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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000020672 (Gene tree)
Gene ID: 103481996
Gene Symbol: aco2
Alias: cb1017|wu:fa10e03|wu:fb69g04|wu:fc20c11
Full Name: aconitate hydratase%2C mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12891 bases
Position: chrLG19:23373174-23386064
Accession: 103481996
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000030518	Aconitase	PF00330.20	3.2e-150	1	1
ENSPREP00000030535	Aconitase	PF00330.20	3.2e-150	1	1
ENSPREP00000030550	Aconitase	PF00330.20	2.3e-137	1	1
ENSPREP00000030550	Aconitase_C	PF00694.19	2.8e-44	1	1
ENSPREP00000030518	Aconitase_C	PF00694.19	3.7e-44	1	1
ENSPREP00000030535	Aconitase_C	PF00694.19	3.7e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000030895	-	1947	-	ENSPREP00000030550	648 (aa)	-	-
ENSPRET00000030880	-	5365	-	ENSPREP00000030535	783 (aa)	-	-
ENSPRET00000030863	-	5362	XM_008437869	ENSPREP00000030518	782 (aa)	XP_008436091	UPI0004A4503D

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
pret00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
pret01100	Metabolic pathways	KEGG
pret01200	Carbon metabolism	KEGG
pret01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
pret01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000020672	aco2	87	30.645	ENSPREG00000021791	aco1	75	30.645
ENSPREG00000020672	aco2	99	85.156	ENSPREG00000017594	ACO2	100	85.019

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.156	ENSG00000100412	ACO2	100	79.156	Homo_sapiens
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.734	ENSAPOG00000017786	aco2	100	93.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.438	ENSAPOG00000011484	ACO2	100	87.324	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020672	aco2	100	76.952	ENSAMEG00000015641	ACO2	100	76.952	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000020672	aco2	100	94.290	ENSACIG00000021636	aco2	100	94.290	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.981	ENSAOCG00000020887	aco2	100	93.981	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.594	ENSAOCG00000019100	ACO2	100	87.836	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.862	ENSAPEG00000020171	aco2	100	93.862	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.438	ENSAPEG00000012427	ACO2	100	87.708	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.375	ENSATEG00000008001	ACO2	100	88.860	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.673	ENSATEG00000006397	aco2	100	93.673	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.673	ENSATEG00000007473	aco2	100	93.673	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.563	ENSAPLG00000005198	ACO2	99	79.151	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.156	ENSACAG00000004677	-	99	79.770	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.219	ENSANAG00000029281	ACO2	99	78.745	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.095	ENSACLG00000019179	aco2	100	93.095	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020672	aco2	99	68.462	ENSAMXG00000015485	ACO2	99	70.256	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020672	aco2	100	89.386	ENSAMXG00000008808	aco2	100	89.386	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.312	ENSBTAG00000006429	ACO2	99	79.898	Bos_taurus
ENSPREG00000020672	aco2	99	74.961	WBGene00000041	aco-2	99	76.211	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000020672	aco2	98	80.220	ENSCJAG00000005004	ACO2	99	80.315	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSCAFG00000001075	ACO2	99	79.668	Canis_familiaris
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSCAFG00020001976	ACO2	99	79.668	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.312	ENSCHIG00000007877	ACO2	99	80.026	Capra_hircus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.795	ENSTSYG00000001084	ACO2	100	79.795	Carlito_syrichta
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.031	ENSCAPG00000017225	ACO2	100	79.332	Cavia_aperea
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.540	ENSCPOG00000012642	ACO2	100	79.540	Cavia_porcellus
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.000	ENSCCAG00000028378	ACO2	98	80.666	Cebus_capucinus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.412	ENSCATG00000030437	ACO2	100	79.412	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020672	aco2	100	52.174	ENSCATG00000000038	-	100	52.174	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020672	aco2	93	63.333	ENSCATG00000026864	-	100	63.333	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020672	aco2	100	80.051	ENSCLAG00000016998	ACO2	100	80.051	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.412	ENSCSAG00000005807	ACO2	100	79.412	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000020672	aco2	70	76.613	ENSCHOG00000003549	ACO2	81	76.613	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.668	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000020672	aco2	64	78.502	ENSCING00000008967	-	99	78.502	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000020672	aco2	99	78.091	ENSCSAVG00000007584	-	99	79.442	Ciona_savignyi
ENSPREG00000020672	aco2	99	76.992	ENSCANG00000018904	ACO2	94	78.983	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSCGRG00001023335	Aco2	100	79.668	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020672	aco2	88	85.165	ENSCGRG00001009672	-	92	80.065	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSCGRG00000005122	Aco2	100	79.668	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020672	aco2	88	85.165	ENSCGRG00000002318	-	94	78.328	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020672	aco2	100	88.156	ENSCSEG00000020501	aco2	100	88.156	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020672	aco2	99	87.656	ENSCSEG00000006701	ACO2	100	86.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.688	ENSCVAG00000010923	ACO2	100	89.142	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020672	aco2	98	89.870	ENSCVAG00000006081	aco2	99	89.870	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.062	ENSDARG00000007294	aco2	99	88.988	Danio_rerio
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.125	ENSDNOG00000018156	ACO2	98	72.597	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.343	ENSDORG00000002209	Aco2	99	80.392	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000020672	aco2	99	74.062	FBgn0010100	Acon	96	73.491	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000020672	aco2	99	72.144	FBgn0037862	CG4706	98	70.337	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000020672	aco2	81	81.792	ENSETEG00000010742	ACO2	81	81.792	Echinops_telfairi
ENSPREG00000020672	aco2	83	86.076	ENSEBUG00000009201	aco2	96	86.076	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000020672	aco2	100	80.051	ENSEASG00005001546	ACO2	98	80.051	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.923	ENSECAG00000023762	ACO2	98	79.923	Equus_caballus
ENSPREG00000020672	aco2	99	76.947	ENSEEUG00000010201	ACO2	93	78.976	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000020672	aco2	99	87.207	ENSELUG00000019769	aco2	100	86.957	Esox_lucius
ENSPREG00000020672	aco2	99	86.556	ENSELUG00000007787	ACO2	100	86.556	Esox_lucius
ENSPREG00000020672	aco2	99	77.029	ENSFCAG00000018526	ACO2	100	77.029	Felis_catus
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.875	ENSFALG00000011957	ACO2	99	80.857	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.844	ENSFDAG00000010448	ACO2	99	79.385	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000020672	aco2	100	96.292	ENSFHEG00000012709	aco2	100	96.292	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.062	ENSFHEG00000020556	ACO2	100	89.008	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.590	ENSGMOG00000013297	aco2	100	88.590	Gadus_morhua
ENSPREG00000020672	aco2	99	76.953	ENSGMOG00000001946	-	100	76.953	Gadus_morhua
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.284	ENSGALG00000011950	ACO2	99	79.284	Gallus_gallus
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.750	ENSGAFG00000010889	ACO2	100	87.196	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020672	aco2	100	98.210	ENSGAFG00000008252	aco2	100	98.210	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.757	ENSGACG00000004686	aco2	99	89.757	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.923	ENSGAGG00000017500	ACO2	99	79.923	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000020672	aco2	88	67.857	ENSGGOG00000037860	-	99	66.584	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.028	ENSGGOG00000001107	ACO2	100	79.028	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.095	ENSHBUG00000004106	aco2	100	93.095	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.668	ENSHGLG00000015463	Aco2	100	79.668	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.284	ENSHGLG00100010294	ACO2	100	79.284	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020672	aco2	100	92.072	ENSHCOG00000010190	aco2	100	92.072	Hippocampus_comes
ENSPREG00000020672	aco2	99	88.281	ENSHCOG00000006890	ACO2	100	87.944	Hippocampus_comes
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.954	ENSIPUG00000001101	aco2	100	89.954	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.540	ENSSTOG00000016210	ACO2	100	79.540	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000020672	aco2	88	77.178	ENSJJAG00000014029	Aco2	98	77.178	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000020672	aco2	55	95.161	ENSKMAG00000021995	aco2	90	95.161	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.219	ENSKMAG00000014823	ACO2	100	88.220	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020672	aco2	100	91.204	ENSLBEG00000002060	aco2	100	91.204	Labrus_bergylta
ENSPREG00000020672	aco2	92	76.080	ENSLACG00000011854	ACO2	100	77.165	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000020672	aco2	89	75.606	ENSLOCG00000011607	aco2	98	75.606	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000020672	aco2	99	80.000	ENSLAFG00000006030	ACO2	100	79.513	Loxodonta_africana
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.412	ENSMFAG00000043571	ACO2	100	79.412	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000020672	aco2	100	62.158	ENSMFAG00000041445	-	100	62.158	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.412	ENSMMUG00000001454	ACO2	100	79.412	Macaca_mulatta
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.284	ENSMNEG00000044522	ACO2	100	79.284	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.412	ENSMLEG00000031603	ACO2	100	79.412	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000020672	aco2	100	61.810	ENSMLEG00000042289	-	100	61.810	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000020672	aco2	100	94.290	ENSMAMG00000003762	aco2	100	94.290	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.844	ENSMAMG00000007378	ACO2	100	90.080	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020672	aco2	100	93.095	ENSMZEG00005019194	aco2	100	93.095	Maylandia_zebra
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.719	ENSMGAG00000012110	ACO2	99	79.279	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.540	ENSMAUG00000007598	Aco2	100	79.540	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000020672	aco2	100	72.603	ENSMICG00000013529	ACO2	100	72.603	Microcebus_murinus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.923	ENSMOCG00000008387	Aco2	100	79.923	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000020672	aco2	100	92.438	ENSMMOG00000003639	aco2	100	92.438	Mola_mola
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.531	ENSMMOG00000002702	ACO2	100	88.604	Mola_mola
ENSPREG00000020672	aco2	99	79.375	ENSMODG00000016560	ACO2	99	79.507	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000020672	aco2	99	89.375	ENSMALG00000013359	ACO2	100	88.860	Monopterus_albus
ENSPREG00000020672	aco2	99	93.114	ENSMALG00000008744	aco2	100	93.020	Monopterus_albus
ENSPREG00000020672	aco2	100	79.795	ENSMUSG00000022477	Aco2	100	87.113	Mus_musculus
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