EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000020705 (Gene tree)
Gene ID: 103473358
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22085 bases
Position: chrLG12:6192212-6214296
Accession: 103473358
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000030610	IBN_N	PF03810.19	1.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000030956	-	2714	XM_008423535	ENSPREP00000030610	892 (aa)	XP_008421757	UPI0004A30A77

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000020705's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000020705's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	86.727	ENSPREG00000000415	TNPO2	99	86.952
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	86.839	ENSPREG00000001121	TNPO2	99	86.839

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.982	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.982	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.333	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.444	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.778	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.778	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.870	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.870	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.870	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.870	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.646	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.646	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.596	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.274	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	83.072	ENSANAG00000025351	-	99	83.072	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.825	ENSANAG00000022453	-	99	92.825	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	59.956	ENSANAG00000027118	-	99	60.288	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	95.291	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.291	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.625	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.161	Bos_taurus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.937	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.248	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.248	Canis_familiaris
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	90.807	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.807	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.049	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.049	Capra_hircus
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	92.182	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.182	Carlito_syrichta
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.825	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.825	Cebus_capucinus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.274	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.049	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.049	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.274	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000020705	tnpo1	94	81.213	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.737	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.834	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	76.260	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.260	Ciona_savignyi
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.274	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.161	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.349	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.349	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.300	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.300	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.318	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.318	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.507	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.283	Danio_rerio
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	87.486	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.039	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000020705	tnpo1	93	93.261	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.261	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	58.493	FBgn0035693	CG8219	99	58.268	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000020705	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSPREG00000020705	tnpo1	94	85.629	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.511	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.274	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.274	Equus_caballus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	88.998	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.344	Esox_lucius
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.274	Felis_catus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.722	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.722	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.937	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.430	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.430	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.281	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	Gadus_morhua
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.161	Gallus_gallus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.543	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.543	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.300	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.300	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.946	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.946	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	78.475	ENSGGOG00000022535	-	98	78.475	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.274	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.085	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.085	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.825	ENSHGLG00000000970	-	99	92.825	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020705	tnpo1	97	72.854	ENSHGLG00100000963	-	99	72.158	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	92.890	ENSHGLG00100017090	-	99	92.890	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.498	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.498	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.085	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.085	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020705	tnpo1	91	93.966	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.966	Labrus_bergylta
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	87.355	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.355	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.731	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.731	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	97	92.627	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.627	Loxodonta_africana
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.274	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.243	Macaca_mulatta
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.274	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.274	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.870	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.870	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.637	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.637	Maylandia_zebra
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	89.686	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.686	Microcebus_murinus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.161	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.907	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	Mola_mola
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	94.255	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.255	Monodelphis_domestica
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.300	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.300	Monopterus_albus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.258	Mus_caroli
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.325	Mus_musculus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.049	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	Mus_pahari
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.258	Mus_spretus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.274	Mustela_putorius_furo
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.031	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.031	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.274	Nannospalax_galili
ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.649	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.649	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.274	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000020705	tnpo1	90	88.139	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	Ochotona_princeps
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.825	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.825	Octodon_degus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.325	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.325	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000020705	tnpo1	92	94.161	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.161	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	87.063	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.063	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.507	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.507	Oryzias_latipes
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	96.850	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.850	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	97.188	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.188	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	97.188	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.188	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.274	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.265	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.161	Ovis_aries
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.274	Pan_paniscus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.274	Panthera_pardus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.274	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000020705	tnpo1	94	82.320	ENSPTRG00000047731	-	100	82.320	Pan_troglodytes
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.274	Pan_troglodytes
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.274	Papio_anubis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	90.135	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.695	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.722	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.722	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.729	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.505	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.349	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.349	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.946	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.946	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	99.216	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	99.216	Poecilia_formosa
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	99.216	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	99.216	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	99.215	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	99.215	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.161	Pongo_abelii
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.386	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.386	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.274	Pteropus_vampyrus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.085	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	97.085	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.283	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.283	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.386	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	93.386	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.274	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	93.274	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	92.937	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.932	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.932	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.188	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.188	Scleropages_formosus
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	96.970	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.970	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.758	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.758	Seriola_dumerili
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.646	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	97.646	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.386	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.386	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.094	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.094	Stegastes_partitus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.274	Sus_scrofa
ENSPREG00000020705	tnpo1	99	91.759	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.759	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.188	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.188	Takifugu_rubripes
ENSPREG00000020705	tnpo1	69	91.424	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.424	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000020705	tnpo1	87	94.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	Tupaia_belangeri
ENSPREG00000020705	tnpo1	96	89.732	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.732	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	93.274	Ursus_maritimus
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	89.013	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	88.565	Vicugna_pacos
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	93.274	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.489	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.489	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.655	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.655	Xiphophorus_maculatus