	75.410	ENSPCOG00000021743	-	98	75.410	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000020242	srp9	100	65.169	ENSPCOG00000012531	-	100	65.169	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	80.233	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSPNYG00000010536	srp9	100	97.674	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000020242	srp9	100	95.349	ENSPNAG00000008264	srp9	100	95.349	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	80.233	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	77.907	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000020242	srp9	100	77.907	ENSRROG00000028703	SRP9	100	77.907	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000020242	srp9	100	81.395	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	81.395	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000020242	srp9	100	87.209	ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	Scleropages_formosus
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSSMAG00000001318	srp9	100	97.674	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000020242	srp9	100	98.837	ENSSDUG00000008772	srp9	100	98.837	Seriola_dumerili
ENSPREG00000020242	srp9	87	97.333	ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000020242	srp9	100	60.465	ENSSPUG00000014436	SRP9	100	60.465	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	97.674	ENSSPAG00000017244	srp9	100	97.674	Stegastes_partitus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSSSCG00000031664	-	100	80.233	Sus_scrofa
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000020242	srp9	100	91.860	ENSTRUG00000024107	srp9	100	91.860	Takifugu_rubripes
ENSPREG00000020242	srp9	100	91.860	ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	79.070	Tupaia_belangeri
ENSPREG00000020242	srp9	71	77.049	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	77.049	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	80.233	Ursus_americanus
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	80.233	Ursus_maritimus
ENSPREG00000020242	srp9	71	77.049	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	77.049	Vicugna_pacos
ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	80.233	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000020242	srp9	100	98.837	ENSXCOG00000000662	srp9	100	98.837	Xiphophorus_couchianus
ENSPREG00000020242	srp9	100	98.837	ENSXMAG00000029514	srp9	100	98.837	Xiphophorus_maculatus