EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000020321 (Gene tree)
Gene ID: 103476515
Gene Symbol: rab1ab
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10394 bases
Position: chrLG15:1057485-1067878
Accession: 103476515
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000030015	MMR_HSR1	PF01926.23	9.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000030355	-	612	XM_008428925	ENSPREP00000030015	203 (aa)	XP_008427147	UPI0004A4C2C1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000020321	rab1ab	81	38.182	ENSPREG00000018287	KRAS	95	36.464
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ENSPREG00000020321	rab1ab	58	31.933	ENSPREG00000015645	arl4cb	61	31.933
ENSPREG00000020321	rab1ab	85	36.723	ENSPREG00000019341	hrasb	93	36.723
ENSPREG00000020321	rab1ab	96	36.181	ENSPREG00000017750	RAB7A	96	36.181
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ENSPREG00000020321	rab1ab	97	37.561	ENSPREG00000001832	rab9a	97	37.561
ENSPREG00000020321	rab1ab	58	32.231	ENSPREG00000020490	arl2	61	32.231
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	42.254	ENSPREG00000010154	rab4a	99	42.254
ENSPREG00000020321	rab1ab	99	48.077	ENSPREG00000017324	rab11al	96	48.077
ENSPREG00000020321	rab1ab	71	31.034	ENSPREG00000014738	-	72	30.612
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ENSPREG00000020321	rab1ab	83	46.199	ENSPREG00000009597	-	80	46.199
ENSPREG00000020321	rab1ab	96	39.175	ENSPREG00000021505	rab6a	93	39.175
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	90.640	ENSPREG00000004889	-	97	90.640
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.611	ENSPREG00000003616	rab1ba	100	92.611
ENSPREG00000020321	rab1ab	90	33.333	ENSPREG00000022509	rab23	98	32.020
ENSPREG00000020321	rab1ab	99	45.755	ENSPREG00000006336	-	96	45.755
ENSPREG00000020321	rab1ab	77	36.538	ENSPREG00000014761	rabl2	75	36.538
ENSPREG00000020321	rab1ab	57	33.607	ENSPREG00000000912	-	65	33.607
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ENSPREG00000020321	rab1ab	69	30.496	ENSPREG00000003821	arl3	58	30.496
ENSPREG00000020321	rab1ab	87	43.503	ENSPREG00000022167	-	79	47.742
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	42.029	ENSPREG00000017344	-	96	42.029
ENSPREG00000020321	rab1ab	83	49.112	ENSPREG00000010284	rab15	79	49.112
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ENSPREG00000020321	rab1ab	61	33.333	ENSPREG00000011615	arl4d	61	33.333
ENSPREG00000020321	rab1ab	96	38.776	ENSPREG00000009535	RAB41	92	38.776
ENSPREG00000020321	rab1ab	80	39.157	ENSPREG00000012522	-	83	39.157
ENSPREG00000020321	rab1ab	81	49.091	ENSPREG00000019783	RAB15	79	49.091
ENSPREG00000020321	rab1ab	83	46.199	ENSPREG00000007129	RAB39B	80	46.199
ENSPREG00000020321	rab1ab	58	33.898	ENSPREG00000004992	arl8a	61	33.898
ENSPREG00000020321	rab1ab	68	31.373	ENSPREG00000019667	arfrp1	61	31.373
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	39.908	ENSPREG00000013962	rab42a	100	39.908
ENSPREG00000020321	rab1ab	86	31.250	ENSPREG00000006055	rasl11a	75	31.250
ENSPREG00000020321	rab1ab	80	47.024	ENSPREG00000007017	zgc:101559	72	47.024
ENSPREG00000020321	rab1ab	86	49.714	ENSPREG00000005923	rab18a	78	47.449
ENSPREG00000020321	rab1ab	81	34.731	ENSPREG00000012803	rhebl1	90	34.731
ENSPREG00000020321	rab1ab	99	46.000	ENSPREG00000014634	rab30	97	46.000
ENSPREG00000020321	rab1ab	78	36.646	ENSPREG00000009813	rab34b	63	36.646
ENSPREG00000020321	rab1ab	81	34.132	ENSPREG00000010752	rheb	90	34.132
ENSPREG00000020321	rab1ab	80	47.239	ENSPREG00000010146	rab5c	89	45.000
ENSPREG00000020321	rab1ab	88	46.629	ENSPREG00000017337	rab25b	85	46.629
ENSPREG00000020321	rab1ab	58	32.203	ENSPREG00000004191	arl8ba	61	32.203
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	43.564	ENSPREG00000006119	rab25a	94	43.564
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ENSPREG00000020321	rab1ab	83	51.479	ENSPREG00000017487	rab12	69	51.479
ENSPREG00000020321	rab1ab	85	42.703	ENSPREG00000000880	rab33ba	78	42.703
ENSPREG00000020321	rab1ab	83	52.976	ENSPREG00000006357	rab11ba	60	52.976
ENSPREG00000020321	rab1ab	80	63.580	ENSPREG00000005323	si:dkey-16l2.16	77	63.580
ENSPREG00000020321	rab1ab	80	38.372	ENSPREG00000006970	rab9b	78	38.372
ENSPREG00000020321	rab1ab	58	30.328	ENSPREG00000021699	-	62	30.328
ENSPREG00000020321	rab1ab	55	37.500	ENSPREG00000016664	rap2b	93	36.641
ENSPREG00000020321	rab1ab	72	46.053	ENSPREG00000001864	-	66	46.053

Orthologs

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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSG00000174903	RAB1B	100	92.118	Homo_sapiens
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	99.015	ENSAPOG00000007746	rab1ab	100	99.015	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSAMEG00000017135	RAB1B	100	92.118	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.220	ENSACIG00000014625	-	100	91.220	Amphilophus_citrinellus
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	99.015	ENSAOCG00000006385	rab1ab	100	99.015	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	94.089	ENSAOCG00000003965	rab1ba	100	94.089	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	99.015	ENSAPEG00000001358	rab1ab	100	99.015	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	94.089	ENSAPEG00000012105	rab1ba	100	94.089	Amphiprion_percula
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	94.089	ENSATEG00000002479	rab1ba	100	94.089	Anabas_testudineus
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	94.089	ENSACLG00000013668	rab1ba	100	94.089	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	95.567	ENSAMXG00000032564	rab1ab	100	95.567	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020321	rab1ab	99	92.500	ENSAMXG00000003547	rab1ba	89	92.500	Astyanax_mexicanus
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.133	ENSCJAG00000047933	-	100	91.133	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCAFG00000012855	RAB1B	99	92.118	Canis_familiaris
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCAFG00020015406	-	100	92.118	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.626	ENSCHIG00000015549	RAB1B	100	91.626	Capra_hircus
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	91.919	ENSTSYG00000025638	RAB1B	99	90.244	Carlito_syrichta
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	91.919	ENSCAPG00000015495	RAB1B	98	91.919	Cavia_aperea
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCPOG00000014868	RAB1B	100	92.118	Cavia_porcellus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCCAG00000021540	RAB1B	100	92.118	Cebus_capucinus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCATG00000002342	RAB1B	100	92.118	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCLAG00000015776	RAB1B	100	92.118	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020321	rab1ab	69	99.286	ENSCSAG00000014775	-	97	99.286	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	91.919	ENSCSAG00000008145	RAB1B	88	91.919	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCPBG00000022446	RAB1B	100	92.118	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	87.685	ENSCING00000023081	-	99	87.685	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	87.685	ENSCSAVG00000009147	-	99	87.685	Ciona_savignyi
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCANG00000042299	RAB1B	100	92.118	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCGRG00001014956	Rab1b	100	92.118	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSCGRG00000015564	Rab1b	100	92.118	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.611	ENSCSEG00000018732	rab1ba	100	92.611	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.133	ENSCSEG00000020977	-	99	91.133	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.626	ENSCVAG00000022799	-	100	91.626	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	96.098	ENSCVAG00000022585	-	100	96.098	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	94.118	ENSDARG00000029663	rab1ab	100	94.118	Danio_rerio
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	90.148	ENSDARG00000056479	rab1bb	100	90.148	Danio_rerio
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	93.596	ENSDARG00000058044	rab1ba	100	93.596	Danio_rerio
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.611	ENSDARG00000052263	rab1aa	100	92.611	Danio_rerio
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.611	ENSDORG00000002511	Rab1b	100	92.611	Dipodomys_ordii
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ENSPREG00000020321	rab1ab	100	91.626	ENSTTRG00000014408	RAB1B	100	91.626	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.118	ENSUAMG00000021114	RAB1B	100	92.118	Ursus_americanus
ENSPREG00000020321	rab1ab	99	90.594	ENSUMAG00000011180	RAB1B	90	90.594	Ursus_maritimus
ENSPREG00000020321	rab1ab	98	91.919	ENSVVUG00000027023	-	90	91.919	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	95.567	ENSXETG00000014011	rab1a	100	95.567	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000020321	rab1ab	94	90.052	ENSXCOG00000010770	-	76	90.052	Xiphophorus_couchianus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	98.522	ENSXCOG00000013842	rab1ab	100	98.522	Xiphophorus_couchianus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	92.611	ENSXMAG00000022299	rab1ba	100	92.611	Xiphophorus_maculatus
ENSPREG00000020321	rab1ab	100	99.015	ENSXMAG00000005757	rab1ab	100	99.015	Xiphophorus_maculatus